144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_4137 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  100 
 
 
207 aa  430  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  96.62 
 
 
207 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  96.14 
 
 
207 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4270  DTW domain-containing protein  97.24 
 
 
181 aa  361  3e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  76.65 
 
 
201 aa  321  4e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  76.38 
 
 
200 aa  314  6e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  74.49 
 
 
197 aa  308  4e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3749  DTW domain-containing protein  75.81 
 
 
188 aa  294  8e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  75.4 
 
 
188 aa  292  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  59.39 
 
 
223 aa  242  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  53.92 
 
 
203 aa  236  1e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0256  DTW domain-containing protein  56.85 
 
 
197 aa  229  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0255  DTW domain-containing protein  58.82 
 
 
174 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3586  DTW domain-containing protein  52.02 
 
 
200 aa  207  9e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  50.75 
 
 
209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3493  hypothetical protein  47.8 
 
 
205 aa  182  3e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4292  DTW domain-containing protein  40.22 
 
 
196 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.616546  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0317  DTW domain-containing protein  38.24 
 
 
211 aa  139  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1565  hypothetical protein  36.55 
 
 
200 aa  132  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0932097  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  38.54 
 
 
197 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004037  hypothetical protein  37.06 
 
 
204 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  38 
 
 
197 aa  125  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3914  hypothetical protein  39.79 
 
 
203 aa  125  6e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04079  DTW domain containing protein  37.58 
 
 
194 aa  124  8.000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  35.82 
 
 
213 aa  123  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0889  DTW domain-containing protein  33.97 
 
 
208 aa  122  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458899  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  36.84 
 
 
199 aa  121  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46020  hypothetical protein  39.79 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.637513  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  35.27 
 
 
199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  37.24 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  36.32 
 
 
199 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  34.21 
 
 
199 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  33.68 
 
 
199 aa  112  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0945  DTW domain-containing protein  37.63 
 
 
215 aa  111  7.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0983717  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01424  hypothetical protein  36.02 
 
 
171 aa  100  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3314  hypothetical protein  36.22 
 
 
201 aa  98.6  6e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2149  DTW domain-containing protein  34.2 
 
 
243 aa  94.7  8e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0863  DTW  33.68 
 
 
198 aa  94.7  9e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1830  DTW domain-containing protein  35.5 
 
 
212 aa  94  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0676  hypothetical protein  34.08 
 
 
183 aa  92.4  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390701  unclonable  0.0000000107509 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  31.43 
 
 
241 aa  91.3  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1957  DTW domain-containing protein  32 
 
 
227 aa  90.1  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0091  DTW domain-containing protein  34.04 
 
 
215 aa  88.2  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1758  DTW domain containing protein  31.84 
 
 
227 aa  87.4  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.370644  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  32.57 
 
 
198 aa  85.5  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2058  DTW  31.87 
 
 
203 aa  84.7  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2899  DTW  33.5 
 
 
243 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.124472  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1520  hypothetical protein  29.76 
 
 
237 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0474866  normal  0.0473662 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1899  DTW domain containing protein  32.42 
 
 
203 aa  82  0.000000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2829  DTW domain-containing protein  31.09 
 
 
200 aa  81.3  0.00000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1820  DTW domain containing protein  31.87 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2572  hypothetical protein  32.5 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  28.04 
 
 
252 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2845  DTW domain containing protein  32.32 
 
 
243 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2561  DTW  30.96 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0180989  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  25.79 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  28.74 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2062  hypothetical protein  28.43 
 
 
238 aa  75.9  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  26.84 
 
 
249 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  26.88 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  26.82 
 
 
201 aa  73.9  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  26.88 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  26.88 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  26.88 
 
 
254 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  29.38 
 
 
267 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  27.17 
 
 
245 aa  72.4  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  29.09 
 
 
234 aa  71.6  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4284  DTW domain-containing protein  31.55 
 
 
241 aa  71.2  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  31.06 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  25.13 
 
 
247 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1739  DTW domain-containing protein  32.22 
 
 
204 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.438659 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  29.01 
 
 
236 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2401  DTW domain-containing protein  30.65 
 
 
205 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663769  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  30.77 
 
 
232 aa  68.2  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1429  hypothetical protein  28.12 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  26.37 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3935  hypothetical protein  29.57 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1461  DTW domain containing protein  32.24 
 
 
246 aa  67.8  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  24.06 
 
 
251 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2086  DTW domain-containing protein  25.79 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  23.56 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  23.56 
 
 
254 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  23.89 
 
 
195 aa  65.9  0.0000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2540  DTW domain-containing protein  21.81 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.565238 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2518  DTW domain containing protein  28.12 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17650  hypothetical protein  30.06 
 
 
238 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2431  DTW domain containing protein  28.12 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  24.6 
 
 
254 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  28.02 
 
 
236 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  27.57 
 
 
236 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  26.37 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  28.02 
 
 
236 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0900  DTW domain-containing protein  29.24 
 
 
281 aa  64.3  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  24.4 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  27.27 
 
 
228 aa  64.3  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  25.7 
 
 
237 aa  63.5  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  24.4 
 
 
249 aa  63.5  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  27.47 
 
 
236 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3320  DTW domain containing protein  28.98 
 
 
283 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0873606  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3492  DTW domain containing protein  25.82 
 
 
244 aa  62.4  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>