152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A2388 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  414  9.999999999999999e-116  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  43.81 
 
 		 201 aa  166  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  37.11 
 
 		 195 aa  155  4e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00304  hypothetical protein  41.21 
 
 		 170 aa  123  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  36.65 
 
 		 232 aa  114  8.999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  33.7 
 
 		 249 aa  113  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  33.7 
 
 		 249 aa  112  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  34.72 
 
 		 236 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  32.22 
 
 		 232 aa  109  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  34.32 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  37.7 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  36.72 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  32.22 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  32.22 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  37.85 
 
 		 236 aa  109  3e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  32.22 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  37.85 
 
 		 236 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  32.22 
 
 		 232 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  32.22 
 
 		 232 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  32.22 
 
 		 232 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  37.29 
 
 		 236 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  32.98 
 
 		 249 aa  107  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  32.22 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02441  hypothetical protein  32.22 
 
 		 232 aa  107  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3492  DTW domain containing protein  32.82 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1535  hypothetical protein  37.43 
 
 		 238 aa  106  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17650  hypothetical protein  36.16 
 
 		 238 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  31.63 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2760  DTW domain protein  30.53 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00353783  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2862  DTW domain protein  30.53 
 
 		 226 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  0.735331 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2866  DTW domain-containing protein  30.53 
 
 		 226 aa  101  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  30 
 
 		 226 aa  99.8  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  35.2 
 
 		 247 aa  100  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  30.43 
 
 		 237 aa  99.4  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0900  DTW domain-containing protein  38.82 
 
 		 281 aa  99.4  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2978  hypothetical protein  30 
 
 		 226 aa  97.4  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3956  DTW  32.46 
 
 		 245 aa  96.7  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222792  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  31.91 
 
 		 234 aa  96.7  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0853  DTW domain containing protein  34.55 
 
 		 238 aa  96.3  3e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  29.94 
 
 		 245 aa  96.3  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2386  DTW domain-containing protein  36.69 
 
 		 171 aa  96.3  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1382  DTW  35.75 
 
 		 236 aa  95.1  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  29.28 
 
 		 247 aa  93.2  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  30.39 
 
 		 256 aa  91.3  9e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1391  hypothetical protein  29.65 
 
 		 247 aa  90.9  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1306  DTW domain-containing protein  36.71 
 
 		 156 aa  90.9  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1565  hypothetical protein  29.15 
 
 		 200 aa  90.5  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0932097  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2330  DTW domain-containing protein  32.48 
 
 		 249 aa  89.7  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000604871  normal  0.102486 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2099  DTW domain-containing protein  32.37 
 
 		 189 aa  90.1  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  30.39 
 
 		 251 aa  89.4  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4284  DTW domain-containing protein  31.98 
 
 		 241 aa  89.7  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3007  DTW domain containing protein  31.76 
 
 		 175 aa  89  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000157344  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3068  DTW domain-containing protein  32.5 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  29.28 
 
 		 254 aa  89  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  29.28 
 
 		 254 aa  88.6  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  29.28 
 
 		 254 aa  88.6  5e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  29.28 
 
 		 254 aa  88.6  5e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3314  DTW domain containing protein  32.99 
 
 		 248 aa  88.2  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  28.89 
 
 		 252 aa  88.2  7e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  31.65 
 
 		 239 aa  87.8  1e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  33.14 
 
 		 207 aa  87.8  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4750  hypothetical protein  30.15 
 
 		 252 aa  86.7  2e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565927  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3970  DTW domain-containing protein  32.56 
 
 		 253 aa  87  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163584 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2595  DTW domain-containing protein  38.12 
 
 		 168 aa  87  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.270595 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  30.94 
 
 		 254 aa  86.3  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  30.94 
 
 		 254 aa  85.9  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2008  DTW domain-containing protein  36.9 
 
 		 174 aa  86.3  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0597525  hitchhiker  0.00247146 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  32.57 
 
 		 207 aa  85.5  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  32.57 
 
 		 207 aa  85.5  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  30.39 
 
 		 254 aa  85.1  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  31.1 
 
 		 197 aa  84.7  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02075  hypothetical cytosolic protein  29.94 
 
 		 230 aa  84.7  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2540  DTW domain-containing protein  27.32 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.565238 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3616  hypothetical protein  33.12 
 
 		 152 aa  84.3  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337798  hitchhiker  0.00610419 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3320  DTW domain containing protein  32.39 
 
 		 283 aa  84  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0873606  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  32.72 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  29.73 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0256  DTW domain-containing protein  30.43 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003511  putative cytoplasmic protein  25.41 
 
 		 264 aa  82.8  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2326  DTW domain-containing protein  36.36 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2326  DTW domain-containing protein  32.42 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.644426  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  32.03 
 
 		 201 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  28.57 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2020  DTW domain containing protein  35.15 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.443073  hitchhiker  0.00543273 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2442  DTW domain-containing protein  32.6 
 
 		 186 aa  80.1  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  27.67 
 
 		 267 aa  79.3  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  27.37 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4270  DTW domain-containing protein  33.33 
 
 		 181 aa  79  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  32.52 
 
 		 199 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1565  DTW domain-containing protein  32.48 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1919  DTW domain-containing protein  34.62 
 
 		 164 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  26.98 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3749  DTW domain-containing protein  29.14 
 
 		 188 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  30.06 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  29.3 
 
 		 249 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2086  DTW domain-containing protein  25.14 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2613  hypothetical protein  34.13 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2423  hypothetical protein  37.86 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.310346  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0863  DTW  29.14 
 
 		 198 aa  74.3  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  27.87 
 
 		 245 aa  73.6  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>