146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A2978 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A2978  hypothetical protein  100 
 
 		 226 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2866  DTW domain-containing protein  98.23 
 
 		 226 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2862  DTW domain protein  97.79 
 
 		 226 aa  454  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  0.735331 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  98.23 
 
 		 226 aa  456  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2760  DTW domain protein  97.79 
 
 		 226 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00353783  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  87.17 
 
 		 232 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  86.73 
 
 		 232 aa  407  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  87.17 
 
 		 232 aa  409  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  87.17 
 
 		 232 aa  409  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  86.73 
 
 		 232 aa  407  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  86.28 
 
 		 232 aa  404  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  86.28 
 
 		 232 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02441  hypothetical protein  86.28 
 
 		 232 aa  404  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  85.84 
 
 		 232 aa  403  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3068  DTW domain-containing protein  83.63 
 
 		 232 aa  362  2e-99  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118921 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3492  DTW domain containing protein  62.56 
 
 		 244 aa  285  5.999999999999999e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  63.01 
 
 		 249 aa  284  8e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  62.73 
 
 		 237 aa  279  2e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  63.96 
 
 		 234 aa  278  5e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0853  DTW domain containing protein  66.06 
 
 		 238 aa  270  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  61.06 
 
 		 249 aa  248  7e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  60.62 
 
 		 249 aa  246  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  60.19 
 
 		 228 aa  229  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  49.78 
 
 		 236 aa  218  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  49.33 
 
 		 236 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  49.33 
 
 		 236 aa  215  4e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  49.33 
 
 		 236 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  51.11 
 
 		 244 aa  208  5e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  47.96 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4750  hypothetical protein  47.23 
 
 		 252 aa  205  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565927  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1535  hypothetical protein  49.1 
 
 		 238 aa  204  7e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1382  DTW  49.32 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  50.7 
 
 		 232 aa  202  4e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17650  hypothetical protein  49.55 
 
 		 238 aa  202  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  47.22 
 
 		 239 aa  199  3e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0900  DTW domain-containing protein  47.19 
 
 		 281 aa  198  7e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1391  hypothetical protein  47 
 
 		 247 aa  197  1.0000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3970  DTW domain-containing protein  49.36 
 
 		 253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163584 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3956  DTW  45.81 
 
 		 245 aa  194  7e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222792  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3320  DTW domain containing protein  48.94 
 
 		 283 aa  194  9e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0873606  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3314  DTW domain containing protein  46.02 
 
 		 248 aa  192  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  46.64 
 
 		 247 aa  192  5e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02075  hypothetical cytosolic protein  48.36 
 
 		 230 aa  192  5e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  43.48 
 
 		 252 aa  191  9e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  42.67 
 
 		 245 aa  190  2e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1543  DTW domain-containing protein  42.29 
 
 		 266 aa  182  3e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2086  DTW domain-containing protein  42.54 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  43.87 
 
 		 247 aa  179  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  43.89 
 
 		 254 aa  178  7e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  43.89 
 
 		 254 aa  178  8e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  43.89 
 
 		 254 aa  178  8e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  43.89 
 
 		 254 aa  178  8e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  40.77 
 
 		 290 aa  176  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  43.89 
 
 		 256 aa  175  4e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  43.89 
 
 		 254 aa  175  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  43.27 
 
 		 247 aa  175  6e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  43.89 
 
 		 254 aa  174  7e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  43.44 
 
 		 251 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  43.44 
 
 		 254 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4284  DTW domain-containing protein  46.05 
 
 		 241 aa  171  7.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2330  DTW domain-containing protein  43.6 
 
 		 249 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000604871  normal  0.102486 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003511  putative cytoplasmic protein  40.71 
 
 		 264 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  42.72 
 
 		 249 aa  165  4e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  39.56 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02256  hypothetical protein  40.46 
 
 		 194 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2540  DTW domain-containing protein  34.39 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.565238 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  35.59 
 
 		 245 aa  124  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  33.15 
 
 		 195 aa  116  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  30 
 
 		 198 aa  97.4  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  29.67 
 
 		 201 aa  95.9  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00304  hypothetical protein  30.91 
 
 		 170 aa  92  6e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1306  DTW domain-containing protein  33.54 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  32.52 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  32.52 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  32.14 
 
 		 199 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  30.67 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1919  DTW domain-containing protein  33.76 
 
 		 164 aa  75.5  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1254  DTW domain-containing protein  33.12 
 
 		 161 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000011005  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  31.68 
 
 		 197 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  30.3 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2386  DTW domain-containing protein  31.14 
 
 		 171 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1565  DTW domain-containing protein  33.12 
 
 		 167 aa  72  0.000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  29.95 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  30.86 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1461  DTW domain containing protein  31.37 
 
 		 246 aa  69.7  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2613  hypothetical protein  29.7 
 
 		 177 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  31.03 
 
 		 241 aa  68.9  0.00000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2326  DTW domain-containing protein  32.62 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.644426  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2423  hypothetical protein  28.3 
 
 		 179 aa  67.4  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.310346  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2099  DTW domain-containing protein  29.94 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0256  DTW domain-containing protein  26.83 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3007  DTW domain containing protein  30.57 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000157344  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  31.25 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3616  hypothetical protein  31.1 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337798  hitchhiker  0.00610419 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2058  DTW  31.55 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1830  DTW domain-containing protein  29.38 
 
 		 212 aa  64.7  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  29.45 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46020  hypothetical protein  31.48 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.637513  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2326  DTW domain-containing protein  31.18 
 
 		 186 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2020  DTW domain containing protein  30.65 
 
 		 186 aa  63.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.443073  hitchhiker  0.00543273 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>