More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12125 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12125  5'-3' exonuclease  100 
 
 		 393 aa  761    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.965773  normal  0.392977 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2515  5'-3' exonuclease  74.05 
 
 		 316 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.219771  normal  0.69771 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2478  5'-3' exonuclease  74.05 
 
 		 316 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2523  5'-3' exonuclease  74.05 
 
 		 316 aa  462  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.017521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3097  5'-3' exonuclease  73.33 
 
 		 321 aa  455  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501731  normal  0.23354 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3438  5'-3' exonuclease  73.67 
 
 		 323 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2472  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  63.75 
 
 		 347 aa  388  1e-106  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21890  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  61.64 
 
 		 320 aa  365  1e-100  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.249283  normal  0.223651 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2173  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  59.03 
 
 		 320 aa  345  8e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.192116  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2257  5'-3' exonuclease  58.1 
 
 		 349 aa  341  1e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000970599  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2947  5'-3' exonuclease  51.65 
 
 		 333 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0176217  hitchhiker  0.000125626 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3280  5'-3' exonuclease  53.67 
 
 		 313 aa  292  6e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5853  DNA polymerase I  53.07 
 
 		 306 aa  290  4e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153015  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2257  5'-3' exonuclease  54.81 
 
 		 315 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.62484  normal  0.409041 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2375  5'-3' exonuclease  51.45 
 
 		 353 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0822086  hitchhiker  0.00237783 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0590  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  53.02 
 
 		 326 aa  283  4.0000000000000003e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.649096  hitchhiker  0.00498454 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3511  5'-3' exonuclease  50.31 
 
 		 319 aa  280  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.309526 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2659  5'-3' exonuclease  54.55 
 
 		 301 aa  280  2e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.154679  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2443  5'-3' exonuclease  50.96 
 
 		 315 aa  279  6e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.185668 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2322  5'-3' exonuclease  49.84 
 
 		 312 aa  261  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000272969  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1887  5'-3' exonuclease  50 
 
 		 320 aa  261  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0373856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2004  5'-3' exonuclease  47.92 
 
 		 312 aa  248  9e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3173  5'-3' exonuclease  48.41 
 
 		 303 aa  248  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0156047  hitchhiker  0.000000000759787 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2694  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  57.76 
 
 		 305 aa  246  6e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0181441  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4171  5'-3' exonuclease  50.47 
 
 		 318 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000586174  normal  0.269504 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14040  5'-3' exonuclease (including N-terminal domain of PolI)  47.28 
 
 		 316 aa  236  4e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00209406  normal  0.396223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1819  5'-3' exonuclease  51.85 
 
 		 314 aa  233  5e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.339791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1774  5'-3' exonuclease  48.25 
 
 		 315 aa  231  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000265308 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2275  5'-3' exonuclease  56.14 
 
 		 327 aa  219  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.000000344682  hitchhiker  0.000172307 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1207  5'-3' exonuclease  46.67 
 
 		 324 aa  212  7e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.561971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  41.43 
 
 		 909 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  41.43 
 
 		 929 aa  171  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  37.29 
 
 		 949 aa  171  2e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  40 
 
 		 904 aa  171  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  41.43 
 
 		 920 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  41.43 
 
 		 920 aa  171  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  41.57 
 
 		 893 aa  169  9e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  41.04 
 
 		 908 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  41.04 
 
 		 906 aa  164  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  38.34 
 
 		 917 aa  162  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  39.04 
 
 		 905 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  34.74 
 
 		 892 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  38.8 
 
 		 901 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  38.78 
 
 		 912 aa  155  8e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12970  DNA polymerase I  39.44 
 
 		 904 aa  154  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199065  normal  0.445592 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  35.18 
 
 		 891 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  32.27 
 
 		 870 aa  153  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2864  DNA polymerase I  37.55 
 
 		 480 aa  152  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  39.44 
 
 		 911 aa  150  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  29.11 
 
 		 872 aa  150  5e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  39.85 
 
 		 945 aa  149  9e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  37.05 
 
 		 902 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  35.06 
 
 		 929 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  33.55 
 
 		 892 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  36.1 
 
 		 875 aa  147  4.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  38.16 
 
 		 895 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  37.92 
 
 		 910 aa  146  5e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  37.7 
 
 		 899 aa  146  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5532  DNA polymerase I  36.36 
 
 		 888 aa  146  7.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  38.56 
 
 		 891 aa  146  8.000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2966  DNA-directed DNA polymerase  37.4 
 
 		 901 aa  146  8.000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1226  DNA polymerase I  37.65 
 
 		 893 aa  145  8.000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.826859 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1220  ribonuclease H  37.45 
 
 		 484 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3011  DNA polymerase I  32.65 
 
 		 972 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664853  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0959  DNA polymerase I  37.5 
 
 		 928 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.75162 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1969  DNA polymerase I  38.25 
 
 		 908 aa  145  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  38.65 
 
 		 901 aa  144  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  37.05 
 
 		 899 aa  144  2e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3109  DNA polymerase I  32.65 
 
 		 972 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1080  DNA polymerase I  41.7 
 
 		 886 aa  144  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  37.66 
 
 		 892 aa  144  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3769  DNA polymerase I  34.92 
 
 		 908 aa  143  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1802  DNA polymerase I  33.94 
 
 		 894 aa  143  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000838871 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  31.17 
 
 		 850 aa  143  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  33.44 
 
 		 940 aa  142  8e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3006  DNA polymerase I  36.51 
 
 		 889 aa  142  9e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  33.87 
 
 		 878 aa  142  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  37.24 
 
 		 892 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1529  5'-3' exonuclease  30.04 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  33.61 
 
 		 933 aa  140  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1500  5'-3' exonuclease  30.04 
 
 		 292 aa  140  3e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  36.58 
 
 		 905 aa  140  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  39.27 
 
 		 910 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0738  DNA polymerase I  35.83 
 
 		 955 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2951  DNA polymerase I  36.54 
 
 		 933 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.04792  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  34.86 
 
 		 843 aa  139  1e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11120  DNA polymerase I  36.84 
 
 		 937 aa  139  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  30.87 
 
 		 878 aa  139  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  30.72 
 
 		 888 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  35.04 
 
 		 945 aa  138  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5859  5'-3' exonuclease, N-terminal resolvase-like domain protein  34.49 
 
 		 289 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1512  DNA polymerase I  36.52 
 
 		 972 aa  137  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43872  normal  0.0397579 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2063  DNA polymerase I  34.04 
 
 		 955 aa  138  2e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045949  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0949  ribonuclease H  36.46 
 
 		 482 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  35.95 
 
 		 868 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  30.67 
 
 		 894 aa  137  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  31.07 
 
 		 902 aa  137  3.0000000000000003e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14980  DNA polymerase I  36.65 
 
 		 904 aa  137  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0168327  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  33.09 
 
 		 873 aa  137  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  31.43 
 
 		 931 aa  137  4e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>