More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0590 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0590  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  100 
 
 		 326 aa  616  1e-175  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649096  hitchhiker  0.00498454 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3511  5'-3' exonuclease  71.7 
 
 		 319 aa  431  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3280  5'-3' exonuclease  66.03 
 
 		 313 aa  377  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1887  5'-3' exonuclease  63.09 
 
 		 320 aa  338  9e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5853  DNA polymerase I  58.28 
 
 		 306 aa  332  4e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2322  5'-3' exonuclease  57.81 
 
 		 312 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000272969  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2257  5'-3' exonuclease  58.28 
 
 		 349 aa  317  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000970599  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14040  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  58.6 
 
 		 316 aa  311  1e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00209406  normal  0.396223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2257  5'-3' exonuclease  57.1 
 
 		 315 aa  310  2e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62484  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21890  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  55.35 
 
 		 320 aa  308  1.0000000000000001e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.249283  normal  0.223651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2443  5'-3' exonuclease  56.05 
 
 		 315 aa  306  3e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185668 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2659  5'-3' exonuclease  57.79 
 
 		 301 aa  306  3e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154679  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1819  5'-3' exonuclease  60.19 
 
 		 314 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2375  5'-3' exonuclease  55.48 
 
 		 353 aa  299  5e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0822086  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2004  5'-3' exonuclease  53.65 
 
 		 312 aa  293  3e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12125  5'-3' exonuclease  53.65 
 
 		 393 aa  291  1e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.965773  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2694  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  60.52 
 
 		 305 aa  289  4e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0181441  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4171  5'-3' exonuclease  56.33 
 
 		 318 aa  287  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000586174  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1774  5'-3' exonuclease  54.63 
 
 		 315 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000265308 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2515  5'-3' exonuclease  50.64 
 
 		 316 aa  280  3e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219771  normal  0.69771 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3097  5'-3' exonuclease  51.43 
 
 		 321 aa  278  9e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501731  normal  0.23354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2478  5'-3' exonuclease  50.32 
 
 		 316 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2523  5'-3' exonuclease  50.32 
 
 		 316 aa  278  1e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.017521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2275  5'-3' exonuclease  56.79 
 
 		 327 aa  276  3e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000000344682  hitchhiker  0.000172307 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3438  5'-3' exonuclease  52.04 
 
 		 323 aa  273  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2947  5'-3' exonuclease  50 
 
 		 333 aa  273  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176217  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2472  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  50.45 
 
 		 347 aa  272  5.000000000000001e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3173  5'-3' exonuclease  45.69 
 
 		 303 aa  252  6e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0156047  hitchhiker  0.000000000759787 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2173  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  48.16 
 
 		 320 aa  251  1e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.192116  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1207  5'-3' exonuclease  50.78 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  45.45 
 
 		 906 aa  186  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  40 
 
 		 904 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  39.2 
 
 		 901 aa  174  1.9999999999999998e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  37.82 
 
 		 908 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  37.08 
 
 		 909 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  40.36 
 
 		 895 aa  172  5.999999999999999e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  37.42 
 
 		 920 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  37.42 
 
 		 920 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  43.73 
 
 		 899 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  37.1 
 
 		 929 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  42.59 
 
 		 899 aa  170  4e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  44.13 
 
 		 910 aa  169  8e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  44.3 
 
 		 949 aa  169  8e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  42.5 
 
 		 917 aa  168  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  44.1 
 
 		 893 aa  168  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  38.97 
 
 		 480 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1220  ribonuclease H  40.83 
 
 		 484 aa  164  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5532  DNA polymerase I  39 
 
 		 888 aa  163  5.0000000000000005e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0774  ribonuclease H  38.67 
 
 		 474 aa  161  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.245945  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1802  DNA polymerase I  39.58 
 
 		 894 aa  162  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000838871 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  35.19 
 
 		 929 aa  160  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  45.08 
 
 		 910 aa  159  6e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  31.48 
 
 		 877 aa  159  8e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  41.32 
 
 		 905 aa  158  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12970  DNA polymerase I  43.28 
 
 		 904 aa  158  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199065  normal  0.445592 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0617  DNA-directed DNA polymerase  38.46 
 
 		 1025 aa  157  2e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  36.19 
 
 		 905 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2063  DNA polymerase I  40.17 
 
 		 955 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045949  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0825  5'-3' exonuclease  38.67 
 
 		 474 aa  157  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  31.8 
 
 		 877 aa  157  3e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  31.48 
 
 		 877 aa  157  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  36.53 
 
 		 875 aa  157  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  31.7 
 
 		 891 aa  156  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  42.45 
 
 		 912 aa  156  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  31.7 
 
 		 891 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  31.7 
 
 		 877 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  34.95 
 
 		 878 aa  156  5.0000000000000005e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0959  DNA polymerase I  35.03 
 
 		 928 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.75162 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  31.7 
 
 		 877 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  31.7 
 
 		 891 aa  156  6e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  31.05 
 
 		 877 aa  155  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  31.7 
 
 		 877 aa  155  9e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0949  ribonuclease H  40.15 
 
 		 482 aa  155  9e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1969  DNA polymerase I  42.06 
 
 		 908 aa  155  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223022  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  36.27 
 
 		 891 aa  154  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  30.35 
 
 		 872 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  30.82 
 
 		 877 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  40.32 
 
 		 945 aa  154  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  35.29 
 
 		 870 aa  154  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3006  DNA polymerase I  40.51 
 
 		 889 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1707  5'-3' exonuclease  32.89 
 
 		 288 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00574418  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3769  DNA polymerase I  38.74 
 
 		 908 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1080  DNA polymerase I  41.84 
 
 		 886 aa  153  4e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  33.57 
 
 		 888 aa  152  5.9999999999999996e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  39.13 
 
 		 911 aa  152  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  34.64 
 
 		 876 aa  152  7e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1643  5'-3' exonuclease family protein  32.89 
 
 		 288 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0209002  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3702  5'-3' exonuclease family protein  32.89 
 
 		 288 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00175288  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 885 aa  151  1e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  35.69 
 
 		 884 aa  151  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11120  DNA polymerase I  41.1 
 
 		 937 aa  150  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1316  5'-3' exonuclease  33.11 
 
 		 288 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000236171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1504  5'-3' exonuclease  32.89 
 
 		 288 aa  150  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1461  5'-3' exonuclease  32.89 
 
 		 288 aa  150  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1675  5'-3' exonuclease family protein  32.89 
 
 		 288 aa  150  4e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2966  DNA-directed DNA polymerase  33.87 
 
 		 901 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  39.34 
 
 		 899 aa  149  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  39.34 
 
 		 899 aa  149  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1489  5'-3' exonuclease family protein  32.89 
 
 		 288 aa  149  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1462  5'-3' exonuclease  32.89 
 
 		 288 aa  149  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0869981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>