146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_3397 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  100 
 
 		 239 aa  496  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  48.55 
 
 		 247 aa  246  3e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2086  DTW domain-containing protein  48.25 
 
 		 253 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  50.67 
 
 		 256 aa  238  4e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  49.37 
 
 		 254 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  49.37 
 
 		 254 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  49.37 
 
 		 254 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  50.67 
 
 		 254 aa  237  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  49.08 
 
 		 252 aa  234  7e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1391  hypothetical protein  51.14 
 
 		 247 aa  233  1.0000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17650  hypothetical protein  46.72 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1535  hypothetical protein  47.16 
 
 		 238 aa  229  4e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  49.33 
 
 		 254 aa  228  8e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  48.44 
 
 		 251 aa  227  1e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  48.44 
 
 		 254 aa  227  1e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  48.44 
 
 		 254 aa  226  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2330  DTW domain-containing protein  47.92 
 
 		 249 aa  226  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000604871  normal  0.102486 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1543  DTW domain-containing protein  47.93 
 
 		 266 aa  225  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  46.36 
 
 		 245 aa  223  2e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3956  DTW  48.18 
 
 		 245 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222792  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  45.57 
 
 		 290 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  46.3 
 
 		 236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  47.22 
 
 		 236 aa  220  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  47 
 
 		 236 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  46.76 
 
 		 236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  45.53 
 
 		 236 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  45.73 
 
 		 244 aa  217  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3314  DTW domain containing protein  43.51 
 
 		 248 aa  214  7e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  44.21 
 
 		 232 aa  213  1.9999999999999998e-54  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  43.75 
 
 		 267 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  47.95 
 
 		 232 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  47.95 
 
 		 232 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  47.95 
 
 		 232 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0900  DTW domain-containing protein  43.55 
 
 		 281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  45.65 
 
 		 249 aa  212  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  47.95 
 
 		 232 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02441  hypothetical protein  47.95 
 
 		 232 aa  212  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003511  putative cytoplasmic protein  43.81 
 
 		 264 aa  211  9e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  47.49 
 
 		 232 aa  211  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  47.49 
 
 		 232 aa  211  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  47.49 
 
 		 232 aa  211  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  47.49 
 
 		 232 aa  211  1e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1382  DTW  46.76 
 
 		 236 aa  209  4e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  42.86 
 
 		 247 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2862  DTW domain protein  47.95 
 
 		 226 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  0.735331 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2760  DTW domain protein  47.95 
 
 		 226 aa  206  4e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00353783  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2866  DTW domain-containing protein  47.95 
 
 		 226 aa  205  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  47.49 
 
 		 226 aa  204  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2978  hypothetical protein  47.22 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3068  DTW domain-containing protein  47.49 
 
 		 232 aa  197  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118921 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  44.91 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  45.29 
 
 		 234 aa  194  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4750  hypothetical protein  41.74 
 
 		 252 aa  193  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565927  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  44.75 
 
 		 237 aa  192  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3320  DTW domain containing protein  42.15 
 
 		 283 aa  191  7e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0873606  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3492  DTW domain containing protein  42.41 
 
 		 244 aa  190  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3970  DTW domain-containing protein  41.06 
 
 		 253 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163584 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0853  DTW domain containing protein  44.75 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02075  hypothetical cytosolic protein  45.15 
 
 		 230 aa  186  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4284  DTW domain-containing protein  40.89 
 
 		 241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  45.64 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  45.13 
 
 		 249 aa  178  7e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  45.26 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2540  DTW domain-containing protein  36.49 
 
 		 236 aa  163  3e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.565238 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  36.44 
 
 		 245 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  39.81 
 
 		 247 aa  157  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02256  hypothetical protein  43.86 
 
 		 194 aa  156  3e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  35.63 
 
 		 195 aa  109  4.0000000000000004e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  34.07 
 
 		 201 aa  108  1e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00304  hypothetical protein  31.85 
 
 		 170 aa  95.9  5e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  31.65 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1306  DTW domain-containing protein  31.87 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  29.52 
 
 		 209 aa  79.3  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  30.29 
 
 		 241 aa  77.4  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1461  DTW domain containing protein  25.63 
 
 		 246 aa  73.6  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2099  DTW domain-containing protein  29.55 
 
 		 189 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3007  DTW domain containing protein  31.41 
 
 		 175 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000157344  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2386  DTW domain-containing protein  27.38 
 
 		 171 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  26.6 
 
 		 199 aa  68.9  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  27.55 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  25.93 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  26.06 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2326  DTW domain-containing protein  26.82 
 
 		 186 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04079  DTW domain containing protein  28.25 
 
 		 194 aa  64.7  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2613  hypothetical protein  30.32 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2326  DTW domain-containing protein  28.33 
 
 		 187 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.644426  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  25 
 
 		 197 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1565  DTW domain-containing protein  29.11 
 
 		 167 aa  63.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0317  DTW domain-containing protein  28.3 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1919  DTW domain-containing protein  28.75 
 
 		 164 aa  63.5  0.000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2442  DTW domain-containing protein  26.26 
 
 		 186 aa  62.4  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  25.91 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004037  hypothetical protein  25.41 
 
 		 204 aa  62  0.000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  22.58 
 
 		 201 aa  62  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1830  DTW domain-containing protein  28.65 
 
 		 212 aa  62  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  24.49 
 
 		 199 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0255  DTW domain-containing protein  25.85 
 
 		 174 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0256  DTW domain-containing protein  24.16 
 
 		 197 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3422  hypothetical protein  23 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  22.7 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>