142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1966 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  100 
 
 		 249 aa  511  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  67.47 
 
 		 247 aa  356  1.9999999999999998e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2330  DTW domain-containing protein  68.55 
 
 		 249 aa  338  5e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000604871  normal  0.102486 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2086  DTW domain-containing protein  60.82 
 
 		 253 aa  323  1e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  62.3 
 
 		 254 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  62.3 
 
 		 254 aa  322  4e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  62.3 
 
 		 254 aa  322  4e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  62.3 
 
 		 254 aa  322  4e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  61.6 
 
 		 256 aa  321  6e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  58.59 
 
 		 290 aa  319  3e-86  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  59.84 
 
 		 254 aa  314  7e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  59.84 
 
 		 254 aa  314  8e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  60.25 
 
 		 254 aa  314  8e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  59.43 
 
 		 251 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  55.82 
 
 		 267 aa  299  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  55.95 
 
 		 252 aa  281  9e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1391  hypothetical protein  52.49 
 
 		 247 aa  246  2e-64  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  45.65 
 
 		 239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003511  putative cytoplasmic protein  39.83 
 
 		 264 aa  204  9e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1543  DTW domain-containing protein  43.7 
 
 		 266 aa  202  3e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  42.86 
 
 		 245 aa  194  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  45.41 
 
 		 244 aa  188  7e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17650  hypothetical protein  44.35 
 
 		 238 aa  186  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3956  DTW  44.26 
 
 		 245 aa  183  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222792  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1535  hypothetical protein  43.86 
 
 		 238 aa  182  6e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3314  DTW domain containing protein  41.15 
 
 		 248 aa  181  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  41.81 
 
 		 236 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  42.08 
 
 		 234 aa  179  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  41.67 
 
 		 247 aa  178  7e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0900  DTW domain-containing protein  40.6 
 
 		 281 aa  177  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  42.34 
 
 		 232 aa  174  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  40.69 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02075  hypothetical cytosolic protein  42.29 
 
 		 230 aa  172  5e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2760  DTW domain protein  44.13 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00353783  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  42.24 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2862  DTW domain protein  43.66 
 
 		 226 aa  171  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  0.735331 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3492  DTW domain containing protein  42.44 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2866  DTW domain-containing protein  43.19 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  41.78 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3320  DTW domain containing protein  44.68 
 
 		 283 aa  170  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0873606  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  44.62 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  41.78 
 
 		 236 aa  170  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0853  DTW domain containing protein  46.39 
 
 		 238 aa  169  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  43.19 
 
 		 226 aa  169  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  40.36 
 
 		 236 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  45.99 
 
 		 228 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1382  DTW  44.6 
 
 		 236 aa  168  6e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3970  DTW domain-containing protein  44.68 
 
 		 253 aa  168  8e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163584 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  44.1 
 
 		 249 aa  168  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  41.86 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  41.31 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  41.78 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  41.86 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  41.78 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  41.78 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  41.86 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2978  hypothetical protein  42.72 
 
 		 226 aa  165  5e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  41.78 
 
 		 232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02441  hypothetical protein  41.78 
 
 		 232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  41.31 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4750  hypothetical protein  40.93 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565927  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4284  DTW domain-containing protein  40.17 
 
 		 241 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  37.1 
 
 		 247 aa  154  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3068  DTW domain-containing protein  41.78 
 
 		 232 aa  152  5.9999999999999996e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118921 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  38.6 
 
 		 245 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2540  DTW domain-containing protein  35.81 
 
 		 236 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.565238 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02256  hypothetical protein  40.8 
 
 		 194 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  31.55 
 
 		 201 aa  104  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  31.11 
 
 		 195 aa  103  3e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00304  hypothetical protein  27.78 
 
 		 170 aa  91.3  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  28.8 
 
 		 209 aa  85.5  8e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  28.57 
 
 		 197 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  27.46 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1565  hypothetical protein  24.61 
 
 		 200 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0932097  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0256  DTW domain-containing protein  29.21 
 
 		 197 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  29.3 
 
 		 198 aa  76.3  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  26.84 
 
 		 207 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2613  hypothetical protein  29.45 
 
 		 177 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  26.32 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3749  DTW domain-containing protein  25.84 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  26.32 
 
 		 207 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004037  hypothetical protein  26.38 
 
 		 204 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0149  DTW domain-containing protein  26.27 
 
 		 222 aa  71.2  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.768526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  26.32 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  27.14 
 
 		 199 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1306  DTW domain-containing protein  29.34 
 
 		 156 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  27.22 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0889  DTW domain-containing protein  28.65 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  26.67 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  27.5 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  27.46 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  27.14 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  27.46 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  26.04 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  26 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1461  DTW domain containing protein  22.97 
 
 		 246 aa  66.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04079  DTW domain containing protein  25.58 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0255  DTW domain-containing protein  32.26 
 
 		 174 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  24.08 
 
 		 203 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  29.84 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>