149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1728 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  404  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  85.35 
 
 		 199 aa  347  6e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  72.08 
 
 		 197 aa  286  9e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  72.82 
 
 		 197 aa  279  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  68.84 
 
 		 199 aa  274  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  68.34 
 
 		 199 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  66.33 
 
 		 199 aa  264  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  65.15 
 
 		 199 aa  262  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46020  hypothetical protein  67.5 
 
 		 203 aa  247  8e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.637513  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3914  hypothetical protein  65.35 
 
 		 203 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  62.56 
 
 		 213 aa  232  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2058  DTW  42.93 
 
 		 203 aa  130  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0945  DTW domain-containing protein  40.49 
 
 		 215 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0983717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1565  hypothetical protein  39.18 
 
 		 200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0932097  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  37.2 
 
 		 207 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1739  DTW domain-containing protein  40.51 
 
 		 204 aa  125  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.438659 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  38.02 
 
 		 197 aa  124  9e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  36.23 
 
 		 207 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1820  DTW domain containing protein  41.41 
 
 		 202 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  39.15 
 
 		 200 aa  123  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  39.7 
 
 		 209 aa  123  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1899  DTW domain containing protein  41.29 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  39.67 
 
 		 188 aa  122  4e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0256  DTW domain-containing protein  36.22 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3749  DTW domain-containing protein  39.15 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  37.37 
 
 		 201 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  35.27 
 
 		 207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  34.65 
 
 		 203 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0889  DTW domain-containing protein  35.15 
 
 		 208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1830  DTW domain-containing protein  46.23 
 
 		 212 aa  116  3e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4292  DTW domain-containing protein  35.33 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.616546  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1461  DTW domain containing protein  37.16 
 
 		 246 aa  112  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0317  DTW domain-containing protein  37.5 
 
 		 211 aa  112  4.0000000000000004e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  35.71 
 
 		 223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3314  hypothetical protein  42.47 
 
 		 201 aa  111  6e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3586  DTW domain-containing protein  38.38 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004037  hypothetical protein  33.5 
 
 		 204 aa  109  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1758  DTW domain containing protein  40.5 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.370644  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1957  DTW domain-containing protein  40 
 
 		 227 aa  107  2e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0676  hypothetical protein  39.51 
 
 		 183 aa  106  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390701  unclonable  0.0000000107509 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4270  DTW domain-containing protein  36.11 
 
 		 181 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2401  DTW domain-containing protein  40.62 
 
 		 205 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663769  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2149  DTW domain-containing protein  34.15 
 
 		 243 aa  104  9e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0863  DTW  39.66 
 
 		 198 aa  102  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0091  DTW domain-containing protein  43.24 
 
 		 215 aa  101  6e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0255  DTW domain-containing protein  37.5 
 
 		 174 aa  101  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  36.84 
 
 		 241 aa  99  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3493  hypothetical protein  33.33 
 
 		 205 aa  98.6  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2829  DTW domain-containing protein  36.09 
 
 		 200 aa  98.2  8e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1429  hypothetical protein  39.88 
 
 		 201 aa  96.3  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1520  hypothetical protein  34.3 
 
 		 237 aa  89  4e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0474866  normal  0.0473662 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2518  DTW domain containing protein  40.48 
 
 		 201 aa  88.6  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2561  DTW  33.99 
 
 		 243 aa  88.2  7e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0180989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01424  hypothetical protein  34.34 
 
 		 171 aa  88.2  7e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2431  DTW domain containing protein  39.88 
 
 		 201 aa  87  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2572  hypothetical protein  34.52 
 
 		 243 aa  87  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2845  DTW domain containing protein  35.41 
 
 		 243 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3422  hypothetical protein  32.09 
 
 		 202 aa  83.2  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04079  DTW domain containing protein  28.24 
 
 		 194 aa  82.8  0.000000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0179  DTW  32.45 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.165291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2062  hypothetical protein  32.49 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_93924  predicted protein  31.16 
 
 		 252 aa  81.3  0.000000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0426424 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  30.65 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  30.65 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  30.65 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  30.65 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  34.59 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  30.65 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  30.65 
 
 		 232 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  30.65 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  30.65 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02441  hypothetical protein  30.65 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  33.86 
 
 		 247 aa  79  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3492  DTW domain containing protein  34.64 
 
 		 244 aa  77.8  0.00000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  31.49 
 
 		 247 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2899  DTW  30.85 
 
 		 243 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.124472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  30.81 
 
 		 201 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1535  hypothetical protein  33.52 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  33.52 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003511  putative cytoplasmic protein  27.37 
 
 		 264 aa  75.5  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3935  hypothetical protein  33.17 
 
 		 246 aa  74.7  0.0000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  29.35 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  29.9 
 
 		 237 aa  73.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  25.4 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  27.41 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  34.43 
 
 		 244 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1229  DTW domain-containing protein  29.94 
 
 		 185 aa  72.4  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  29.47 
 
 		 236 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  30.37 
 
 		 254 aa  72  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17650  hypothetical protein  32.95 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  30.37 
 
 		 254 aa  72  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  29.47 
 
 		 236 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  29.47 
 
 		 236 aa  72  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  30.37 
 
 		 254 aa  72  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  27.75 
 
 		 256 aa  72  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  30.37 
 
 		 254 aa  72  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  30.46 
 
 		 226 aa  71.2  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  28.42 
 
 		 251 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  31.09 
 
 		 232 aa  70.9  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  27.14 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>