149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3812 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  100 
 
 		 199 aa  400  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  81.73 
 
 		 199 aa  330  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  82.23 
 
 		 199 aa  329  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  82.23 
 
 		 199 aa  329  2e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  73.6 
 
 		 197 aa  286  1e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  71.43 
 
 		 197 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  67.01 
 
 		 199 aa  267  7e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  65.15 
 
 		 199 aa  262  3e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  63.78 
 
 		 213 aa  236  2e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46020  hypothetical protein  63.96 
 
 		 203 aa  234  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.637513  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3914  hypothetical protein  63.45 
 
 		 203 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  40.5 
 
 		 209 aa  135  4e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1565  hypothetical protein  38.19 
 
 		 200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0932097  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3586  DTW domain-containing protein  43.5 
 
 		 200 aa  125  5e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1461  DTW domain containing protein  38.59 
 
 		 246 aa  125  6e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2058  DTW  42 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004037  hypothetical protein  35.61 
 
 		 204 aa  121  8e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  39.9 
 
 		 241 aa  121  8e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0256  DTW domain-containing protein  35.68 
 
 		 197 aa  119  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  36.08 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  37.24 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  35.71 
 
 		 201 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  37.24 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  34.33 
 
 		 203 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1899  DTW domain containing protein  40.4 
 
 		 203 aa  116  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1820  DTW domain containing protein  41.58 
 
 		 202 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  37.31 
 
 		 200 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  36.14 
 
 		 207 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1739  DTW domain-containing protein  42.39 
 
 		 204 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.438659 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0945  DTW domain-containing protein  40.59 
 
 		 215 aa  112  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0983717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  36.32 
 
 		 188 aa  111  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0179  DTW  38.3 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.165291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01424  hypothetical protein  38.46 
 
 		 171 aa  109  2.0000000000000002e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0676  hypothetical protein  38.59 
 
 		 183 aa  109  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390701  unclonable  0.0000000107509 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3749  DTW domain-containing protein  36.32 
 
 		 188 aa  109  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4292  DTW domain-containing protein  34.87 
 
 		 196 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.616546  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3314  hypothetical protein  42.25 
 
 		 201 aa  107  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  33.68 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0889  DTW domain-containing protein  32.66 
 
 		 208 aa  106  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1957  DTW domain-containing protein  40.33 
 
 		 227 aa  105  5e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1830  DTW domain-containing protein  43.33 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1758  DTW domain containing protein  39.78 
 
 		 227 aa  105  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.370644  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2149  DTW domain-containing protein  36.32 
 
 		 243 aa  102  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0317  DTW domain-containing protein  37.04 
 
 		 211 aa  101  6e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4270  DTW domain-containing protein  38.46 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3422  hypothetical protein  34.76 
 
 		 202 aa  95.9  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0863  DTW  35.86 
 
 		 198 aa  95.5  4e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2845  DTW domain containing protein  33.65 
 
 		 243 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2561  DTW  30.94 
 
 		 243 aa  93.2  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0180989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0255  DTW domain-containing protein  33.53 
 
 		 174 aa  92  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1229  DTW domain-containing protein  32.77 
 
 		 185 aa  90.5  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2401  DTW domain-containing protein  40.26 
 
 		 205 aa  90.5  2e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2062  hypothetical protein  31.75 
 
 		 238 aa  89.4  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1520  hypothetical protein  33 
 
 		 237 aa  87.4  1e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0474866  normal  0.0473662 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0091  DTW domain-containing protein  36.41 
 
 		 215 aa  87.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2572  hypothetical protein  31.66 
 
 		 243 aa  86.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2829  DTW domain-containing protein  33.54 
 
 		 200 aa  86.7  2e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2899  DTW  31.66 
 
 		 243 aa  85.5  5e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.124472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  31.95 
 
 		 201 aa  84.7  8e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1429  hypothetical protein  35.14 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3935  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3493  hypothetical protein  29.21 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  33.33 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  33.33 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  33.33 
 
 		 232 aa  82.4  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  33.33 
 
 		 232 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  31.33 
 
 		 236 aa  81.3  0.000000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02441  hypothetical protein  33.33 
 
 		 232 aa  81.3  0.000000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  32.73 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  33.13 
 
 		 232 aa  80.5  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  32.73 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  32.73 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  31.96 
 
 		 247 aa  79.3  0.00000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04079  DTW domain containing protein  27.27 
 
 		 194 aa  79  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02075  hypothetical cytosolic protein  29.83 
 
 		 230 aa  78.2  0.00000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0853  DTW domain containing protein  33.33 
 
 		 238 aa  77.8  0.00000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_93924  predicted protein  33.17 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0426424 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1535  hypothetical protein  31.35 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  32.22 
 
 		 249 aa  76.6  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  32.12 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2431  DTW domain containing protein  35.14 
 
 		 201 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  28.57 
 
 		 247 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2760  DTW domain protein  30.3 
 
 		 226 aa  74.7  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00353783  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2518  DTW domain containing protein  34.59 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  31.52 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3492  DTW domain containing protein  34.36 
 
 		 244 aa  74.3  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  31.52 
 
 		 236 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  31.52 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  26.7 
 
 		 247 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2866  DTW domain-containing protein  30.3 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2862  DTW domain protein  30.3 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  0.735331 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2978  hypothetical protein  30.3 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  28.72 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  29.59 
 
 		 226 aa  71.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  30.3 
 
 		 236 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  28.66 
 
 		 195 aa  71.6  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00304  hypothetical protein  31.85 
 
 		 170 aa  71.6  0.000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17650  hypothetical protein  28.65 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  26.7 
 
 		 252 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  28.28 
 
 		 245 aa  68.6  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>