145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0886 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  100 
 
 
237 aa  489  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0853  DTW domain containing protein  81.09 
 
 
238 aa  366  1e-100  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3492  DTW domain containing protein  74.79 
 
 
244 aa  364  1e-100  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  75.54 
 
 
249 aa  358  3e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  68.35 
 
 
234 aa  295  6e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  64.55 
 
 
232 aa  293  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  64.55 
 
 
232 aa  293  2e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  64.55 
 
 
232 aa  293  2e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  64.55 
 
 
232 aa  293  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  64.55 
 
 
232 aa  292  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  64.55 
 
 
232 aa  292  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  64.09 
 
 
232 aa  290  1e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  64.09 
 
 
232 aa  289  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02441  hypothetical protein  64.09 
 
 
232 aa  289  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2862  DTW domain protein  64.09 
 
 
226 aa  287  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  0.735331 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2866  DTW domain-containing protein  64.09 
 
 
226 aa  287  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2760  DTW domain protein  63.64 
 
 
226 aa  284  8e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00353783  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  63.18 
 
 
226 aa  284  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2978  hypothetical protein  62.73 
 
 
226 aa  279  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  66.82 
 
 
249 aa  272  4.0000000000000004e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  66.36 
 
 
249 aa  270  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  66.04 
 
 
228 aa  256  2e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3068  DTW domain-containing protein  62.21 
 
 
232 aa  249  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118921 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  51.39 
 
 
236 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1535  hypothetical protein  50 
 
 
238 aa  201  7e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17650  hypothetical protein  48.23 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  50.46 
 
 
236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  50.46 
 
 
236 aa  198  7e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  51.16 
 
 
244 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  50.46 
 
 
236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  48.15 
 
 
236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4750  hypothetical protein  49.34 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565927  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1391  hypothetical protein  46.12 
 
 
247 aa  197  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  49.3 
 
 
247 aa  194  9e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  50.24 
 
 
232 aa  193  2e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3956  DTW  48.86 
 
 
245 aa  192  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222792  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  44.75 
 
 
239 aa  192  3e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1382  DTW  49.32 
 
 
236 aa  191  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02075  hypothetical cytosolic protein  46.26 
 
 
230 aa  190  2e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  43.88 
 
 
254 aa  188  8e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  43.88 
 
 
254 aa  188  8e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  43.88 
 
 
254 aa  188  8e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  44.1 
 
 
254 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0900  DTW domain-containing protein  47.64 
 
 
281 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3970  DTW domain-containing protein  50 
 
 
253 aa  185  5e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163584 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  44.54 
 
 
254 aa  185  6e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  44.54 
 
 
254 aa  184  8e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  46.15 
 
 
247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  40.17 
 
 
247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3320  DTW domain containing protein  50 
 
 
283 aa  183  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0873606  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  42.62 
 
 
256 aa  182  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  44.1 
 
 
251 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  43.58 
 
 
252 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  43.78 
 
 
267 aa  181  6e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  43.23 
 
 
254 aa  181  7e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1543  DTW domain-containing protein  42.32 
 
 
266 aa  179  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2086  DTW domain-containing protein  41.67 
 
 
253 aa  178  8e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  40.66 
 
 
290 aa  175  7e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  40.69 
 
 
249 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3314  DTW domain containing protein  42.49 
 
 
248 aa  173  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003511  putative cytoplasmic protein  39.65 
 
 
264 aa  172  5e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  40.81 
 
 
245 aa  167  2e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2330  DTW domain-containing protein  39.3 
 
 
249 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000604871  normal  0.102486 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4284  DTW domain-containing protein  46.41 
 
 
241 aa  163  2.0000000000000002e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  40.62 
 
 
245 aa  151  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2540  DTW domain-containing protein  37.04 
 
 
236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.565238 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02256  hypothetical protein  38.95 
 
 
194 aa  125  5e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  32.65 
 
 
195 aa  116  3e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  31.72 
 
 
201 aa  102  7e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  30.43 
 
 
198 aa  99.4  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00304  hypothetical protein  32.12 
 
 
170 aa  94.7  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1254  DTW domain-containing protein  34.52 
 
 
161 aa  89.4  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000011005  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2386  DTW domain-containing protein  34.13 
 
 
171 aa  85.9  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1919  DTW domain-containing protein  37.82 
 
 
164 aa  85.1  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1306  DTW domain-containing protein  33.76 
 
 
156 aa  82  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  30.05 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3616  hypothetical protein  32.74 
 
 
152 aa  79.7  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337798  hitchhiker  0.00610419 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3007  DTW domain containing protein  31.61 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000157344  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  31.25 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  29.9 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  29.9 
 
 
199 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2099  DTW domain-containing protein  32.77 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  30.9 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  28.87 
 
 
199 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1565  DTW domain-containing protein  31.85 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2423  hypothetical protein  28.93 
 
 
179 aa  71.6  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.310346  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  28.35 
 
 
199 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2326  DTW domain-containing protein  31.52 
 
 
187 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.644426  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1461  DTW domain containing protein  28.5 
 
 
246 aa  69.3  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  27.88 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  29.95 
 
 
213 aa  68.6  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  27.32 
 
 
199 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0149  DTW domain-containing protein  30.6 
 
 
222 aa  67  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.768526  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2326  DTW domain-containing protein  31.55 
 
 
186 aa  67  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  24.19 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2442  DTW domain-containing protein  31.69 
 
 
186 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2613  hypothetical protein  26.82 
 
 
177 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  29.7 
 
 
209 aa  64.3  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  25.15 
 
 
203 aa  64.3  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2020  DTW domain containing protein  31.18 
 
 
186 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.443073  hitchhiker  0.00543273 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>