134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1229 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1229  DTW domain-containing protein  100 
 
 		 185 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0179  DTW  78.45 
 
 		 199 aa  281  5.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.165291  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3422  hypothetical protein  76.63 
 
 		 202 aa  280  6.000000000000001e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1461  DTW domain containing protein  49.17 
 
 		 246 aa  150  8e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  32.77 
 
 		 199 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  32.2 
 
 		 199 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  32.77 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  32.77 
 
 		 199 aa  83.6  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  33.52 
 
 		 213 aa  82.8  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  31.52 
 
 		 245 aa  82.4  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  32.77 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46020  hypothetical protein  31.82 
 
 		 203 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.637513  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  30.51 
 
 		 199 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3914  hypothetical protein  32.39 
 
 		 203 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  29.94 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2401  DTW domain-containing protein  36.81 
 
 		 205 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2058  DTW  35.2 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1429  hypothetical protein  32.2 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1820  DTW domain containing protein  32.97 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1899  DTW domain containing protein  34.27 
 
 		 203 aa  68.9  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  33.73 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  26.63 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  26.63 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  26.63 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  26.63 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  32.57 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  22.7 
 
 		 247 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2330  DTW domain-containing protein  25.95 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000604871  normal  0.102486 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2431  DTW domain containing protein  31.07 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  25.63 
 
 		 256 aa  62  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2149  DTW domain-containing protein  25 
 
 		 243 aa  61.6  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  24.47 
 
 		 249 aa  61.6  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04079  DTW domain containing protein  24.05 
 
 		 194 aa  61.2  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1739  DTW domain-containing protein  32.02 
 
 		 204 aa  61.2  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.438659 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2518  DTW domain containing protein  30.51 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2386  DTW domain-containing protein  30.14 
 
 		 171 aa  60.8  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4292  DTW domain-containing protein  25.79 
 
 		 196 aa  60.5  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.616546  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  25.15 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2008  DTW domain-containing protein  31.98 
 
 		 174 aa  59.7  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0597525  hitchhiker  0.00247146 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  23.94 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  25.4 
 
 		 267 aa  59.3  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  24.32 
 
 		 251 aa  58.2  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  24.44 
 
 		 234 aa  58.5  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1919  DTW domain-containing protein  29.2 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0676  hypothetical protein  29.17 
 
 		 183 aa  57.4  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390701  unclonable  0.0000000107509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  23.4 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  23.94 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  22.29 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2595  DTW domain-containing protein  29.17 
 
 		 168 aa  57  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.270595 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  23.08 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1391  hypothetical protein  21.23 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  28 
 
 		 236 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  29.87 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  28 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  22.83 
 
 		 252 aa  55.1  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2099  DTW domain-containing protein  28.57 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  26.7 
 
 		 236 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1758  DTW domain containing protein  28.99 
 
 		 227 aa  53.9  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.370644  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  27.43 
 
 		 236 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3492  DTW domain containing protein  28.95 
 
 		 244 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  26.49 
 
 		 247 aa  53.9  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  24.86 
 
 		 244 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  24.73 
 
 		 249 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0863  DTW  26.45 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0945  DTW domain-containing protein  30.67 
 
 		 215 aa  53.1  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0983717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00304  hypothetical protein  27.27 
 
 		 170 aa  53.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2086  DTW domain-containing protein  23.12 
 
 		 253 aa  53.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  26.86 
 
 		 236 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0853  DTW domain containing protein  28.48 
 
 		 238 aa  52.8  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2326  DTW domain-containing protein  27.68 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2326  DTW domain-containing protein  27.67 
 
 		 187 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.644426  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  24.18 
 
 		 249 aa  52.4  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  25.13 
 
 		 239 aa  52  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  28.76 
 
 		 249 aa  51.6  0.000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  27.17 
 
 		 200 aa  51.6  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2442  DTW domain-containing protein  28.25 
 
 		 186 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3956  DTW  25.41 
 
 		 245 aa  51.6  0.000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222792  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  24.4 
 
 		 232 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3586  DTW domain-containing protein  27.78 
 
 		 200 aa  51.2  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1535  hypothetical protein  24.86 
 
 		 238 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  24.43 
 
 		 228 aa  51.2  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  22.45 
 
 		 290 aa  50.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3749  DTW domain-containing protein  27.74 
 
 		 188 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  27.75 
 
 		 188 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1957  DTW domain-containing protein  27.81 
 
 		 227 aa  50.1  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  28.75 
 
 		 207 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  27.67 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1254  DTW domain-containing protein  26.11 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000011005  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  26.38 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2561  DTW  28.36 
 
 		 243 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0180989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  24.06 
 
 		 245 aa  49.3  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1306  DTW domain-containing protein  26.52 
 
 		 156 aa  48.9  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  26.14 
 
 		 226 aa  48.5  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  22.78 
 
 		 247 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17650  hypothetical protein  23.76 
 
 		 238 aa  48.1  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0149  DTW domain-containing protein  25.54 
 
 		 222 aa  48.1  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.768526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  28.22 
 
 		 207 aa  48.1  0.00007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  26.28 
 
 		 232 aa  48.1  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  24.5 
 
 		 232 aa  48.1  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  24.5 
 
 		 232 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>