More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_1774 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1774  5'-3' exonuclease  100 
 
 
315 aa  627  1e-178  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000265308 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2004  5'-3' exonuclease  77.17 
 
 
312 aa  489  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2659  5'-3' exonuclease  56.54 
 
 
301 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154679  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3280  5'-3' exonuclease  53.97 
 
 
313 aa  298  9e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5853  DNA polymerase I  52.63 
 
 
306 aa  295  5e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0590  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  53.67 
 
 
326 aa  293  3e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649096  hitchhiker  0.00498454 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3511  5'-3' exonuclease  51.43 
 
 
319 aa  288  6e-77  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21890  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  53.09 
 
 
320 aa  281  7.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.249283  normal  0.223651 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2257  5'-3' exonuclease  50.96 
 
 
315 aa  279  5e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62484  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2694  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  57.56 
 
 
305 aa  277  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0181441  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2322  5'-3' exonuclease  52.27 
 
 
312 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000272969  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2443  5'-3' exonuclease  53.09 
 
 
315 aa  273  3e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185668 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2375  5'-3' exonuclease  50 
 
 
353 aa  270  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0822086  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2515  5'-3' exonuclease  47.94 
 
 
316 aa  262  6e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219771  normal  0.69771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2478  5'-3' exonuclease  47.94 
 
 
316 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2523  5'-3' exonuclease  47.94 
 
 
316 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.017521  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1887  5'-3' exonuclease  50.32 
 
 
320 aa  256  5e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373856  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2257  5'-3' exonuclease  47.95 
 
 
349 aa  250  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000970599  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1819  5'-3' exonuclease  57.33 
 
 
314 aa  249  3e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2947  5'-3' exonuclease  45.65 
 
 
333 aa  247  2e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176217  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12125  5'-3' exonuclease  48.25 
 
 
393 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.965773  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2472  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  49.22 
 
 
347 aa  243  3e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3173  5'-3' exonuclease  45.39 
 
 
303 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0156047  hitchhiker  0.000000000759787 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3097  5'-3' exonuclease  45.83 
 
 
321 aa  241  9e-63  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501731  normal  0.23354 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3438  5'-3' exonuclease  47.15 
 
 
323 aa  241  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4171  5'-3' exonuclease  49.68 
 
 
318 aa  239  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000586174  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14040  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  47.74 
 
 
316 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00209406  normal  0.396223 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1207  5'-3' exonuclease  47.71 
 
 
324 aa  227  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.561971  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2173  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  46.3 
 
 
320 aa  221  9e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.192116  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2275  5'-3' exonuclease  54.26 
 
 
327 aa  218  8.999999999999998e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000000344682  hitchhiker  0.000172307 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  37.91 
 
 
949 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  38.81 
 
 
929 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  38.81 
 
 
920 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  38.81 
 
 
920 aa  161  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  36.31 
 
 
904 aa  157  2e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  38.2 
 
 
909 aa  157  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  37.83 
 
 
908 aa  155  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  34.44 
 
 
917 aa  153  2.9999999999999998e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2966  DNA-directed DNA polymerase  33.55 
 
 
901 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254596  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  35.32 
 
 
905 aa  149  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  36.75 
 
 
884 aa  148  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  36.69 
 
 
912 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  39.03 
 
 
907 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  37.97 
 
 
905 aa  145  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  36.59 
 
 
893 aa  144  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  36.84 
 
 
911 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5532  DNA polymerase I  34.2 
 
 
888 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  34.5 
 
 
878 aa  142  5e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  36.26 
 
 
906 aa  143  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  35.05 
 
 
902 aa  143  5e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  32.1 
 
 
875 aa  141  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  34.83 
 
 
901 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1226  DNA polymerase I  33.58 
 
 
893 aa  141  9.999999999999999e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.826859 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  38.87 
 
 
910 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  39.39 
 
 
895 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  35.37 
 
 
929 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  37.25 
 
 
945 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0959  DNA polymerase I  36.59 
 
 
928 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.75162 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  32.53 
 
 
912 aa  140  3e-32  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  32.96 
 
 
885 aa  140  3e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  36.06 
 
 
899 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  37.33 
 
 
843 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1969  DNA polymerase I  34.94 
 
 
908 aa  139  6e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223022  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  33.55 
 
 
910 aa  139  6e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  34.73 
 
 
878 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  31.73 
 
 
890 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0738  DNA polymerase I  33.83 
 
 
955 aa  138  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  36.53 
 
 
899 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  36.53 
 
 
899 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  37.25 
 
 
934 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1080  DNA polymerase I  37.4 
 
 
886 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  33.33 
 
 
901 aa  135  7.000000000000001e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1504  DNA polymerase I  36.13 
 
 
915 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  32.77 
 
 
877 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3769  DNA polymerase I  34.01 
 
 
908 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  34.45 
 
 
876 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  34.05 
 
 
879 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0774  ribonuclease H  35.88 
 
 
474 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.245945  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2951  DNA polymerase I  35.08 
 
 
933 aa  133  5e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.04792  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3702  5'-3' exonuclease family protein  32.17 
 
 
288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00175288  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  36.96 
 
 
870 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1643  5'-3' exonuclease family protein  32.17 
 
 
288 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0209002  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2058  5'-3' exonuclease  32.49 
 
 
292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.762247  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  29.81 
 
 
872 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  33.83 
 
 
899 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  36.53 
 
 
939 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  35.04 
 
 
979 aa  130  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1494  5'-3' exonuclease  30.61 
 
 
299 aa  130  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.32691  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  35.11 
 
 
893 aa  130  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  36.44 
 
 
941 aa  130  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  33.47 
 
 
866 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  35.89 
 
 
912 aa  130  3e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0825  5'-3' exonuclease  36.12 
 
 
474 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1244  DNA polymerase I  32.77 
 
 
902 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1930  DNA polymerase I  34.71 
 
 
927 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173956  normal  0.0298694 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  33.47 
 
 
866 aa  129  6e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12970  DNA polymerase I  34.06 
 
 
904 aa  129  6e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199065  normal  0.445592 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  33.33 
 
 
896 aa  129  7.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5859  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  36.55 
 
 
289 aa  129  7.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1504  5'-3' exonuclease  34.35 
 
 
288 aa  129  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>