More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1819 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1819  5'-3' exonuclease  100 
 
 		 314 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5853  DNA polymerase I  71.04 
 
 		 306 aa  405  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2322  5'-3' exonuclease  67.21 
 
 		 312 aa  381  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000272969  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0590  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  59.87 
 
 		 326 aa  325  7e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649096  hitchhiker  0.00498454 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3511  5'-3' exonuclease  58.84 
 
 		 319 aa  324  1e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2375  5'-3' exonuclease  57.33 
 
 		 353 aa  318  9e-86  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0822086  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2257  5'-3' exonuclease  56.67 
 
 		 315 aa  316  3e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62484  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2257  5'-3' exonuclease  56.91 
 
 		 349 aa  311  9e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000970599  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3280  5'-3' exonuclease  57.1 
 
 		 313 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2694  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  59.87 
 
 		 305 aa  300  1e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0181441  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4171  5'-3' exonuclease  57.56 
 
 		 318 aa  299  5e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000586174  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1887  5'-3' exonuclease  55.38 
 
 		 320 aa  298  7e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21890  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  55.34 
 
 		 320 aa  298  8e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.249283  normal  0.223651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2443  5'-3' exonuclease  52.44 
 
 		 315 aa  296  4e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185668 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1207  5'-3' exonuclease  57.38 
 
 		 324 aa  289  3e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14040  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  55.05 
 
 		 316 aa  288  8e-77  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00209406  normal  0.396223 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3173  5'-3' exonuclease  51.67 
 
 		 303 aa  285  5e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0156047  hitchhiker  0.000000000759787 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2659  5'-3' exonuclease  52.33 
 
 		 301 aa  278  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154679  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2275  5'-3' exonuclease  58.36 
 
 		 327 aa  276  5e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000000344682  hitchhiker  0.000172307 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12125  5'-3' exonuclease  49.37 
 
 		 393 aa  268  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.965773  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2947  5'-3' exonuclease  48.5 
 
 		 333 aa  267  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176217  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2004  5'-3' exonuclease  49.68 
 
 		 312 aa  265  7e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2472  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  48.45 
 
 		 347 aa  265  7e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1774  5'-3' exonuclease  51.8 
 
 		 315 aa  263  4e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000265308 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3097  5'-3' exonuclease  49.2 
 
 		 321 aa  258  9e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501731  normal  0.23354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2478  5'-3' exonuclease  47.91 
 
 		 316 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2515  5'-3' exonuclease  47.91 
 
 		 316 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219771  normal  0.69771 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2523  5'-3' exonuclease  47.91 
 
 		 316 aa  256  3e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.017521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3438  5'-3' exonuclease  48.43 
 
 		 323 aa  255  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2173  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  48.22 
 
 		 320 aa  254  9e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.192116  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  40.53 
 
 		 949 aa  176  6e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  35.97 
 
 		 885 aa  172  6.999999999999999e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  38.56 
 
 		 920 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  38.56 
 
 		 920 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  39.22 
 
 		 904 aa  171  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  38.24 
 
 		 929 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  44.54 
 
 		 893 aa  170  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  37.66 
 
 		 909 aa  168  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  37.83 
 
 		 908 aa  165  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  40.35 
 
 		 902 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  39.02 
 
 		 895 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  37.99 
 
 		 878 aa  160  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  44.18 
 
 		 910 aa  159  4e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  37.12 
 
 		 875 aa  159  6e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  42.34 
 
 		 906 aa  159  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  36.79 
 
 		 917 aa  159  6e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  39.69 
 
 		 843 aa  159  8e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  40.39 
 
 		 901 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  40.22 
 
 		 899 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  35.97 
 
 		 940 aa  154  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0617  DNA-directed DNA polymerase  35.74 
 
 		 1025 aa  154  2e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  37.97 
 
 		 905 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  36.78 
 
 		 930 aa  153  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1802  DNA polymerase I  38.33 
 
 		 894 aa  153  4e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000838871 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  41.67 
 
 		 899 aa  153  4e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1080  DNA polymerase I  40.36 
 
 		 886 aa  152  8e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2966  DNA-directed DNA polymerase  38.86 
 
 		 901 aa  152  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  40 
 
 		 945 aa  151  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  35.95 
 
 		 884 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  40.43 
 
 		 911 aa  151  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  37.44 
 
 		 894 aa  147  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3769  DNA polymerase I  38.33 
 
 		 908 aa  145  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  40.81 
 
 		 480 aa  145  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  39.65 
 
 		 912 aa  145  8.000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  37.72 
 
 		 929 aa  144  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  34.32 
 
 		 912 aa  145  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  31.69 
 
 		 888 aa  145  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  35.88 
 
 		 912 aa  144  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  35.02 
 
 		 901 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5532  DNA polymerase I  35.84 
 
 		 888 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3317  DNA polymerase I  36.84 
 
 		 922 aa  143  3e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397865  normal  0.106648 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1325  DNA polymerase I  34.41 
 
 		 957 aa  143  4e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2063  DNA polymerase I  36.13 
 
 		 955 aa  143  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045949  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0959  DNA polymerase I  39.04 
 
 		 928 aa  143  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.75162 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  35.84 
 
 		 904 aa  143  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12970  DNA polymerase I  39.73 
 
 		 904 aa  143  5e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199065  normal  0.445592 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2669  DNA polymerase I  36.84 
 
 		 922 aa  143  5e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48078  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  34.11 
 
 		 934 aa  142  6e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  31.18 
 
 		 872 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1220  ribonuclease H  37.2 
 
 		 484 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3006  DNA polymerase I  39.74 
 
 		 889 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3109  DNA polymerase I  31.93 
 
 		 972 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3011  DNA polymerase I  31.93 
 
 		 972 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1969  DNA polymerase I  36.1 
 
 		 908 aa  140  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  29.47 
 
 		 890 aa  140  3e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  34.57 
 
 		 870 aa  140  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0949  ribonuclease H  41.7 
 
 		 482 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  38.77 
 
 		 891 aa  139  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  33.55 
 
 		 928 aa  139  8.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1226  DNA polymerase I  33.21 
 
 		 893 aa  138  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.826859 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  36.56 
 
 		 905 aa  138  1e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  39.91 
 
 		 910 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0738  DNA polymerase I  36.8 
 
 		 955 aa  137  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  32.79 
 
 		 930 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  31.37 
 
 		 896 aa  137  3.0000000000000003e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  33.87 
 
 		 868 aa  136  4e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  34.96 
 
 		 988 aa  136  4e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  30.52 
 
 		 896 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1930  DNA polymerase I  37.08 
 
 		 927 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173956  normal  0.0298694 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  34.51 
 
 		 956 aa  135  9e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>