More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2257 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2257  5'-3' exonuclease  100 
 
 		 315 aa  606  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62484  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2375  5'-3' exonuclease  92.36 
 
 		 353 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0822086  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5853  DNA polymerase I  58.92 
 
 		 306 aa  327  2.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2322  5'-3' exonuclease  58.03 
 
 		 312 aa  318  6e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000272969  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3511  5'-3' exonuclease  57.05 
 
 		 319 aa  315  8e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0590  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  57.1 
 
 		 326 aa  308  5.9999999999999995e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649096  hitchhiker  0.00498454 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21890  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  56.33 
 
 		 320 aa  307  2.0000000000000002e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.249283  normal  0.223651 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2257  5'-3' exonuclease  54.94 
 
 		 349 aa  306  3e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000970599  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2659  5'-3' exonuclease  56.11 
 
 		 301 aa  305  8.000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154679  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1887  5'-3' exonuclease  57.14 
 
 		 320 aa  297  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3173  5'-3' exonuclease  52.67 
 
 		 303 aa  291  8e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0156047  hitchhiker  0.000000000759787 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2443  5'-3' exonuclease  51.27 
 
 		 315 aa  290  2e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185668 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2947  5'-3' exonuclease  51.2 
 
 		 333 aa  289  4e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176217  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12125  5'-3' exonuclease  54.81 
 
 		 393 aa  289  4e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.965773  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3280  5'-3' exonuclease  53.87 
 
 		 313 aa  287  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1819  5'-3' exonuclease  56.67 
 
 		 314 aa  284  1.0000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2004  5'-3' exonuclease  50.64 
 
 		 312 aa  282  5.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2694  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  58.36 
 
 		 305 aa  281  9e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0181441  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3097  5'-3' exonuclease  51.44 
 
 		 321 aa  281  1e-74  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501731  normal  0.23354 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2478  5'-3' exonuclease  51.43 
 
 		 316 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2523  5'-3' exonuclease  51.43 
 
 		 316 aa  276  4e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.017521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2515  5'-3' exonuclease  51.11 
 
 		 316 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219771  normal  0.69771 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3438  5'-3' exonuclease  51.11 
 
 		 323 aa  272  6e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1774  5'-3' exonuclease  50.96 
 
 		 315 aa  266  2.9999999999999995e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000265308 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4171  5'-3' exonuclease  53.35 
 
 		 318 aa  261  1e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000586174  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14040  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  51.47 
 
 		 316 aa  258  1e-67  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00209406  normal  0.396223 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2173  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  51.3 
 
 		 320 aa  258  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.192116  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1207  5'-3' exonuclease  53.67 
 
 		 324 aa  257  2e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2472  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  50 
 
 		 347 aa  256  4e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2275  5'-3' exonuclease  54.69 
 
 		 327 aa  248  6e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000000344682  hitchhiker  0.000172307 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  37.62 
 
 		 949 aa  184  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  38.54 
 
 		 908 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  39.53 
 
 		 901 aa  182  5.0000000000000004e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  37.76 
 
 		 905 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  37.54 
 
 		 909 aa  175  7e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  37.87 
 
 		 920 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  37.87 
 
 		 920 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  37.54 
 
 		 929 aa  173  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  36.18 
 
 		 917 aa  173  2.9999999999999996e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  36.91 
 
 		 902 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1802  DNA polymerase I  37.68 
 
 		 894 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000838871 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  41.94 
 
 		 906 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  37.54 
 
 		 904 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  44.92 
 
 		 910 aa  165  9e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  43.33 
 
 		 899 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5532  DNA polymerase I  36.42 
 
 		 888 aa  163  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  42.5 
 
 		 899 aa  163  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1969  DNA polymerase I  38.89 
 
 		 908 aa  162  7e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  37 
 
 		 911 aa  162  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1226  DNA polymerase I  35.53 
 
 		 893 aa  162  8.000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.826859 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  35.33 
 
 		 893 aa  161  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0617  DNA-directed DNA polymerase  35.57 
 
 		 1025 aa  160  2e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3769  DNA polymerase I  37.87 
 
 		 908 aa  160  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12970  DNA polymerase I  39.16 
 
 		 904 aa  160  4e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199065  normal  0.445592 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  40.07 
 
 		 910 aa  159  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  40.08 
 
 		 912 aa  159  6e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  33.11 
 
 		 875 aa  159  8e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  38.65 
 
 		 945 aa  158  9e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  28.76 
 
 		 872 aa  159  9e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2966  DNA-directed DNA polymerase  34.11 
 
 		 901 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  35.64 
 
 		 901 aa  157  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2063  DNA polymerase I  38.04 
 
 		 955 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045949  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  36.51 
 
 		 895 aa  157  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1080  DNA polymerase I  42.01 
 
 		 886 aa  156  4e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5859  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  40.51 
 
 		 289 aa  156  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  35.86 
 
 		 884 aa  156  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  37.22 
 
 		 885 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  34.96 
 
 		 878 aa  155  6e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  36.96 
 
 		 878 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2951  DNA polymerase I  40.16 
 
 		 933 aa  152  5e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.04792  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  30.77 
 
 		 850 aa  153  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11120  DNA polymerase I  37.36 
 
 		 937 aa  150  2e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  37.4 
 
 		 929 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  35.23 
 
 		 940 aa  149  4e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3011  DNA polymerase I  35.69 
 
 		 972 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3109  DNA polymerase I  35.69 
 
 		 972 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0738  DNA polymerase I  37.36 
 
 		 955 aa  148  9e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3006  DNA polymerase I  40.25 
 
 		 889 aa  148  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  34.21 
 
 		 912 aa  148  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  38.18 
 
 		 480 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  30.84 
 
 		 870 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0959  DNA polymerase I  36.27 
 
 		 928 aa  147  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.75162 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1220  ribonuclease H  39.69 
 
 		 484 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  36.28 
 
 		 888 aa  146  5e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  30.43 
 
 		 878 aa  144  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  36.26 
 
 		 868 aa  145  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  39.03 
 
 		 905 aa  143  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  29.53 
 
 		 894 aa  144  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  33.44 
 
 		 888 aa  143  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  35.92 
 
 		 916 aa  143  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1966  DNA polymerase I  34.06 
 
 		 986 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.378529 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2285  DNA polymerase I  34.56 
 
 		 1273 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153285  hitchhiker  0.0000116157 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  38.72 
 
 		 899 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08691  DNA polymerase I  34.73 
 
 		 986 aa  139  4.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  38.72 
 
 		 899 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0136  DNA polymerase I  32.08 
 
 		 982 aa  139  6e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.3801  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  29.77 
 
 		 890 aa  139  6e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0949  ribonuclease H  38.66 
 
 		 482 aa  139  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl582  DNA polymerase I  30.94 
 
 		 895 aa  138  8.999999999999999e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0335993  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  29.43 
 
 		 877 aa  139  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>