134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3493 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3493  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  424  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  53.2 
 
 		 203 aa  199  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4270  DTW domain-containing protein  49.5 
 
 		 181 aa  186  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  48.76 
 
 		 188 aa  185  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  48.78 
 
 		 207 aa  184  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  48.78 
 
 		 207 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  48.29 
 
 		 207 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3749  DTW domain-containing protein  46.8 
 
 		 188 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  47.29 
 
 		 200 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  48.26 
 
 		 197 aa  177  8e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  46.77 
 
 		 201 aa  176  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0256  DTW domain-containing protein  44.33 
 
 		 197 aa  170  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  47.52 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0255  DTW domain-containing protein  43.14 
 
 		 174 aa  166  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  42.16 
 
 		 223 aa  159  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3586  DTW domain-containing protein  43.14 
 
 		 200 aa  151  5e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1565  hypothetical protein  37.19 
 
 		 200 aa  125  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0932097  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0317  DTW domain-containing protein  35.15 
 
 		 211 aa  108  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4292  DTW domain-containing protein  34.38 
 
 		 196 aa  106  3e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.616546  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  31.34 
 
 		 199 aa  100  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  32.18 
 
 		 197 aa  99.4  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  32.84 
 
 		 199 aa  98.6  5e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0889  DTW domain-containing protein  32.84 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458899  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2149  DTW domain-containing protein  37.08 
 
 		 243 aa  95.5  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  31.82 
 
 		 197 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004037  hypothetical protein  32.14 
 
 		 204 aa  95.1  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04079  DTW domain containing protein  32.32 
 
 		 194 aa  92.8  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0945  DTW domain-containing protein  33.16 
 
 		 215 aa  89.4  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0983717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  30.3 
 
 		 199 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  30.24 
 
 		 213 aa  89  4e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  29.8 
 
 		 199 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  30.3 
 
 		 199 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3914  hypothetical protein  30.3 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  28 
 
 		 199 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01424  hypothetical protein  30.53 
 
 		 171 aa  84  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1957  DTW domain-containing protein  32.61 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1758  DTW domain containing protein  33.33 
 
 		 227 aa  83.6  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.370644  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46020  hypothetical protein  30.81 
 
 		 203 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.637513  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0676  hypothetical protein  28.8 
 
 		 183 aa  79.3  0.00000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390701  unclonable  0.0000000107509 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0863  DTW  30.81 
 
 		 198 aa  78.6  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1830  DTW domain-containing protein  33.33 
 
 		 212 aa  76.3  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3314  hypothetical protein  31.72 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2829  DTW domain-containing protein  32.97 
 
 		 200 aa  68.9  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0091  DTW domain-containing protein  31.38 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2561  DTW  43.21 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0180989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2572  hypothetical protein  41.98 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2845  DTW domain containing protein  27.69 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1520  hypothetical protein  41.98 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0474866  normal  0.0473662 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  26.74 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_93924  predicted protein  38.54 
 
 		 252 aa  58.9  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0426424 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  25.67 
 
 		 256 aa  58.2  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2899  DTW  41.98 
 
 		 243 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.124472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  28.21 
 
 		 247 aa  57.4  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  23.6 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2058  DTW  25.93 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1899  DTW domain containing protein  24.34 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  42.42 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  26.84 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  24.73 
 
 		 254 aa  54.7  0.0000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  24.73 
 
 		 254 aa  54.7  0.0000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  24.73 
 
 		 254 aa  54.7  0.0000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  25 
 
 		 245 aa  54.3  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2540  DTW domain-containing protein  31.11 
 
 		 236 aa  54.3  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.565238 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  24.73 
 
 		 254 aa  54.3  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17650  hypothetical protein  41.43 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  27.14 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  32.93 
 
 		 252 aa  53.5  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4284  DTW domain-containing protein  34.12 
 
 		 241 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  23.24 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  32.93 
 
 		 247 aa  53.9  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0900  DTW domain-containing protein  39.19 
 
 		 281 aa  53.9  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3956  DTW  44.83 
 
 		 245 aa  53.1  0.000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222792  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3935  hypothetical protein  36.08 
 
 		 246 aa  52.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  38.16 
 
 		 236 aa  52.8  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  38.16 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  38.16 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  38.16 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  23.12 
 
 		 251 aa  52.8  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  42.37 
 
 		 236 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2062  hypothetical protein  37.04 
 
 		 238 aa  52.8  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3492  DTW domain containing protein  27.33 
 
 		 244 aa  52.8  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1820  DTW domain containing protein  24.34 
 
 		 202 aa  52.4  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  38.98 
 
 		 234 aa  52  0.000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3314  DTW domain containing protein  30.17 
 
 		 248 aa  52.4  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3320  DTW domain containing protein  39.66 
 
 		 283 aa  52  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0873606  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  31.71 
 
 		 254 aa  51.6  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3970  DTW domain-containing protein  39.66 
 
 		 253 aa  51.6  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163584 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1535  hypothetical protein  38.81 
 
 		 238 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  33.33 
 
 		 267 aa  50.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  30.49 
 
 		 254 aa  50.1  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  24.1 
 
 		 249 aa  50.4  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02075  hypothetical cytosolic protein  27.59 
 
 		 230 aa  49.7  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  40.68 
 
 		 244 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  30.49 
 
 		 254 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2518  DTW domain containing protein  41.33 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2386  DTW domain-containing protein  23.5 
 
 		 171 aa  49.3  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  25.66 
 
 		 249 aa  49.3  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1429  hypothetical protein  37.97 
 
 		 201 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2613  hypothetical protein  25.67 
 
 		 177 aa  48.9  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1391  hypothetical protein  40.98 
 
 		 247 aa  48.9  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>