More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14040 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_14040  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  100 
 
 		 316 aa  610  1e-173  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00209406  normal  0.396223 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3511  5'-3' exonuclease  58.92 
 
 		 319 aa  315  8e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0590  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  59.05 
 
 		 326 aa  311  7.999999999999999e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649096  hitchhiker  0.00498454 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3280  5'-3' exonuclease  58.84 
 
 		 313 aa  308  8e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5853  DNA polymerase I  55.88 
 
 		 306 aa  305  6e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1887  5'-3' exonuclease  57.5 
 
 		 320 aa  295  1e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2694  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  57.74 
 
 		 305 aa  276  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0181441  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2322  5'-3' exonuclease  54.05 
 
 		 312 aa  276  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000272969  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2257  5'-3' exonuclease  51.92 
 
 		 349 aa  269  5.9999999999999995e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000970599  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1819  5'-3' exonuclease  54.4 
 
 		 314 aa  267  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21890  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  51.12 
 
 		 320 aa  267  2e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.249283  normal  0.223651 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2659  5'-3' exonuclease  51.96 
 
 		 301 aa  260  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154679  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2257  5'-3' exonuclease  51.79 
 
 		 315 aa  259  3e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62484  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2375  5'-3' exonuclease  51.46 
 
 		 353 aa  256  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0822086  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2443  5'-3' exonuclease  50.65 
 
 		 315 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185668 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4171  5'-3' exonuclease  52.38 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000586174  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2004  5'-3' exonuclease  49.03 
 
 		 312 aa  246  4e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12125  5'-3' exonuclease  47.28 
 
 		 393 aa  245  6.999999999999999e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.965773  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3438  5'-3' exonuclease  47.19 
 
 		 323 aa  238  1e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2947  5'-3' exonuclease  43.98 
 
 		 333 aa  236  3e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176217  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2515  5'-3' exonuclease  45.02 
 
 		 316 aa  233  3e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219771  normal  0.69771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2478  5'-3' exonuclease  45.02 
 
 		 316 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2523  5'-3' exonuclease  45.02 
 
 		 316 aa  233  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.017521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1207  5'-3' exonuclease  49.03 
 
 		 324 aa  232  5e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1774  5'-3' exonuclease  48.06 
 
 		 315 aa  229  5e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000265308 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3097  5'-3' exonuclease  44.59 
 
 		 321 aa  228  7e-59  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501731  normal  0.23354 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2173  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  46.45 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.192116  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2472  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  43.96 
 
 		 347 aa  219  6e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3173  5'-3' exonuclease  45.42 
 
 		 303 aa  219  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0156047  hitchhiker  0.000000000759787 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2275  5'-3' exonuclease  55.02 
 
 		 327 aa  218  2e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000000344682  hitchhiker  0.000172307 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  37.13 
 
 		 901 aa  159  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  38.99 
 
 		 895 aa  155  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  37.54 
 
 		 893 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  32.79 
 
 		 875 aa  153  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  32.8 
 
 		 878 aa  152  8.999999999999999e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  37.78 
 
 		 911 aa  151  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  37.13 
 
 		 884 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1316  5'-3' exonuclease  30.92 
 
 		 288 aa  151  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000236171  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  31.5 
 
 		 872 aa  147  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  35.84 
 
 		 917 aa  146  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  36.19 
 
 		 908 aa  146  5e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1643  5'-3' exonuclease family protein  30.46 
 
 		 288 aa  145  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0209002  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3702  5'-3' exonuclease family protein  30.46 
 
 		 288 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00175288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4231  DNA polymerase I  32.89 
 
 		 966 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1504  5'-3' exonuclease  30.13 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3011  DNA polymerase I  33.45 
 
 		 972 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664853  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1461  5'-3' exonuclease  30 
 
 		 288 aa  143  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3109  DNA polymerase I  33.45 
 
 		 972 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  33.77 
 
 		 885 aa  143  3e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1707  5'-3' exonuclease  29.67 
 
 		 288 aa  143  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00574418  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  36.19 
 
 		 920 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  36.19 
 
 		 920 aa  143  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1489  5'-3' exonuclease family protein  30 
 
 		 288 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.145211  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1462  5'-3' exonuclease  30 
 
 		 288 aa  142  5e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0869981  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1606  5'-3' exonuclease family protein  30 
 
 		 288 aa  142  5e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.368882  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  36.19 
 
 		 929 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1675  5'-3' exonuclease family protein  30 
 
 		 288 aa  142  6e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2058  5'-3' exonuclease  30.71 
 
 		 292 aa  142  6e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.762247  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  36.99 
 
 		 945 aa  142  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl582  DNA polymerase I  27.8 
 
 		 895 aa  142  9.999999999999999e-33  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0335993  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1754  5'-3' exonuclease family protein  29.67 
 
 		 288 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0435319  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  37.18 
 
 		 949 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 876 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 876 aa  141  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  37.6 
 
 		 905 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  36.36 
 
 		 843 aa  140  3e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0581  DNA polymerase I  34.89 
 
 		 977 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  35.32 
 
 		 909 aa  139  6e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  31.25 
 
 		 888 aa  138  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  31.91 
 
 		 870 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  31.73 
 
 		 877 aa  138  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  36.2 
 
 		 906 aa  138  1e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  36.06 
 
 		 904 aa  137  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0850  DNA polymerase I  30.84 
 
 		 982 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0300789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2966  DNA-directed DNA polymerase  34.66 
 
 		 901 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1080  DNA polymerase I  39.84 
 
 		 886 aa  136  4e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  35.19 
 
 		 876 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  32.1 
 
 		 877 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  37.8 
 
 		 899 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0136  DNA polymerase I  32.97 
 
 		 982 aa  135  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.3801  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  32.99 
 
 		 879 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  31.37 
 
 		 877 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  31.02 
 
 		 891 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  34.35 
 
 		 930 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  35.97 
 
 		 899 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  33.12 
 
 		 868 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  35.02 
 
 		 912 aa  133  3e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1529  5'-3' exonuclease  27.27 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  33.01 
 
 		 902 aa  133  3.9999999999999996e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1500  5'-3' exonuclease  27.27 
 
 		 292 aa  133  3.9999999999999996e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  31.37 
 
 		 877 aa  133  5e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  30.66 
 
 		 891 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  30.66 
 
 		 891 aa  133  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  30.66 
 
 		 877 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  30.66 
 
 		 877 aa  133  5e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1220  ribonuclease H  40.69 
 
 		 484 aa  132  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  36.17 
 
 		 876 aa  132  6e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  31 
 
 		 877 aa  132  6e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  32.59 
 
 		 878 aa  132  6e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  32.97 
 
 		 883 aa  132  6e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>