119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2149 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2149  DTW domain-containing protein  100 
 
 		 243 aa  500  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0945  DTW domain-containing protein  34.85 
 
 		 215 aa  125  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0983717  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004037  hypothetical protein  32.91 
 
 		 204 aa  123  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46020  hypothetical protein  32.2 
 
 		 203 aa  107  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.637513  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0091  DTW domain-containing protein  31.15 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1565  hypothetical protein  32.49 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0932097  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  33.17 
 
 		 213 aa  104  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  34.15 
 
 		 199 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  33.82 
 
 		 197 aa  104  1e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3914  hypothetical protein  32.68 
 
 		 203 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  35.79 
 
 		 199 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  35.79 
 
 		 199 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  36.32 
 
 		 199 aa  102  4e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  35.45 
 
 		 197 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  33.85 
 
 		 209 aa  102  7e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  33.17 
 
 		 199 aa  101  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  31.63 
 
 		 203 aa  100  3e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  32.2 
 
 		 199 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0317  DTW domain-containing protein  31.22 
 
 		 211 aa  95.9  5e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  34.02 
 
 		 200 aa  94.7  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0889  DTW domain-containing protein  31.2 
 
 		 208 aa  94.7  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3586  DTW domain-containing protein  33.68 
 
 		 200 aa  94.7  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  34.2 
 
 		 207 aa  94.7  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1758  DTW domain containing protein  31.28 
 
 		 227 aa  94.4  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.370644  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3493  hypothetical protein  34.85 
 
 		 205 aa  93.6  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1957  DTW domain-containing protein  30.77 
 
 		 227 aa  93.6  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01424  hypothetical protein  32.34 
 
 		 171 aa  92.8  4e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0256  DTW domain-containing protein  32.31 
 
 		 197 aa  92.8  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  33.51 
 
 		 207 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  31.96 
 
 		 223 aa  91.7  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  32.99 
 
 		 197 aa  90.9  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3314  hypothetical protein  32.32 
 
 		 201 aa  90.5  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  31.47 
 
 		 201 aa  90.9  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  32.99 
 
 		 207 aa  90.1  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3749  DTW domain-containing protein  35 
 
 		 188 aa  88.6  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  34.05 
 
 		 188 aa  87.8  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1830  DTW domain-containing protein  31.41 
 
 		 212 aa  88.2  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0676  hypothetical protein  30.73 
 
 		 183 aa  87.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390701  unclonable  0.0000000107509 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04079  DTW domain containing protein  29.32 
 
 		 194 aa  85.1  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0863  DTW  32.04 
 
 		 198 aa  84.7  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4292  DTW domain-containing protein  25.52 
 
 		 196 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.616546  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2829  DTW domain-containing protein  30.21 
 
 		 200 aa  77.8  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4270  DTW domain-containing protein  33.14 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  32.43 
 
 		 241 aa  76.3  0.0000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2058  DTW  26.09 
 
 		 203 aa  74.7  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1739  DTW domain-containing protein  28.12 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.438659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3935  hypothetical protein  26.56 
 
 		 246 aa  72  0.000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1899  DTW domain containing protein  25.22 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1820  DTW domain containing protein  25.22 
 
 		 202 aa  69.3  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0255  DTW domain-containing protein  29.88 
 
 		 174 aa  64.7  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2062  hypothetical protein  25.52 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2899  DTW  25 
 
 		 243 aa  62  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.124472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2572  hypothetical protein  25.52 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2561  DTW  24.61 
 
 		 243 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0180989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1229  DTW domain-containing protein  25 
 
 		 185 aa  61.6  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02075  hypothetical cytosolic protein  26.74 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  27.27 
 
 		 290 aa  59.7  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1520  hypothetical protein  24.47 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0474866  normal  0.0473662 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2845  DTW domain containing protein  24.08 
 
 		 243 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  24 
 
 		 247 aa  58.5  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  27.42 
 
 		 245 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003511  putative cytoplasmic protein  24.59 
 
 		 264 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2401  DTW domain-containing protein  25.28 
 
 		 205 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0179  DTW  23.2 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.165291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  23.53 
 
 		 254 aa  55.1  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0900  DTW domain-containing protein  22.39 
 
 		 281 aa  55.5  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  26.56 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  25.82 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  23.81 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  22.99 
 
 		 249 aa  53.9  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  26.6 
 
 		 256 aa  53.9  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  23.81 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  23.81 
 
 		 254 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  26.6 
 
 		 251 aa  52.8  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1391  hypothetical protein  25.27 
 
 		 247 aa  52.4  0.000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3422  hypothetical protein  22.28 
 
 		 202 aa  52  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1382  DTW  24.5 
 
 		 236 aa  52  0.000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  23.94 
 
 		 254 aa  52  0.000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  24.22 
 
 		 247 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  24.47 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  23.94 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2008  DTW domain-containing protein  26.45 
 
 		 174 aa  50.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0597525  hitchhiker  0.00247146 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  24.74 
 
 		 232 aa  49.3  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  24.35 
 
 		 234 aa  49.3  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2086  DTW domain-containing protein  25 
 
 		 253 aa  49.3  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1461  DTW domain containing protein  24.18 
 
 		 246 aa  48.9  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1535  hypothetical protein  24.32 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3314  DTW domain containing protein  23.88 
 
 		 248 aa  47.4  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  25.43 
 
 		 267 aa  46.2  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  22.83 
 
 		 244 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  23.37 
 
 		 236 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17650  hypothetical protein  23.24 
 
 		 238 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  23.4 
 
 		 236 aa  45.8  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  22.16 
 
 		 236 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  22.83 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4750  hypothetical protein  25.83 
 
 		 252 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565927  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  22.22 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  22.87 
 
 		 236 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  22.28 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2330  DTW domain-containing protein  24.38 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000604871  normal  0.102486 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>