138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_04079 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_04079  DTW domain containing protein  100 
 
 		 194 aa  405  1.0000000000000001e-112  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  40.72 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4292  DTW domain-containing protein  36.99 
 
 		 196 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.616546  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  38.89 
 
 		 223 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  36.76 
 
 		 201 aa  129  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  38.38 
 
 		 200 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0256  DTW domain-containing protein  36.36 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  38.15 
 
 		 188 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  36.75 
 
 		 207 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  37.58 
 
 		 207 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  36.75 
 
 		 207 aa  124  9e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3749  DTW domain-containing protein  36.99 
 
 		 188 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  36.59 
 
 		 203 aa  118  7e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3586  DTW domain-containing protein  34.17 
 
 		 200 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2829  DTW domain-containing protein  34.38 
 
 		 200 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0317  DTW domain-containing protein  34.69 
 
 		 211 aa  111  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  33.13 
 
 		 209 aa  105  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0255  DTW domain-containing protein  34.46 
 
 		 174 aa  103  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4270  DTW domain-containing protein  38.13 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0676  hypothetical protein  31.98 
 
 		 183 aa  100  1e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390701  unclonable  0.0000000107509 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0945  DTW domain-containing protein  32.77 
 
 		 215 aa  94.7  7e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0983717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3493  hypothetical protein  31.71 
 
 		 205 aa  90.9  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0091  DTW domain-containing protein  31.76 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  31.1 
 
 		 199 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  31.1 
 
 		 199 aa  88.6  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  30.91 
 
 		 199 aa  88.2  7e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  28.74 
 
 		 213 aa  86.7  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  30.49 
 
 		 199 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2149  DTW domain-containing protein  29.32 
 
 		 243 aa  85.1  6e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  28.05 
 
 		 197 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1758  DTW domain containing protein  28.86 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.370644  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1957  DTW domain-containing protein  28.22 
 
 		 227 aa  83.2  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  28.24 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004037  hypothetical protein  31.58 
 
 		 204 aa  79.7  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  28.66 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  27.27 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1565  hypothetical protein  29.11 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0932097  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0889  DTW domain-containing protein  29.09 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46020  hypothetical protein  27.44 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.637513  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2058  DTW  28.14 
 
 		 203 aa  72  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3914  hypothetical protein  29.09 
 
 		 203 aa  71.2  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3314  hypothetical protein  28.82 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1429  hypothetical protein  26.01 
 
 		 201 aa  69.3  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  24.37 
 
 		 201 aa  68.6  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  26.29 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1820  DTW domain containing protein  29.41 
 
 		 202 aa  68.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1899  DTW domain containing protein  28.14 
 
 		 203 aa  68.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1830  DTW domain-containing protein  27.22 
 
 		 212 aa  67.8  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  24.87 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2086  DTW domain-containing protein  25.84 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0863  DTW  26.15 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  27.08 
 
 		 198 aa  67  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  28.48 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  25.58 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  23.97 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1391  hypothetical protein  24.7 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  21.97 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3422  hypothetical protein  20.99 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1739  DTW domain-containing protein  25.9 
 
 		 204 aa  65.5  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.438659 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1461  DTW domain containing protein  27.07 
 
 		 246 aa  65.5  0.0000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  25.6 
 
 		 247 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  28.25 
 
 		 239 aa  64.7  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2540  DTW domain-containing protein  22.67 
 
 		 236 aa  64.7  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.565238 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2518  DTW domain containing protein  25.43 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2431  DTW domain containing protein  25.43 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  25.31 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0179  DTW  21.55 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.165291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2401  DTW domain-containing protein  24.03 
 
 		 205 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  25.61 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2561  DTW  29.67 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0180989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  26.52 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3935  hypothetical protein  26.6 
 
 		 246 aa  62  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  23.76 
 
 		 251 aa  61.2  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1229  DTW domain-containing protein  24.05 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003511  putative cytoplasmic protein  24.71 
 
 		 264 aa  61.2  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2572  hypothetical protein  27.22 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  25 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  24.86 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2062  hypothetical protein  24.86 
 
 		 238 aa  60.5  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  24.86 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  24.86 
 
 		 254 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  24.86 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  23.89 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  23.89 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  23.33 
 
 		 254 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  23.33 
 
 		 254 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2899  DTW  26.67 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.124472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2330  DTW domain-containing protein  24.68 
 
 		 249 aa  56.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000604871  normal  0.102486 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  23.31 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02075  hypothetical cytosolic protein  23.29 
 
 		 230 aa  55.8  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  23.31 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  23.31 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  24.1 
 
 		 245 aa  55.1  0.0000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2386  DTW domain-containing protein  23.61 
 
 		 171 aa  54.7  0.0000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2978  hypothetical protein  23.78 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  22.29 
 
 		 237 aa  54.3  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1306  DTW domain-containing protein  25.53 
 
 		 156 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0853  DTW domain containing protein  22.98 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  24.53 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00304  hypothetical protein  26.62 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>