More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1887 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1887  5'-3' exonuclease  100 
 
 		 320 aa  612  9.999999999999999e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373856  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3511  5'-3' exonuclease  61.46 
 
 		 319 aa  349  3e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3280  5'-3' exonuclease  61.41 
 
 		 313 aa  342  5.999999999999999e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0590  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  63.06 
 
 		 326 aa  341  9e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649096  hitchhiker  0.00498454 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2694  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  65.89 
 
 		 305 aa  326  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0181441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5853  DNA polymerase I  58.69 
 
 		 306 aa  326  4.0000000000000003e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2443  5'-3' exonuclease  55.73 
 
 		 315 aa  317  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185668 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2322  5'-3' exonuclease  56.27 
 
 		 312 aa  311  9e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000272969  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2659  5'-3' exonuclease  56.45 
 
 		 301 aa  308  5.9999999999999995e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154679  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2257  5'-3' exonuclease  57.14 
 
 		 315 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62484  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2375  5'-3' exonuclease  57.38 
 
 		 353 aa  306  4.0000000000000004e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0822086  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2257  5'-3' exonuclease  55.66 
 
 		 349 aa  305  6e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000970599  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21890  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  54.75 
 
 		 320 aa  300  2e-80  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.249283  normal  0.223651 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14040  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  57.32 
 
 		 316 aa  300  3e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00209406  normal  0.396223 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2004  5'-3' exonuclease  51.74 
 
 		 312 aa  285  7e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1819  5'-3' exonuclease  55.38 
 
 		 314 aa  280  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3173  5'-3' exonuclease  50.16 
 
 		 303 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0156047  hitchhiker  0.000000000759787 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4171  5'-3' exonuclease  55.84 
 
 		 318 aa  269  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000586174  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12125  5'-3' exonuclease  50 
 
 		 393 aa  268  1e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.965773  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3438  5'-3' exonuclease  50.62 
 
 		 323 aa  268  1e-70  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3097  5'-3' exonuclease  51.27 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501731  normal  0.23354 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2472  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  48.62 
 
 		 347 aa  265  5e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2515  5'-3' exonuclease  48.25 
 
 		 316 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219771  normal  0.69771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2478  5'-3' exonuclease  47.94 
 
 		 316 aa  258  8e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2523  5'-3' exonuclease  47.94 
 
 		 316 aa  258  8e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.017521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2947  5'-3' exonuclease  46.75 
 
 		 333 aa  255  6e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176217  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2173  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  49.52 
 
 		 320 aa  255  7e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.192116  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1774  5'-3' exonuclease  50.32 
 
 		 315 aa  254  9e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000265308 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1207  5'-3' exonuclease  51.74 
 
 		 324 aa  248  8e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2275  5'-3' exonuclease  56.11 
 
 		 327 aa  242  6e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000000344682  hitchhiker  0.000172307 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  38.41 
 
 		 904 aa  159  6e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  38.06 
 
 		 920 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  38.06 
 
 		 920 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  37.72 
 
 		 929 aa  156  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  36.24 
 
 		 909 aa  155  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  37.54 
 
 		 917 aa  153  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  36.7 
 
 		 908 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  38.29 
 
 		 949 aa  152  8.999999999999999e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  34.54 
 
 		 875 aa  152  8.999999999999999e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  40 
 
 		 906 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  37.67 
 
 		 901 aa  150  3e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11120  DNA polymerase I  36.19 
 
 		 937 aa  150  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  41.2 
 
 		 899 aa  150  4e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1969  DNA polymerase I  37.62 
 
 		 908 aa  149  5e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  38.44 
 
 		 945 aa  149  8e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  37.91 
 
 		 912 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  40.08 
 
 		 893 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  35.94 
 
 		 911 aa  147  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  40.8 
 
 		 899 aa  146  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1802  DNA polymerase I  32.68 
 
 		 894 aa  145  7.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000838871 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  42.8 
 
 		 910 aa  145  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  38.89 
 
 		 884 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1080  DNA polymerase I  40.53 
 
 		 886 aa  144  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2063  DNA polymerase I  37.82 
 
 		 955 aa  143  4e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045949  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  40.52 
 
 		 895 aa  143  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  38.31 
 
 		 480 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  34.43 
 
 		 878 aa  141  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  38.14 
 
 		 929 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0949  ribonuclease H  40.59 
 
 		 482 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  35.92 
 
 		 885 aa  139  6e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  38.01 
 
 		 910 aa  139  7e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12970  DNA polymerase I  36.03 
 
 		 904 aa  138  1e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199065  normal  0.445592 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  36.25 
 
 		 902 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0959  DNA polymerase I  38.03 
 
 		 928 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.75162 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  33.83 
 
 		 905 aa  136  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1220  ribonuclease H  37.2 
 
 		 484 aa  136  5e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  33.77 
 
 		 843 aa  135  9e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1316  5'-3' exonuclease  34.4 
 
 		 288 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000236171  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2846  DNA polymerase I  35.74 
 
 		 943 aa  134  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.411951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0221  DNA polymerase I  34.75 
 
 		 973 aa  133  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.324106 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5532  DNA polymerase I  34.44 
 
 		 888 aa  133  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2951  DNA polymerase I  36.94 
 
 		 933 aa  133  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.04792  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  30.97 
 
 		 944 aa  132  5e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  29.28 
 
 		 894 aa  132  6e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  32.01 
 
 		 891 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3769  DNA polymerase I  37.93 
 
 		 908 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  27.96 
 
 		 898 aa  131  1.0000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  29.3 
 
 		 872 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0738  DNA polymerase I  33.44 
 
 		 955 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1012  5'-3' exonuclease, putative  29.59 
 
 		 292 aa  130  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.667651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2966  DNA-directed DNA polymerase  32.12 
 
 		 901 aa  130  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1504  DNA polymerase I  34.87 
 
 		 915 aa  130  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0774  ribonuclease H  35.86 
 
 		 474 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.245945  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  35.32 
 
 		 868 aa  129  7.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  32.47 
 
 		 883 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1504  5'-3' exonuclease  35.06 
 
 		 288 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  32.63 
 
 		 956 aa  129  9.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3702  5'-3' exonuclease family protein  34.66 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00175288  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1461  5'-3' exonuclease  34.14 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1643  5'-3' exonuclease family protein  34.66 
 
 		 288 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0209002  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  35.66 
 
 		 911 aa  129  1.0000000000000001e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0617  DNA-directed DNA polymerase  30.42 
 
 		 1025 aa  128  1.0000000000000001e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1489  5'-3' exonuclease family protein  34.14 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145211  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  29.28 
 
 		 890 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1606  5'-3' exonuclease family protein  34.14 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.368882  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  31.53 
 
 		 873 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  36.57 
 
 		 905 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1675  5'-3' exonuclease family protein  34.14 
 
 		 288 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  33.12 
 
 		 979 aa  128  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  31.96 
 
 		 866 aa  128  2.0000000000000002e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>