142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3954 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  100 
 
 		 223 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0256  DTW domain-containing protein  72.59 
 
 		 197 aa  295  5e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0255  DTW domain-containing protein  72.99 
 
 		 174 aa  255  3e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  59.39 
 
 		 207 aa  242  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  58.67 
 
 		 197 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  58.97 
 
 		 207 aa  238  5e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  59.38 
 
 		 207 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  58.38 
 
 		 200 aa  234  8e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3586  DTW domain-containing protein  58.08 
 
 		 200 aa  229  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  53.81 
 
 		 201 aa  225  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3749  DTW domain-containing protein  60.33 
 
 		 188 aa  225  4e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  59.78 
 
 		 188 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  51.02 
 
 		 203 aa  216  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4270  DTW domain-containing protein  60.36 
 
 		 181 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  48.26 
 
 		 209 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3493  hypothetical protein  42.16 
 
 		 205 aa  160  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4292  DTW domain-containing protein  40.44 
 
 		 196 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.616546  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  40.31 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04079  DTW domain containing protein  38.89 
 
 		 194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1565  hypothetical protein  36.98 
 
 		 200 aa  131  9e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0932097  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0317  DTW domain-containing protein  35.38 
 
 		 211 aa  125  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  36.46 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0889  DTW domain-containing protein  33.67 
 
 		 208 aa  122  4e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004037  hypothetical protein  35.94 
 
 		 204 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  35.68 
 
 		 199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  35.71 
 
 		 199 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  33.86 
 
 		 213 aa  111  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  33.68 
 
 		 199 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  33.16 
 
 		 199 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  33.16 
 
 		 199 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  33.68 
 
 		 199 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1957  DTW domain-containing protein  35.27 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0945  DTW domain-containing protein  37.44 
 
 		 215 aa  106  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0983717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3914  hypothetical protein  36.13 
 
 		 203 aa  106  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0676  hypothetical protein  35.6 
 
 		 183 aa  105  5e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390701  unclonable  0.0000000107509 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46020  hypothetical protein  36.36 
 
 		 203 aa  105  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.637513  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1758  DTW domain containing protein  35.27 
 
 		 227 aa  105  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.370644  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0091  DTW domain-containing protein  41.18 
 
 		 215 aa  103  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0863  DTW  34.03 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01424  hypothetical protein  36.02 
 
 		 171 aa  99  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2829  DTW domain-containing protein  33.33 
 
 		 200 aa  96.7  3e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3314  hypothetical protein  36.36 
 
 		 201 aa  92  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2149  DTW domain-containing protein  31.96 
 
 		 243 aa  91.7  9e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2058  DTW  31.55 
 
 		 203 aa  89  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1820  DTW domain containing protein  32.09 
 
 		 202 aa  88.6  7e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1899  DTW domain containing protein  31.55 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1830  DTW domain-containing protein  32.83 
 
 		 212 aa  87.8  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  28.57 
 
 		 256 aa  87  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  29.02 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  28.57 
 
 		 254 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  28.57 
 
 		 254 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  28.57 
 
 		 254 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  28.57 
 
 		 254 aa  86.3  3e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  29.84 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  26.98 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  28.04 
 
 		 254 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  28.04 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  27.51 
 
 		 254 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  27.37 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  27.46 
 
 		 249 aa  78.2  0.00000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1739  DTW domain-containing protein  29.69 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.438659 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  25.13 
 
 		 245 aa  75.1  0.0000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1520  hypothetical protein  27.98 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0474866  normal  0.0473662 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  25.86 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2561  DTW  30.65 
 
 		 243 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0180989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  29.02 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3935  hypothetical protein  30.05 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2572  hypothetical protein  29.7 
 
 		 243 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  26.42 
 
 		 267 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  28.95 
 
 		 244 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  29.55 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2062  hypothetical protein  27.27 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  25.64 
 
 		 247 aa  71.6  0.000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  29.69 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  25.67 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  25.65 
 
 		 195 aa  71.6  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  29.69 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2540  DTW domain-containing protein  24.23 
 
 		 236 aa  71.2  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.565238 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  27.23 
 
 		 236 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  29.17 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  24.47 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2899  DTW  28.71 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.124472  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  24.19 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1391  hypothetical protein  25.64 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2086  DTW domain-containing protein  26 
 
 		 253 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  24.38 
 
 		 290 aa  67  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3970  DTW domain-containing protein  26.83 
 
 		 253 aa  67  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163584 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_93924  predicted protein  28.1 
 
 		 252 aa  67  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0426424 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  28.65 
 
 		 236 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3320  DTW domain containing protein  26.83 
 
 		 283 aa  67  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0873606  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0900  DTW domain-containing protein  26.84 
 
 		 281 aa  66.6  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  24.24 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2845  DTW domain containing protein  27.14 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3492  DTW domain containing protein  24.6 
 
 		 244 aa  65.5  0.0000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  25 
 
 		 249 aa  65.5  0.0000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17650  hypothetical protein  25.26 
 
 		 238 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  25 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1429  hypothetical protein  26.67 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003511  putative cytoplasmic protein  24.71 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3956  DTW  29.71 
 
 		 245 aa  62.8  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222792  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>