149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1461 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1461  DTW domain containing protein  100 
 
 
246 aa  491  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3422  hypothetical protein  45.92 
 
 
202 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0179  DTW  46.23 
 
 
199 aa  155  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.165291  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1229  DTW domain-containing protein  49.17 
 
 
185 aa  150  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  38.59 
 
 
199 aa  125  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  36.76 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  37.5 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  36.76 
 
 
199 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  37.16 
 
 
199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  38.5 
 
 
197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  39.89 
 
 
213 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  36.27 
 
 
197 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  35.75 
 
 
199 aa  105  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1429  hypothetical protein  37.77 
 
 
201 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46020  hypothetical protein  37.43 
 
 
203 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.637513  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3914  hypothetical protein  37.77 
 
 
203 aa  98.6  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2431  DTW domain containing protein  38.3 
 
 
201 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2401  DTW domain-containing protein  37.36 
 
 
205 aa  96.3  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663769  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2518  DTW domain containing protein  37.77 
 
 
201 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  27.72 
 
 
252 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  29.38 
 
 
245 aa  78.6  0.00000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1391  hypothetical protein  25 
 
 
247 aa  77  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  27.23 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  27.23 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  27.23 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  27.23 
 
 
254 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  31.25 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  31.25 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  31.25 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  31.25 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  31.25 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  31.25 
 
 
232 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  31.58 
 
 
232 aa  75.5  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  30.23 
 
 
249 aa  75.1  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  30.64 
 
 
232 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02441  hypothetical protein  30.64 
 
 
232 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  30.24 
 
 
247 aa  73.6  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  29.65 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  28.11 
 
 
209 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  25.89 
 
 
239 aa  73.2  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  29.65 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0317  DTW domain-containing protein  29.95 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  31.67 
 
 
244 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2058  DTW  35.26 
 
 
203 aa  72  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1820  DTW domain containing protein  35.26 
 
 
202 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  26.24 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2540  DTW domain-containing protein  27.45 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.565238 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2086  DTW domain-containing protein  24.17 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0676  hypothetical protein  29.76 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390701  unclonable  0.0000000107509 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1535  hypothetical protein  28.19 
 
 
238 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  26.46 
 
 
247 aa  70.1  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1899  DTW domain containing protein  35.79 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17650  hypothetical protein  29.2 
 
 
238 aa  69.7  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  25.48 
 
 
256 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2978  hypothetical protein  31.37 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2862  DTW domain protein  30.26 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  0.735331 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  28.5 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  23.08 
 
 
247 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  30.26 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2866  DTW domain-containing protein  30.26 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  27.53 
 
 
198 aa  68.9  0.00000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  30.12 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3492  DTW domain containing protein  31.37 
 
 
244 aa  68.6  0.00000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  28.16 
 
 
236 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  31.69 
 
 
207 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  27 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  28.16 
 
 
236 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  32.24 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  28.16 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  32.24 
 
 
207 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  28.25 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  27.67 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2760  DTW domain protein  29.61 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00353783  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  22.97 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  30.07 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02075  hypothetical cytosolic protein  25.53 
 
 
230 aa  65.5  0.0000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  23.88 
 
 
251 aa  65.5  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04079  DTW domain containing protein  27.07 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1543  DTW domain-containing protein  23.45 
 
 
266 aa  64.7  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3007  DTW domain containing protein  29.3 
 
 
175 aa  64.7  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000157344  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  24.22 
 
 
267 aa  65.1  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  24.39 
 
 
254 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  31.79 
 
 
188 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2330  DTW domain-containing protein  24.52 
 
 
249 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000604871  normal  0.102486 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  29.09 
 
 
234 aa  64.3  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1739  DTW domain-containing protein  35.85 
 
 
204 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.438659 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  26.06 
 
 
201 aa  63.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3956  DTW  27.01 
 
 
245 aa  63.2  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222792  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  24.11 
 
 
254 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  25.24 
 
 
254 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1254  DTW domain-containing protein  29.63 
 
 
161 aa  62.8  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000011005  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3749  DTW domain-containing protein  30.64 
 
 
188 aa  62  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  26.99 
 
 
201 aa  62  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0149  DTW domain-containing protein  30.3 
 
 
222 aa  62  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.768526  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  26.01 
 
 
195 aa  61.6  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0853  DTW domain containing protein  31.76 
 
 
238 aa  61.6  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3586  DTW domain-containing protein  29.88 
 
 
200 aa  61.6  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3935  hypothetical protein  30.54 
 
 
246 aa  60.5  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  29.32 
 
 
241 aa  60.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  27.98 
 
 
223 aa  59.7  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>