More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3280 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3280  5'-3' exonuclease  100 
 
 		 313 aa  607  9.999999999999999e-173  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3511  5'-3' exonuclease  66.13 
 
 		 319 aa  369  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0590  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  65.4 
 
 		 326 aa  365  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649096  hitchhiker  0.00498454 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5853  DNA polymerase I  58.63 
 
 		 306 aa  335  3.9999999999999995e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1887  5'-3' exonuclease  61.09 
 
 		 320 aa  332  4e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2443  5'-3' exonuclease  55.02 
 
 		 315 aa  315  6e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185668 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21890  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  54.26 
 
 		 320 aa  305  8.000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.249283  normal  0.223651 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14040  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  58.84 
 
 		 316 aa  301  7.000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00209406  normal  0.396223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2322  5'-3' exonuclease  54.29 
 
 		 312 aa  298  8e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000272969  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2004  5'-3' exonuclease  54.98 
 
 		 312 aa  298  9e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2257  5'-3' exonuclease  55.56 
 
 		 349 aa  297  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000970599  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2515  5'-3' exonuclease  52.38 
 
 		 316 aa  295  9e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219771  normal  0.69771 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2694  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  58.58 
 
 		 305 aa  294  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0181441  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2478  5'-3' exonuclease  52.38 
 
 		 316 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2523  5'-3' exonuclease  52.38 
 
 		 316 aa  294  1e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.017521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3438  5'-3' exonuclease  53.94 
 
 		 323 aa  293  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12125  5'-3' exonuclease  53.67 
 
 		 393 aa  292  4e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.965773  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2257  5'-3' exonuclease  53.87 
 
 		 315 aa  287  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62484  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2659  5'-3' exonuclease  55.37 
 
 		 301 aa  286  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154679  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4171  5'-3' exonuclease  57.32 
 
 		 318 aa  285  5e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000586174  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1774  5'-3' exonuclease  53.97 
 
 		 315 aa  284  2.0000000000000002e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000265308 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2375  5'-3' exonuclease  53.23 
 
 		 353 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0822086  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3097  5'-3' exonuclease  51.59 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501731  normal  0.23354 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1819  5'-3' exonuclease  56.77 
 
 		 314 aa  277  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2472  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  51.54 
 
 		 347 aa  274  1.0000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2947  5'-3' exonuclease  49.25 
 
 		 333 aa  271  1e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176217  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2275  5'-3' exonuclease  54.29 
 
 		 327 aa  255  5e-67  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000000344682  hitchhiker  0.000172307 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3173  5'-3' exonuclease  47.44 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0156047  hitchhiker  0.000000000759787 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2173  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  46.65 
 
 		 320 aa  233  3e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.192116  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1207  5'-3' exonuclease  49.84 
 
 		 324 aa  228  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  39.83 
 
 		 906 aa  152  8e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  37.5 
 
 		 480 aa  149  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  34.85 
 
 		 885 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  35.16 
 
 		 920 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  35.16 
 
 		 920 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  36.69 
 
 		 929 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  38.79 
 
 		 884 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1802  DNA polymerase I  38.98 
 
 		 894 aa  146  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000838871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  39.22 
 
 		 909 aa  145  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0617  DNA-directed DNA polymerase  36.64 
 
 		 1025 aa  145  7.0000000000000006e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1080  DNA polymerase I  40.38 
 
 		 886 aa  145  8.000000000000001e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  34.5 
 
 		 917 aa  144  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  38.46 
 
 		 893 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1220  ribonuclease H  37.71 
 
 		 484 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  38.79 
 
 		 908 aa  143  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  34.77 
 
 		 870 aa  143  4e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  34.07 
 
 		 890 aa  143  4e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  39.91 
 
 		 904 aa  142  5e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  41.41 
 
 		 901 aa  142  9e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  39.39 
 
 		 905 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  36.53 
 
 		 905 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  32.75 
 
 		 878 aa  140  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12970  DNA polymerase I  38.56 
 
 		 904 aa  138  2e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199065  normal  0.445592 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2063  DNA polymerase I  38.98 
 
 		 955 aa  138  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045949  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  40.77 
 
 		 910 aa  137  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  33.11 
 
 		 866 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0949  ribonuclease H  37.73 
 
 		 482 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1012  5'-3' exonuclease, putative  29.31 
 
 		 292 aa  136  4e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.667651  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  37.93 
 
 		 929 aa  136  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  37.8 
 
 		 899 aa  136  5e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2285  DNA polymerase I  36.18 
 
 		 1273 aa  136  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153285  hitchhiker  0.0000116157 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  37.29 
 
 		 899 aa  136  6.0000000000000005e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  34.53 
 
 		 910 aa  136  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  37.44 
 
 		 949 aa  135  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0738  DNA polymerase I  36.29 
 
 		 955 aa  135  7.000000000000001e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0959  DNA polymerase I  35.19 
 
 		 928 aa  135  9e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.75162 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  31.37 
 
 		 875 aa  135  9e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1938  DNA polymerase I  30.07 
 
 		 945 aa  135  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.632824  normal  0.0549057 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  34.19 
 
 		 843 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  32.79 
 
 		 866 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  34.44 
 
 		 895 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  34.44 
 
 		 876 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  33.97 
 
 		 912 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  34.44 
 
 		 876 aa  134  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0774  ribonuclease H  36.05 
 
 		 474 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.245945  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5532  DNA polymerase I  36.44 
 
 		 888 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1148  DNA-directed DNA polymerase  37.41 
 
 		 937 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  0.433626 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  36.15 
 
 		 912 aa  132  9e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  37.66 
 
 		 902 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0825  5'-3' exonuclease  36.06 
 
 		 474 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5859  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  37.87 
 
 		 289 aa  131  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  34.3 
 
 		 891 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3590  DNA polymerase I  33.88 
 
 		 936 aa  130  3e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  36.24 
 
 		 939 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0136  DNA polymerase I  32.5 
 
 		 982 aa  129  6e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.3801  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1236  DNA polymerase I  35.12 
 
 		 976 aa  129  6e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  32.26 
 
 		 896 aa  129  6e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  33.83 
 
 		 878 aa  129  8.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  31.85 
 
 		 877 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  33.09 
 
 		 891 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3006  DNA polymerase I  36.02 
 
 		 889 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  34.43 
 
 		 868 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  30.03 
 
 		 877 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  36.79 
 
 		 899 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3602  5'-3' exonuclease  35.04 
 
 		 299 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1969  DNA polymerase I  36.48 
 
 		 908 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  36.79 
 
 		 899 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3702  5'-3' exonuclease family protein  31.14 
 
 		 288 aa  127  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00175288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  36.99 
 
 		 945 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  31.85 
 
 		 883 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>