114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1520 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1520  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  482  1e-135  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0474866  normal  0.0473662 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2062  hypothetical protein  76.23 
 
 		 238 aa  355  2.9999999999999997e-97  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2561  DTW  65.55 
 
 		 243 aa  333  2e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0180989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2572  hypothetical protein  69.12 
 
 		 243 aa  311  6.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2899  DTW  65.9 
 
 		 243 aa  304  9.000000000000001e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.124472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2845  DTW domain containing protein  63.32 
 
 		 243 aa  297  7e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3935  hypothetical protein  58.12 
 
 		 246 aa  293  2e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  33.99 
 
 		 213 aa  97.4  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0889  DTW domain-containing protein  29.38 
 
 		 208 aa  97.1  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458899  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  33.5 
 
 		 197 aa  96.7  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  36.82 
 
 		 197 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  35.18 
 
 		 199 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  35.18 
 
 		 199 aa  92  6e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  31.82 
 
 		 200 aa  92  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  35.18 
 
 		 197 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  34.17 
 
 		 199 aa  90.1  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  34.3 
 
 		 199 aa  89  6e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  30.23 
 
 		 201 aa  87.4  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  33 
 
 		 199 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  30.95 
 
 		 209 aa  85.9  5e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  30.24 
 
 		 207 aa  85.9  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3749  DTW domain-containing protein  32.28 
 
 		 188 aa  85.5  7e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  30.24 
 
 		 207 aa  85.1  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  31.38 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2058  DTW  29.21 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  29.76 
 
 		 207 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  30.58 
 
 		 241 aa  82  0.000000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  33.5 
 
 		 199 aa  81.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1565  hypothetical protein  30.19 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0932097  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1739  DTW domain-containing protein  31.34 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.438659 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1899  DTW domain containing protein  29.86 
 
 		 203 aa  78.6  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46020  hypothetical protein  34.16 
 
 		 203 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.637513  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3914  hypothetical protein  33.84 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0256  DTW domain-containing protein  27.86 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1820  DTW domain containing protein  29.41 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  28.1 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0945  DTW domain-containing protein  28.64 
 
 		 215 aa  75.9  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0983717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  27.98 
 
 		 223 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004037  hypothetical protein  30.29 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4270  DTW domain-containing protein  31.15 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_93924  predicted protein  26.03 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0426424 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1830  DTW domain-containing protein  31.02 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1758  DTW domain containing protein  29.1 
 
 		 227 aa  68.6  0.00000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.370644  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1957  DTW domain-containing protein  29.1 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0091  DTW domain-containing protein  29.44 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4292  DTW domain-containing protein  28.93 
 
 		 196 aa  65.1  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.616546  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3586  DTW domain-containing protein  29.1 
 
 		 200 aa  64.7  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2829  DTW domain-containing protein  27.01 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0863  DTW  26.23 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3493  hypothetical protein  38.83 
 
 		 205 aa  62.4  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2149  DTW domain-containing protein  24.47 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3422  hypothetical protein  29.8 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1429  hypothetical protein  29.17 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0317  DTW domain-containing protein  28.14 
 
 		 211 aa  58.5  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0255  DTW domain-containing protein  31.46 
 
 		 174 aa  58.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3956  DTW  27.97 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222792  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  28.65 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  27.68 
 
 		 247 aa  55.5  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  25.64 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0179  DTW  29.41 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.165291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1535  hypothetical protein  25.54 
 
 		 238 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2401  DTW domain-containing protein  27.33 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  24.75 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2431  DTW domain containing protein  28.12 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2518  DTW domain containing protein  28.12 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0676  hypothetical protein  23.76 
 
 		 183 aa  53.1  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390701  unclonable  0.0000000107509 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  25.47 
 
 		 201 aa  52.8  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3314  hypothetical protein  25.39 
 
 		 201 aa  52.8  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04079  DTW domain containing protein  24.04 
 
 		 194 aa  52.8  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  21.67 
 
 		 267 aa  51.6  0.000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  26.02 
 
 		 239 aa  51.6  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3314  DTW domain containing protein  26.32 
 
 		 248 aa  51.6  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1565  DTW domain-containing protein  39.71 
 
 		 167 aa  50.8  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  25.4 
 
 		 245 aa  50.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1461  DTW domain containing protein  28.72 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  24.02 
 
 		 252 aa  49.7  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4284  DTW domain-containing protein  36.26 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  28.49 
 
 		 232 aa  49.3  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2613  hypothetical protein  35.8 
 
 		 177 aa  48.5  0.00009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17650  hypothetical protein  26.52 
 
 		 238 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2330  DTW domain-containing protein  23.63 
 
 		 249 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000604871  normal  0.102486 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3007  DTW domain containing protein  34.29 
 
 		 175 aa  48.1  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000157344  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3616  hypothetical protein  25.83 
 
 		 152 aa  47.4  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337798  hitchhiker  0.00610419 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01424  hypothetical protein  35.16 
 
 		 171 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  32.22 
 
 		 247 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  25.99 
 
 		 244 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  25.27 
 
 		 249 aa  46.2  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  24.14 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  24.14 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  25.7 
 
 		 236 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  24.14 
 
 		 232 aa  45.8  0.0005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  24.88 
 
 		 232 aa  46.2  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  22.6 
 
 		 249 aa  45.8  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  22.45 
 
 		 290 aa  45.4  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  24.14 
 
 		 232 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  24.14 
 
 		 232 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  24.14 
 
 		 232 aa  45.4  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  24 
 
 		 256 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1229  DTW domain-containing protein  28.8 
 
 		 185 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  25.56 
 
 		 228 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>