More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2257 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2257  5'-3' exonuclease  100 
 
 		 349 aa  684    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000970599  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21890  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  68.55 
 
 		 320 aa  427  1e-118  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.249283  normal  0.223651 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12125  5'-3' exonuclease  57.1 
 
 		 393 aa  342  4e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.965773  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2515  5'-3' exonuclease  56.69 
 
 		 316 aa  337  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219771  normal  0.69771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2478  5'-3' exonuclease  56.37 
 
 		 316 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2523  5'-3' exonuclease  56.37 
 
 		 316 aa  336  3.9999999999999995e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.017521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2472  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  58.46 
 
 		 347 aa  335  5.999999999999999e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3097  5'-3' exonuclease  55.35 
 
 		 321 aa  329  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501731  normal  0.23354 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5853  DNA polymerase I  60.2 
 
 		 306 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3438  5'-3' exonuclease  55.52 
 
 		 323 aa  325  5e-88  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2173  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  53.73 
 
 		 320 aa  315  9.999999999999999e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.192116  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2257  5'-3' exonuclease  54.94 
 
 		 315 aa  306  5.0000000000000004e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62484  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0590  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  57.01 
 
 		 326 aa  305  7e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649096  hitchhiker  0.00498454 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2322  5'-3' exonuclease  54.55 
 
 		 312 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000272969  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2947  5'-3' exonuclease  50.9 
 
 		 333 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176217  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2375  5'-3' exonuclease  54.18 
 
 		 353 aa  301  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0822086  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3280  5'-3' exonuclease  55.56 
 
 		 313 aa  297  2e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1887  5'-3' exonuclease  55.66 
 
 		 320 aa  295  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3511  5'-3' exonuclease  53.46 
 
 		 319 aa  294  2e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1819  5'-3' exonuclease  54.93 
 
 		 314 aa  281  8.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2443  5'-3' exonuclease  48.89 
 
 		 315 aa  269  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185668 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2004  5'-3' exonuclease  50.16 
 
 		 312 aa  268  7e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14040  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  51.92 
 
 		 316 aa  263  4e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00209406  normal  0.396223 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4171  5'-3' exonuclease  51.24 
 
 		 318 aa  259  4e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000586174  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2659  5'-3' exonuclease  51.94 
 
 		 301 aa  258  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154679  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2694  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  59.13 
 
 		 305 aa  256  4e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0181441  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3173  5'-3' exonuclease  48.85 
 
 		 303 aa  239  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0156047  hitchhiker  0.000000000759787 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1774  5'-3' exonuclease  47.95 
 
 		 315 aa  238  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000265308 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2275  5'-3' exonuclease  52 
 
 		 327 aa  238  1e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000000344682  hitchhiker  0.000172307 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1207  5'-3' exonuclease  48.01 
 
 		 324 aa  222  8e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  37.74 
 
 		 917 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  37.46 
 
 		 920 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  37.46 
 
 		 920 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  41.18 
 
 		 893 aa  151  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  37.14 
 
 		 929 aa  151  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  40.79 
 
 		 906 aa  151  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  32.17 
 
 		 875 aa  150  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  41.26 
 
 		 910 aa  150  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  36 
 
 		 908 aa  149  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  40.66 
 
 		 949 aa  149  7e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2019  DNA polymerase I  35.38 
 
 		 885 aa  149  8e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.206031  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  37.46 
 
 		 909 aa  149  8e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  36.82 
 
 		 895 aa  149  9e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  41.99 
 
 		 904 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  33.86 
 
 		 891 aa  147  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  39.84 
 
 		 905 aa  147  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2846  DNA polymerase I  35.1 
 
 		 943 aa  144  2e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.411951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  32.24 
 
 		 892 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  33.11 
 
 		 876 aa  144  3e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  37.68 
 
 		 902 aa  144  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  32.37 
 
 		 892 aa  143  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  33.02 
 
 		 892 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  33.46 
 
 		 878 aa  140  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  35.47 
 
 		 929 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  34.56 
 
 		 891 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  33.11 
 
 		 876 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  33.11 
 
 		 876 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  39.74 
 
 		 905 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  32.05 
 
 		 892 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  40.68 
 
 		 945 aa  139  6e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  32.68 
 
 		 888 aa  139  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  39.92 
 
 		 912 aa  139  7e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  31.27 
 
 		 891 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  36.47 
 
 		 480 aa  138  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  31.27 
 
 		 891 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  31.27 
 
 		 891 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  32.25 
 
 		 878 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  38.14 
 
 		 899 aa  137  2e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  32.25 
 
 		 870 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1220  ribonuclease H  36.67 
 
 		 484 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  33.57 
 
 		 888 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2285  DNA polymerase I  34.44 
 
 		 1273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153285  hitchhiker  0.0000116157 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  34 
 
 		 912 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  38.14 
 
 		 899 aa  137  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  32.57 
 
 		 876 aa  137  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  39.91 
 
 		 911 aa  136  4e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1969  DNA polymerase I  34.93 
 
 		 908 aa  136  5e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2966  DNA-directed DNA polymerase  32.92 
 
 		 901 aa  136  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254596  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl582  DNA polymerase I  29.49 
 
 		 895 aa  135  8e-31  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0335993  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  34.31 
 
 		 884 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0825  5'-3' exonuclease  33.55 
 
 		 474 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3109  DNA polymerase I  33.21 
 
 		 972 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3011  DNA polymerase I  33.21 
 
 		 972 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1504  DNA polymerase I  33.77 
 
 		 915 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  33.68 
 
 		 911 aa  134  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  34.08 
 
 		 885 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  30.39 
 
 		 877 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  32.01 
 
 		 877 aa  134  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  34.82 
 
 		 901 aa  134  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0949  ribonuclease H  36.3 
 
 		 482 aa  134  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5859  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  38.08 
 
 		 289 aa  133  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  31.54 
 
 		 880 aa  133  3.9999999999999996e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  30.07 
 
 		 877 aa  133  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  32.9 
 
 		 944 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  31.58 
 
 		 896 aa  133  5e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  30.94 
 
 		 850 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  31.65 
 
 		 877 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  31.65 
 
 		 877 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0080  DNA polymerase I  29.37 
 
 		 944 aa  132  9e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.432939  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  31.56 
 
 		 873 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>