143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0326 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  100 
 
 
201 aa  417  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  77.66 
 
 
207 aa  322  2e-87  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  76.65 
 
 
207 aa  321  4e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  75.63 
 
 
207 aa  314  5e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  68.88 
 
 
197 aa  293  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  69.54 
 
 
200 aa  290  9e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  70.27 
 
 
188 aa  279  2e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4270  DTW domain-containing protein  78.82 
 
 
181 aa  278  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3749  DTW domain-containing protein  68.65 
 
 
188 aa  276  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  53.81 
 
 
223 aa  225  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  50 
 
 
203 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0256  DTW domain-containing protein  53.57 
 
 
197 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0255  DTW domain-containing protein  58.24 
 
 
174 aa  210  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  49.76 
 
 
209 aa  198  5e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3586  DTW domain-containing protein  48.73 
 
 
200 aa  192  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3493  hypothetical protein  46.77 
 
 
205 aa  175  3e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4292  DTW domain-containing protein  41.3 
 
 
196 aa  155  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.616546  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  39.06 
 
 
197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04079  DTW domain containing protein  36.76 
 
 
194 aa  129  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1565  hypothetical protein  34.33 
 
 
200 aa  128  6e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0932097  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  37.19 
 
 
197 aa  125  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0317  DTW domain-containing protein  34.92 
 
 
211 aa  125  6e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  35.5 
 
 
213 aa  124  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  38 
 
 
199 aa  122  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  36.27 
 
 
199 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004037  hypothetical protein  34.01 
 
 
204 aa  120  1.9999999999999998e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  36.32 
 
 
199 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  37.37 
 
 
199 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  35.79 
 
 
199 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  35.71 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3914  hypothetical protein  36.36 
 
 
203 aa  116  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46020  hypothetical protein  37.11 
 
 
203 aa  111  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.637513  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0889  DTW domain-containing protein  34.52 
 
 
208 aa  110  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458899  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0945  DTW domain-containing protein  33.5 
 
 
215 aa  104  8e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0983717  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01424  hypothetical protein  34.16 
 
 
171 aa  97.1  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0863  DTW  35.26 
 
 
198 aa  95.5  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2829  DTW domain-containing protein  36.2 
 
 
200 aa  95.1  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0676  hypothetical protein  34.64 
 
 
183 aa  94  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390701  unclonable  0.0000000107509 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  31.63 
 
 
241 aa  93.6  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2149  DTW domain-containing protein  31.47 
 
 
243 aa  90.9  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3314  hypothetical protein  33.15 
 
 
201 aa  89  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0091  DTW domain-containing protein  33.33 
 
 
215 aa  88.2  8e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1957  DTW domain-containing protein  29.35 
 
 
227 aa  87.4  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1830  DTW domain-containing protein  31.84 
 
 
212 aa  87.4  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1758  DTW domain containing protein  28.86 
 
 
227 aa  85.9  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.370644  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1520  hypothetical protein  30.46 
 
 
237 aa  85.9  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0474866  normal  0.0473662 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1820  DTW domain containing protein  31.55 
 
 
202 aa  84.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2058  DTW  29.95 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1899  DTW domain containing protein  31.02 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  32.03 
 
 
198 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2899  DTW  29.3 
 
 
243 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.124472  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2561  DTW  30.19 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0180989  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2062  hypothetical protein  27.7 
 
 
238 aa  79.7  0.00000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2572  hypothetical protein  29.57 
 
 
243 aa  79  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1739  DTW domain-containing protein  32.26 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.438659 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  27.95 
 
 
234 aa  77  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  26.32 
 
 
249 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2401  DTW domain-containing protein  33.11 
 
 
205 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663769  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  25.97 
 
 
201 aa  73.6  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  28.14 
 
 
247 aa  72.8  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2845  DTW domain containing protein  28.93 
 
 
243 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  27.1 
 
 
195 aa  72.4  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  26.8 
 
 
245 aa  71.2  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  25.81 
 
 
256 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2086  DTW domain-containing protein  25.93 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  25.25 
 
 
290 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1429  hypothetical protein  30.63 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3935  hypothetical protein  28.79 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  28.4 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  25.95 
 
 
252 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  27.88 
 
 
237 aa  68.9  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0179  DTW  27.44 
 
 
199 aa  68.6  0.00000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.165291  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  25.27 
 
 
254 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  25.27 
 
 
254 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  25.27 
 
 
254 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  25.27 
 
 
254 aa  68.2  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2431  DTW domain containing protein  30.63 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2518  DTW domain containing protein  30.63 
 
 
201 aa  68.2  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  26.67 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  28.57 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3492  DTW domain containing protein  26.4 
 
 
244 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  26.2 
 
 
251 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_93924  predicted protein  28.5 
 
 
252 aa  65.9  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0426424 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3320  DTW domain containing protein  28.65 
 
 
283 aa  65.5  0.0000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0873606  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  23.56 
 
 
247 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4284  DTW domain-containing protein  28.42 
 
 
241 aa  64.7  0.0000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  23.66 
 
 
254 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  23.94 
 
 
254 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  23.66 
 
 
254 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1229  DTW domain-containing protein  32.57 
 
 
185 aa  63.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  28.02 
 
 
232 aa  63.9  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1461  DTW domain containing protein  26.99 
 
 
246 aa  62.4  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  25.47 
 
 
236 aa  62  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  22.58 
 
 
239 aa  62  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0853  DTW domain containing protein  25.77 
 
 
238 aa  61.6  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3956  DTW  27.78 
 
 
245 aa  61.6  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222792  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3970  DTW domain-containing protein  28.65 
 
 
253 aa  61.2  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163584 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  25.14 
 
 
236 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  26.74 
 
 
236 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  26.74 
 
 
236 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0994806 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>