146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3586 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3586  DTW domain-containing protein  100 
 
 		 200 aa  406  1e-113  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0256  DTW domain-containing protein  56.06 
 
 		 197 aa  231  6e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  58.08 
 
 		 223 aa  229  2e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  50.51 
 
 		 203 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  52.02 
 
 		 207 aa  207  8e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  52.02 
 
 		 197 aa  204  6e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  51.01 
 
 		 207 aa  204  6e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  51.01 
 
 		 207 aa  203  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  50 
 
 		 200 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0255  DTW domain-containing protein  55.43 
 
 		 174 aa  194  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  51.08 
 
 		 188 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  48.73 
 
 		 201 aa  192  2e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  50 
 
 		 209 aa  191  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3749  DTW domain-containing protein  51.61 
 
 		 188 aa  188  5e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4270  DTW domain-containing protein  51.46 
 
 		 181 aa  175  5e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3493  hypothetical protein  43.14 
 
 		 205 aa  152  5e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4292  DTW domain-containing protein  40.68 
 
 		 196 aa  134  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.616546  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  43.46 
 
 		 197 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  41.41 
 
 		 197 aa  129  3e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0317  DTW domain-containing protein  38.95 
 
 		 211 aa  127  8.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  43.5 
 
 		 199 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  39.59 
 
 		 213 aa  124  8.000000000000001e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  43 
 
 		 199 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  43.14 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  41.21 
 
 		 199 aa  121  8e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  40.4 
 
 		 199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04079  DTW domain containing protein  34.17 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004037  hypothetical protein  36.76 
 
 		 204 aa  112  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1565  hypothetical protein  34.85 
 
 		 200 aa  110  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0932097  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0676  hypothetical protein  38.33 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390701  unclonable  0.0000000107509 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  38.38 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46020  hypothetical protein  41.75 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.637513  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3914  hypothetical protein  41.97 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1957  DTW domain-containing protein  36.59 
 
 		 227 aa  101  6e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1758  DTW domain containing protein  36.36 
 
 		 227 aa  98.2  6e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.370644  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0945  DTW domain-containing protein  38.12 
 
 		 215 aa  97.8  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0983717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0889  DTW domain-containing protein  29.85 
 
 		 208 aa  96.7  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2572  hypothetical protein  34.97 
 
 		 243 aa  96.3  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3314  hypothetical protein  37.23 
 
 		 201 aa  95.9  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2149  DTW domain-containing protein  33.68 
 
 		 243 aa  94.7  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0091  DTW domain-containing protein  38.81 
 
 		 215 aa  91.7  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0863  DTW  35.47 
 
 		 198 aa  91.3  9e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2829  DTW domain-containing protein  34.18 
 
 		 200 aa  90.1  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2899  DTW  31.55 
 
 		 243 aa  88.6  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.124472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1830  DTW domain-containing protein  36.82 
 
 		 212 aa  88.2  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2561  DTW  34.04 
 
 		 243 aa  88.2  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0180989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3935  hypothetical protein  31.63 
 
 		 246 aa  87.8  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2845  DTW domain containing protein  32.45 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01424  hypothetical protein  40.29 
 
 		 171 aa  86.7  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1820  DTW domain containing protein  31.79 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2058  DTW  31.28 
 
 		 203 aa  82.8  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1899  DTW domain containing protein  31.28 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  30.89 
 
 		 241 aa  81.3  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  31.55 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2062  hypothetical protein  28.72 
 
 		 238 aa  76.6  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1739  DTW domain-containing protein  34.95 
 
 		 204 aa  75.5  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.438659 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  28.65 
 
 		 245 aa  72.8  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  31.33 
 
 		 232 aa  68.9  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  27.95 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  27.93 
 
 		 290 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  28.48 
 
 		 236 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  24.21 
 
 		 254 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  24.21 
 
 		 254 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  24.21 
 
 		 254 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  24.21 
 
 		 254 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1520  hypothetical protein  29.1 
 
 		 237 aa  64.7  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0474866  normal  0.0473662 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  24.21 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  24.76 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  23.68 
 
 		 251 aa  62.4  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  24.74 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1461  DTW domain containing protein  29.88 
 
 		 246 aa  62  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  24.74 
 
 		 254 aa  62  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  26.88 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  24.21 
 
 		 254 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2401  DTW domain-containing protein  28.57 
 
 		 205 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663769  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0900  DTW domain-containing protein  28.49 
 
 		 281 aa  60.8  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  22.75 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  25.74 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  25.3 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  23.81 
 
 		 245 aa  58.5  0.00000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  25.95 
 
 		 249 aa  58.2  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1306  DTW domain-containing protein  28.48 
 
 		 156 aa  57.4  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  28.05 
 
 		 247 aa  56.6  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2086  DTW domain-containing protein  22.63 
 
 		 253 aa  57  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  26.11 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3422  hypothetical protein  24.35 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0179  DTW  27.98 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.165291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3956  DTW  28.34 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222792  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_93924  predicted protein  26.27 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0426424 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  26.19 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  23.35 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2540  DTW domain-containing protein  21.18 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.565238 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2613  hypothetical protein  29.03 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  25.99 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  26.42 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45608  predicted protein  27.69 
 
 		 342 aa  53.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.217308  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  22.11 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  23.27 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1543  DTW domain-containing protein  25 
 
 		 266 aa  53.1  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1391  hypothetical protein  24.4 
 
 		 247 aa  52.8  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>