More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2322 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_2322  5'-3' exonuclease  100 
 
 		 312 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000272969  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5853  DNA polymerase I  66.03 
 
 		 306 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1819  5'-3' exonuclease  67.21 
 
 		 314 aa  352  2.9999999999999997e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4171  5'-3' exonuclease  61.64 
 
 		 318 aa  328  5.0000000000000004e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000586174  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3511  5'-3' exonuclease  56.88 
 
 		 319 aa  320  1.9999999999999998e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2257  5'-3' exonuclease  58.03 
 
 		 315 aa  318  6e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62484  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2375  5'-3' exonuclease  57.7 
 
 		 353 aa  317  2e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0822086  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0590  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  57.5 
 
 		 326 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649096  hitchhiker  0.00498454 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21890  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  56.11 
 
 		 320 aa  306  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.249283  normal  0.223651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2257  5'-3' exonuclease  54.55 
 
 		 349 aa  304  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000970599  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2694  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  61.59 
 
 		 305 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0181441  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1887  5'-3' exonuclease  56.27 
 
 		 320 aa  301  1e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3280  5'-3' exonuclease  54.29 
 
 		 313 aa  298  8e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2443  5'-3' exonuclease  51.13 
 
 		 315 aa  284  2.0000000000000002e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185668 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2659  5'-3' exonuclease  54.55 
 
 		 301 aa  281  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154679  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2472  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  51.38 
 
 		 347 aa  279  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2004  5'-3' exonuclease  51.94 
 
 		 312 aa  278  1e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2275  5'-3' exonuclease  58.41 
 
 		 327 aa  277  2e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000000344682  hitchhiker  0.000172307 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2947  5'-3' exonuclease  48.5 
 
 		 333 aa  275  6e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176217  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14040  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  54.05 
 
 		 316 aa  274  1.0000000000000001e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00209406  normal  0.396223 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1774  5'-3' exonuclease  52.27 
 
 		 315 aa  263  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000265308 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1207  5'-3' exonuclease  53.55 
 
 		 324 aa  262  6e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12125  5'-3' exonuclease  49.84 
 
 		 393 aa  261  1e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.965773  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3097  5'-3' exonuclease  47.32 
 
 		 321 aa  252  6e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501731  normal  0.23354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2478  5'-3' exonuclease  48.42 
 
 		 316 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2523  5'-3' exonuclease  48.42 
 
 		 316 aa  250  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.017521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2515  5'-3' exonuclease  48.1 
 
 		 316 aa  248  7e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219771  normal  0.69771 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2173  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  47.3 
 
 		 320 aa  248  8e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.192116  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3173  5'-3' exonuclease  44.44 
 
 		 303 aa  247  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0156047  hitchhiker  0.000000000759787 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3438  5'-3' exonuclease  46.06 
 
 		 323 aa  243  3e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  42.8 
 
 		 895 aa  176  4e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  38.98 
 
 		 480 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  35.36 
 
 		 875 aa  171  1e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  36.29 
 
 		 878 aa  171  2e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  41.23 
 
 		 917 aa  170  3e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  42.04 
 
 		 949 aa  169  4e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1080  DNA polymerase I  44.83 
 
 		 886 aa  169  7e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  43.36 
 
 		 906 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  42.73 
 
 		 893 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  42.54 
 
 		 904 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  35.39 
 
 		 884 aa  164  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  34.11 
 
 		 885 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  41.22 
 
 		 843 aa  160  2e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  40.97 
 
 		 929 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  40.97 
 
 		 920 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  40.97 
 
 		 920 aa  160  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  40.97 
 
 		 909 aa  160  3e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  40.97 
 
 		 908 aa  159  5e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  44.59 
 
 		 910 aa  159  5e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  41.59 
 
 		 945 aa  159  9e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0617  DNA-directed DNA polymerase  39.46 
 
 		 1025 aa  158  1e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  40.71 
 
 		 911 aa  158  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0949  ribonuclease H  44.14 
 
 		 482 aa  158  1e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1969  DNA polymerase I  36.59 
 
 		 908 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  39.38 
 
 		 905 aa  155  7e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1220  ribonuclease H  42.79 
 
 		 484 aa  155  7e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1802  DNA polymerase I  36.12 
 
 		 894 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000838871 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  36.68 
 
 		 901 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3769  DNA polymerase I  38.77 
 
 		 908 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12970  DNA polymerase I  39.57 
 
 		 904 aa  153  4e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199065  normal  0.445592 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2966  DNA-directed DNA polymerase  38.33 
 
 		 901 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  40.53 
 
 		 912 aa  153  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  34.74 
 
 		 891 aa  152  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5532  DNA polymerase I  39.38 
 
 		 888 aa  152  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  29.68 
 
 		 898 aa  152  8e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  37.65 
 
 		 902 aa  152  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  31.8 
 
 		 866 aa  151  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  31.8 
 
 		 866 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  40.71 
 
 		 901 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  40.09 
 
 		 899 aa  149  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  40 
 
 		 905 aa  149  4e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  36.21 
 
 		 912 aa  147  2.0000000000000003e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  29.28 
 
 		 890 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  40.09 
 
 		 899 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5859  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  39.6 
 
 		 289 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  30.56 
 
 		 850 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0825  5'-3' exonuclease  39.64 
 
 		 474 aa  147  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0738  DNA polymerase I  38.16 
 
 		 955 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  30.9 
 
 		 888 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  35.5 
 
 		 930 aa  146  5e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  35.18 
 
 		 940 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2951  DNA polymerase I  38.94 
 
 		 933 aa  145  8.000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.04792  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0774  ribonuclease H  35.09 
 
 		 474 aa  145  9e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.245945  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2063  DNA polymerase I  35.84 
 
 		 955 aa  145  9e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045949  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  35.38 
 
 		 868 aa  145  9e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  31.58 
 
 		 894 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  30.19 
 
 		 896 aa  143  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  36.6 
 
 		 916 aa  143  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  38.29 
 
 		 929 aa  142  5e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  33.74 
 
 		 876 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  31.27 
 
 		 870 aa  142  7e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1079  DNA polymerase I  36.12 
 
 		 836 aa  142  8e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.26558  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  29.28 
 
 		 872 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  35.32 
 
 		 934 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  38.7 
 
 		 912 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  36.95 
 
 		 899 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  36.95 
 
 		 899 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3702  5'-3' exonuclease family protein  30 
 
 		 288 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00175288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3006  DNA polymerase I  39.38 
 
 		 889 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  30.17 
 
 		 876 aa  139  4.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>