138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2613 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2613  hypothetical protein  100 
 
 		 177 aa  360  9e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1306  DTW domain-containing protein  45.75 
 
 		 156 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2326  DTW domain-containing protein  38.04 
 
 		 187 aa  111  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.644426  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2008  DTW domain-containing protein  39.89 
 
 		 174 aa  108  3e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0597525  hitchhiker  0.00247146 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2442  DTW domain-containing protein  38.59 
 
 		 186 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2020  DTW domain containing protein  38.59 
 
 		 186 aa  107  6e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.443073  hitchhiker  0.00543273 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2326  DTW domain-containing protein  38.59 
 
 		 186 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2386  DTW domain-containing protein  35.36 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2099  DTW domain-containing protein  36.02 
 
 		 189 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1919  DTW domain-containing protein  39.39 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1254  DTW domain-containing protein  35.26 
 
 		 161 aa  99.8  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000011005  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1565  DTW domain-containing protein  37.58 
 
 		 167 aa  99  3e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3007  DTW domain containing protein  35.29 
 
 		 175 aa  95.9  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000157344  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  37.2 
 
 		 201 aa  92.4  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2595  DTW domain-containing protein  35.85 
 
 		 168 aa  91.7  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.270595 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3616  hypothetical protein  37.09 
 
 		 152 aa  89.4  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337798  hitchhiker  0.00610419 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  34.73 
 
 		 195 aa  89  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00304  hypothetical protein  36.97 
 
 		 170 aa  88.6  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  30.41 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  31.61 
 
 		 247 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  33.72 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  28.57 
 
 		 247 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2540  DTW domain-containing protein  26.22 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.565238 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  31.21 
 
 		 236 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  31.21 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3956  DTW  33.33 
 
 		 245 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222792  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3068  DTW domain-containing protein  31.85 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118921 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  31.21 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  32.91 
 
 		 236 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  31.17 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  31.17 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  34.13 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  31.17 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  31.17 
 
 		 254 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2423  hypothetical protein  31.01 
 
 		 179 aa  75.1  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.310346  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  29.09 
 
 		 290 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  30.51 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  31.85 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  31.85 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  29.45 
 
 		 249 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  29.48 
 
 		 245 aa  74.7  0.0000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  31.85 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1391  hypothetical protein  31.87 
 
 		 247 aa  74.7  0.0000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  31.85 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  31.85 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  31.85 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  31.85 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  31.85 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02441  hypothetical protein  31.85 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  29.38 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  30.51 
 
 		 254 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  29.38 
 
 		 256 aa  73.6  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2760  DTW domain protein  30.3 
 
 		 226 aa  72.8  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00353783  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2866  DTW domain-containing protein  30.3 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  30.3 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2862  DTW domain protein  30.3 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  0.735331 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  30.56 
 
 		 254 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0900  DTW domain-containing protein  33.54 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3320  DTW domain containing protein  33.54 
 
 		 283 aa  72  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0873606  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1535  hypothetical protein  32.39 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  29.31 
 
 		 234 aa  71.6  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  29.94 
 
 		 236 aa  71.6  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3314  DTW domain containing protein  30.99 
 
 		 248 aa  70.9  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17650  hypothetical protein  31.11 
 
 		 238 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02075  hypothetical cytosolic protein  27.06 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2978  hypothetical protein  29.7 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3970  DTW domain-containing protein  33.54 
 
 		 253 aa  69.3  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163584 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  30.46 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4750  hypothetical protein  31.9 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565927  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2086  DTW domain-containing protein  26.67 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  30.46 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  32.18 
 
 		 244 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  30.46 
 
 		 249 aa  68.2  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  27.84 
 
 		 252 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02256  hypothetical protein  27.65 
 
 		 194 aa  67.8  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  31.52 
 
 		 249 aa  67.8  0.00000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003511  putative cytoplasmic protein  27.98 
 
 		 264 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0853  DTW domain containing protein  33.97 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  26.82 
 
 		 237 aa  65.9  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1543  DTW domain-containing protein  27.27 
 
 		 266 aa  65.1  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  29.52 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  30.32 
 
 		 239 aa  63.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4284  DTW domain-containing protein  29.49 
 
 		 241 aa  63.2  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  25.86 
 
 		 245 aa  62  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_93924  predicted protein  42.5 
 
 		 252 aa  62  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0426424 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3492  DTW domain containing protein  29.76 
 
 		 244 aa  62  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2330  DTW domain-containing protein  27.38 
 
 		 249 aa  61.6  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000604871  normal  0.102486 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  25 
 
 		 267 aa  58.9  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1382  DTW  32.48 
 
 		 236 aa  57  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3586  DTW domain-containing protein  29.03 
 
 		 200 aa  54.7  0.0000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2845  DTW domain containing protein  30.16 
 
 		 243 aa  54.7  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2899  DTW  29.82 
 
 		 243 aa  54.3  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.124472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1461  DTW domain containing protein  26.71 
 
 		 246 aa  53.9  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2062  hypothetical protein  29.44 
 
 		 238 aa  52.4  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2572  hypothetical protein  25.58 
 
 		 243 aa  51.6  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  27.06 
 
 		 197 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0889  DTW domain-containing protein  32.98 
 
 		 208 aa  50.8  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2561  DTW  34.57 
 
 		 243 aa  50.4  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0180989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2058  DTW  32.35 
 
 		 203 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  26.74 
 
 		 213 aa  49.7  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>