129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0676 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_0676  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  380  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390701  unclonable  0.0000000107509 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0945  DTW domain-containing protein  42.13 
 
 
215 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0983717  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  41.76 
 
 
213 aa  129  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1758  DTW domain containing protein  42.93 
 
 
227 aa  129  3e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.370644  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1957  DTW domain-containing protein  42.93 
 
 
227 aa  129  3e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1830  DTW domain-containing protein  38.35 
 
 
212 aa  118  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  40.96 
 
 
197 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0863  DTW  37.44 
 
 
198 aa  114  8.999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  37.97 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  38.8 
 
 
199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  37.43 
 
 
199 aa  111  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  39.33 
 
 
197 aa  110  8.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3586  DTW domain-containing protein  38.33 
 
 
200 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  37.37 
 
 
200 aa  109  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  38.59 
 
 
199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  34.78 
 
 
197 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  35.39 
 
 
203 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46020  hypothetical protein  38.04 
 
 
203 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.637513  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3914  hypothetical protein  37.97 
 
 
203 aa  106  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0256  DTW domain-containing protein  34.76 
 
 
197 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  39.51 
 
 
199 aa  106  2e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  35.6 
 
 
223 aa  105  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  37.29 
 
 
199 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  38.82 
 
 
209 aa  102  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0091  DTW domain-containing protein  38.14 
 
 
215 aa  101  5e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004037  hypothetical protein  35.48 
 
 
204 aa  101  6e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04079  DTW domain containing protein  31.98 
 
 
194 aa  100  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  38.22 
 
 
188 aa  99.8  2e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3314  hypothetical protein  37.97 
 
 
201 aa  99.4  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0317  DTW domain-containing protein  38.04 
 
 
211 aa  96.3  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1565  hypothetical protein  34.62 
 
 
200 aa  96.3  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0932097  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  34.64 
 
 
207 aa  95.5  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4292  DTW domain-containing protein  33.33 
 
 
196 aa  94  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.616546  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  34.64 
 
 
201 aa  94  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3749  DTW domain-containing protein  36.94 
 
 
188 aa  93.2  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  34.08 
 
 
207 aa  93.6  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  34.08 
 
 
207 aa  92.4  3e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2149  DTW domain-containing protein  30.73 
 
 
243 aa  87.4  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0255  DTW domain-containing protein  36.02 
 
 
174 aa  86.3  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2058  DTW  33.74 
 
 
203 aa  83.2  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0889  DTW domain-containing protein  30.63 
 
 
208 aa  83.2  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458899  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1739  DTW domain-containing protein  33.54 
 
 
204 aa  80.5  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.438659 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1899  DTW domain containing protein  32.52 
 
 
203 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3493  hypothetical protein  28.8 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1820  DTW domain containing protein  31.9 
 
 
202 aa  78.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4270  DTW domain-containing protein  36.17 
 
 
181 aa  79  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01424  hypothetical protein  33.33 
 
 
171 aa  74.3  0.0000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  32.53 
 
 
241 aa  73.2  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1461  DTW domain containing protein  29.76 
 
 
246 aa  70.5  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2829  DTW domain-containing protein  27.95 
 
 
200 aa  68.2  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1429  hypothetical protein  26.67 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3935  hypothetical protein  26.19 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2572  hypothetical protein  27.23 
 
 
243 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_93924  predicted protein  29.21 
 
 
252 aa  62.8  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0426424 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  26.29 
 
 
247 aa  62.4  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2431  DTW domain containing protein  25.56 
 
 
201 aa  61.6  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2518  DTW domain containing protein  27.01 
 
 
201 aa  61.6  0.000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2540  DTW domain-containing protein  22.28 
 
 
236 aa  61.2  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.565238 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0179  DTW  29.21 
 
 
199 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.165291  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  24.57 
 
 
201 aa  59.7  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2845  DTW domain containing protein  25.59 
 
 
243 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2401  DTW domain-containing protein  26.53 
 
 
205 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663769  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2062  hypothetical protein  24.04 
 
 
238 aa  58.2  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1229  DTW domain-containing protein  29.17 
 
 
185 aa  57.4  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3422  hypothetical protein  27.78 
 
 
202 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2899  DTW  23.76 
 
 
243 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.124472  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  24.26 
 
 
245 aa  57  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  23.63 
 
 
232 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02075  hypothetical cytosolic protein  26.11 
 
 
230 aa  57  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2561  DTW  25.71 
 
 
243 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0180989  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  25.63 
 
 
232 aa  55.1  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  21.11 
 
 
195 aa  54.7  0.0000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3492  DTW domain containing protein  27.84 
 
 
244 aa  54.3  0.0000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  23.63 
 
 
232 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02441  hypothetical protein  23.63 
 
 
232 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  23.63 
 
 
232 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  23.63 
 
 
232 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  23.63 
 
 
232 aa  54.3  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3007  DTW domain containing protein  28.57 
 
 
175 aa  53.9  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000157344  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  23.08 
 
 
232 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1520  hypothetical protein  23.76 
 
 
237 aa  53.1  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0474866  normal  0.0473662 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  23.78 
 
 
245 aa  53.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  23.08 
 
 
232 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  23.08 
 
 
232 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  23 
 
 
236 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  25 
 
 
249 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00304  hypothetical protein  27.39 
 
 
170 aa  49.7  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  22.63 
 
 
251 aa  48.9  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  23.95 
 
 
249 aa  48.9  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1391  hypothetical protein  23.21 
 
 
247 aa  48.5  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4284  DTW domain-containing protein  32.26 
 
 
241 aa  48.1  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  24.61 
 
 
244 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2760  DTW domain protein  23.03 
 
 
226 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00353783  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  23.35 
 
 
228 aa  47.8  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3068  DTW domain-containing protein  28.36 
 
 
232 aa  47.8  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118921 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2862  DTW domain protein  21.98 
 
 
226 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  0.735331 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  22.63 
 
 
254 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2866  DTW domain-containing protein  23.03 
 
 
226 aa  47  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  22.63 
 
 
254 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  22.63 
 
 
254 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>