More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2443 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2443  5'-3' exonuclease  100 
 
 
315 aa  623  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.185668 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3511  5'-3' exonuclease  58.28 
 
 
319 aa  324  1e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3280  5'-3' exonuclease  55.02 
 
 
313 aa  315  6e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5853  DNA polymerase I  52.94 
 
 
306 aa  308  1.0000000000000001e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1887  5'-3' exonuclease  55.73 
 
 
320 aa  305  9.000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373856  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0590  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  56.05 
 
 
326 aa  300  2e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649096  hitchhiker  0.00498454 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2659  5'-3' exonuclease  54.07 
 
 
301 aa  297  2e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154679  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2257  5'-3' exonuclease  51.27 
 
 
315 aa  290  2e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62484  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2375  5'-3' exonuclease  52.75 
 
 
353 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0822086  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2694  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  56.77 
 
 
305 aa  286  4e-76  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0181441  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21890  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  50.96 
 
 
320 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.249283  normal  0.223651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2322  5'-3' exonuclease  51.13 
 
 
312 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000272969  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12125  5'-3' exonuclease  50.96 
 
 
393 aa  279  4e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.965773  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4171  5'-3' exonuclease  53.65 
 
 
318 aa  274  2.0000000000000002e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000586174  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3097  5'-3' exonuclease  51.3 
 
 
321 aa  272  6e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501731  normal  0.23354 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2257  5'-3' exonuclease  48.89 
 
 
349 aa  270  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000970599  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1819  5'-3' exonuclease  52.44 
 
 
314 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2472  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  47.37 
 
 
347 aa  267  2e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2515  5'-3' exonuclease  48.08 
 
 
316 aa  263  3e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219771  normal  0.69771 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2004  5'-3' exonuclease  53.56 
 
 
312 aa  263  3e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2478  5'-3' exonuclease  48.08 
 
 
316 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2523  5'-3' exonuclease  48.08 
 
 
316 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.017521  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1774  5'-3' exonuclease  53.09 
 
 
315 aa  256  3e-67  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000265308 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2947  5'-3' exonuclease  45.76 
 
 
333 aa  255  9e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176217  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2173  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  49.84 
 
 
320 aa  254  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.192116  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3438  5'-3' exonuclease  48.44 
 
 
323 aa  253  3e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3173  5'-3' exonuclease  46.56 
 
 
303 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0156047  hitchhiker  0.000000000759787 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2275  5'-3' exonuclease  53.23 
 
 
327 aa  247  2e-64  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000000344682  hitchhiker  0.000172307 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14040  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  50.65 
 
 
316 aa  244  9.999999999999999e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00209406  normal  0.396223 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1207  5'-3' exonuclease  49.07 
 
 
324 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.561971  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  37.46 
 
 
908 aa  161  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  38.06 
 
 
904 aa  159  7e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  42.36 
 
 
929 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  42.36 
 
 
920 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  42.36 
 
 
920 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  34.08 
 
 
875 aa  156  5.0000000000000005e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  36.4 
 
 
909 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  41.77 
 
 
949 aa  155  6e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  41.59 
 
 
893 aa  153  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0738  DNA polymerase I  39.24 
 
 
955 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  36.8 
 
 
878 aa  145  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  35.09 
 
 
917 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  35.62 
 
 
901 aa  143  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  31.31 
 
 
885 aa  142  5e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  36.29 
 
 
884 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2019  DNA polymerase I  30.54 
 
 
885 aa  139  6e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.206031  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  39.91 
 
 
480 aa  139  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5532  DNA polymerase I  38.7 
 
 
888 aa  139  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1080  DNA polymerase I  37.14 
 
 
886 aa  137  2e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  34.51 
 
 
901 aa  136  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2058  5'-3' exonuclease  30.22 
 
 
292 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.762247  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  33.47 
 
 
880 aa  135  8e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0581  DNA polymerase I  35.94 
 
 
977 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  38.7 
 
 
906 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  34.97 
 
 
905 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0617  DNA-directed DNA polymerase  34 
 
 
1025 aa  134  3e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12970  DNA polymerase I  38.26 
 
 
904 aa  134  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199065  normal  0.445592 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  39.47 
 
 
911 aa  133  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1220  ribonuclease H  39.32 
 
 
484 aa  132  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1969  DNA polymerase I  35.57 
 
 
908 aa  132  9e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223022  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  33.91 
 
 
894 aa  132  9e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3769  DNA polymerase I  37.02 
 
 
908 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1226  DNA polymerase I  37.02 
 
 
893 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.826859 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  37.05 
 
 
945 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  39.3 
 
 
905 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2063  DNA polymerase I  37.39 
 
 
955 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045949  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  31.58 
 
 
888 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  32.47 
 
 
898 aa  130  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  30.15 
 
 
890 aa  130  3e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  31.44 
 
 
891 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2966  DNA-directed DNA polymerase  36.73 
 
 
901 aa  129  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254596  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  31.15 
 
 
876 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  32.55 
 
 
877 aa  129  8.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  31 
 
 
878 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  28.29 
 
 
877 aa  129  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  29.87 
 
 
944 aa  129  9.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  35.22 
 
 
876 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  35.22 
 
 
876 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  34.77 
 
 
893 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  29.5 
 
 
877 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  35.81 
 
 
902 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  30.43 
 
 
877 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  33.86 
 
 
893 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  32.25 
 
 
843 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  33.44 
 
 
891 aa  127  3e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  33.33 
 
 
879 aa  127  3e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0949  ribonuclease H  39.74 
 
 
482 aa  127  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  27.63 
 
 
877 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  31.29 
 
 
895 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  31 
 
 
866 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  31.95 
 
 
912 aa  126  5e-28  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  31 
 
 
866 aa  125  7e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  35.41 
 
 
899 aa  125  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  29.08 
 
 
896 aa  125  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  40.09 
 
 
910 aa  125  7e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0136  DNA polymerase I  32.99 
 
 
982 aa  125  1e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.3801  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  33.9 
 
 
876 aa  125  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5859  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  34.65 
 
 
289 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3514  DNA polymerase A  34.39 
 
 
924 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1316  5'-3' exonuclease  30.88 
 
 
288 aa  125  1e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000236171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>