151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_1094 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  100 
 
 
232 aa  479  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  99.57 
 
 
232 aa  477  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  100 
 
 
232 aa  479  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  100 
 
 
232 aa  479  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  99.57 
 
 
232 aa  477  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  99.14 
 
 
232 aa  474  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  99.14 
 
 
232 aa  476  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02441  hypothetical protein  99.14 
 
 
232 aa  474  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  98.71 
 
 
232 aa  473  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2866  DTW domain-containing protein  88.5 
 
 
226 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2862  DTW domain protein  88.05 
 
 
226 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  0.735331 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2760  DTW domain protein  88.05 
 
 
226 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00353783  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  87.61 
 
 
226 aa  413  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2978  hypothetical protein  87.17 
 
 
226 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3068  DTW domain-containing protein  81.47 
 
 
232 aa  368  1e-101  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118921 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  61.76 
 
 
249 aa  298  6e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3492  DTW domain containing protein  60.92 
 
 
244 aa  295  3e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  64.55 
 
 
237 aa  293  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  63.32 
 
 
234 aa  282  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0853  DTW domain containing protein  66.06 
 
 
238 aa  278  4e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  61.64 
 
 
249 aa  269  4e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  61.21 
 
 
249 aa  267  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  63.33 
 
 
228 aa  251  7e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  50.23 
 
 
236 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  50.23 
 
 
236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  49.77 
 
 
236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  49.77 
 
 
236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  48.85 
 
 
236 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  51.15 
 
 
244 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  47.49 
 
 
239 aa  211  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1535  hypothetical protein  50 
 
 
238 aa  210  1e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0900  DTW domain-containing protein  47.83 
 
 
281 aa  209  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17650  hypothetical protein  49.08 
 
 
238 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1382  DTW  49.54 
 
 
236 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  51.18 
 
 
232 aa  206  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1391  hypothetical protein  46.58 
 
 
247 aa  202  3e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  42.92 
 
 
245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  44.35 
 
 
252 aa  199  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3314  DTW domain containing protein  45.54 
 
 
248 aa  198  5e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3970  DTW domain-containing protein  48.77 
 
 
253 aa  198  5e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163584 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1543  DTW domain-containing protein  44.49 
 
 
266 aa  197  9e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4750  hypothetical protein  45.45 
 
 
252 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565927  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3320  DTW domain containing protein  47.95 
 
 
283 aa  196  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0873606  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02075  hypothetical cytosolic protein  47.89 
 
 
230 aa  194  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  47 
 
 
247 aa  193  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  45.28 
 
 
247 aa  191  6e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  45.7 
 
 
254 aa  191  7e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3956  DTW  45.41 
 
 
245 aa  190  1e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222792  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2086  DTW domain-containing protein  44.44 
 
 
253 aa  191  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  45.7 
 
 
254 aa  190  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  45.7 
 
 
254 aa  190  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  44.8 
 
 
256 aa  190  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  44.34 
 
 
254 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  44.34 
 
 
254 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  44.34 
 
 
254 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  44.34 
 
 
254 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  44.2 
 
 
251 aa  188  7e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  44.71 
 
 
247 aa  185  7e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  40.34 
 
 
290 aa  180  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003511  putative cytoplasmic protein  41.67 
 
 
264 aa  178  8e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4284  DTW domain-containing protein  45.45 
 
 
241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2330  DTW domain-containing protein  43.13 
 
 
249 aa  172  5e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000604871  normal  0.102486 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  40.89 
 
 
267 aa  172  5e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  41.86 
 
 
249 aa  167  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02256  hypothetical protein  43.6 
 
 
194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  36.49 
 
 
245 aa  139  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2540  DTW domain-containing protein  33.63 
 
 
236 aa  132  6e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.565238 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  35.36 
 
 
195 aa  123  3e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  32.22 
 
 
198 aa  109  5e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  32.6 
 
 
201 aa  108  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00304  hypothetical protein  34.34 
 
 
170 aa  94.7  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1306  DTW domain-containing protein  35.37 
 
 
156 aa  89.7  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  33.95 
 
 
199 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  33.95 
 
 
199 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2386  DTW domain-containing protein  34.71 
 
 
171 aa  87  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1919  DTW domain-containing protein  35.03 
 
 
164 aa  85.1  8e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  33.33 
 
 
199 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2326  DTW domain-containing protein  33.87 
 
 
186 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  32.73 
 
 
199 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  30.65 
 
 
199 aa  80.1  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  34.16 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1565  DTW domain-containing protein  32.52 
 
 
167 aa  79.7  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1254  DTW domain-containing protein  34.39 
 
 
161 aa  79  0.00000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000011005  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2326  DTW domain-containing protein  31.55 
 
 
187 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.644426  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  32.92 
 
 
197 aa  79  0.00000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1461  DTW domain containing protein  30.11 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2442  DTW domain-containing protein  32.8 
 
 
186 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  31.18 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3616  hypothetical protein  33.12 
 
 
152 aa  75.9  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337798  hitchhiker  0.00610419 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2020  DTW domain containing protein  32.8 
 
 
186 aa  75.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.443073  hitchhiker  0.00543273 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2423  hypothetical protein  28.93 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.310346  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  29.65 
 
 
199 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2613  hypothetical protein  31.85 
 
 
177 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3007  DTW domain containing protein  31.85 
 
 
175 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000157344  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  28.4 
 
 
209 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2099  DTW domain-containing protein  29.38 
 
 
189 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2058  DTW  33.75 
 
 
203 aa  70.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1565  hypothetical protein  27.16 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0932097  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1830  DTW domain-containing protein  30.22 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0256  DTW domain-containing protein  27.5 
 
 
197 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>