144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_17650 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_17650  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  482  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1535  hypothetical protein  94.54 
 
 
238 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  74.47 
 
 
244 aa  351  7e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  71.19 
 
 
236 aa  348  5e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  70.34 
 
 
236 aa  347  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  69.92 
 
 
236 aa  342  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  69.92 
 
 
236 aa  341  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  69.49 
 
 
236 aa  340  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  73.28 
 
 
232 aa  339  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3956  DTW  69.07 
 
 
245 aa  325  3e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222792  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1382  DTW  71.19 
 
 
236 aa  324  7e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4750  hypothetical protein  65.74 
 
 
252 aa  316  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565927  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  64.53 
 
 
247 aa  314  9e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3314  DTW domain containing protein  64.02 
 
 
248 aa  299  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0900  DTW domain-containing protein  64.05 
 
 
281 aa  295  5e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3320  DTW domain containing protein  64.92 
 
 
283 aa  291  7e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0873606  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3970  DTW domain-containing protein  64.52 
 
 
253 aa  288  7e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163584 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4284  DTW domain-containing protein  64.41 
 
 
241 aa  275  3e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  46.72 
 
 
239 aa  229  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  54.59 
 
 
234 aa  223  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1391  hypothetical protein  45.96 
 
 
247 aa  219  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3492  DTW domain containing protein  51.1 
 
 
244 aa  214  8e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  43.93 
 
 
247 aa  211  7e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  49.08 
 
 
232 aa  207  1e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  49.08 
 
 
232 aa  207  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  49.08 
 
 
232 aa  207  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  49.78 
 
 
249 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  48.62 
 
 
232 aa  207  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2760  DTW domain protein  50.23 
 
 
226 aa  206  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00353783  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  48.62 
 
 
232 aa  206  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  48.62 
 
 
232 aa  206  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2866  DTW domain-containing protein  50.23 
 
 
226 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2862  DTW domain protein  50.23 
 
 
226 aa  206  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  0.735331 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  44.24 
 
 
245 aa  206  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  48.62 
 
 
232 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02441  hypothetical protein  48.62 
 
 
232 aa  206  4e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  50.23 
 
 
226 aa  205  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  48.17 
 
 
232 aa  204  9e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2978  hypothetical protein  49.55 
 
 
226 aa  202  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  49.34 
 
 
249 aa  202  4e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3068  DTW domain-containing protein  50.69 
 
 
232 aa  201  7e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118921 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  48.15 
 
 
256 aa  201  9e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  48.23 
 
 
237 aa  201  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  49.12 
 
 
249 aa  200  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  48.15 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  48.15 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  48.15 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  48.15 
 
 
254 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  44.49 
 
 
252 aa  199  3e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  47.69 
 
 
251 aa  198  5e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  48.61 
 
 
254 aa  198  6e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  46.03 
 
 
254 aa  198  7e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003511  putative cytoplasmic protein  41.63 
 
 
264 aa  198  7.999999999999999e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  48.15 
 
 
254 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  48.18 
 
 
247 aa  194  7e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  44.3 
 
 
290 aa  192  3e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2086  DTW domain-containing protein  42.98 
 
 
253 aa  192  4e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  41.32 
 
 
267 aa  192  5e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  50.71 
 
 
228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1543  DTW domain-containing protein  42.5 
 
 
266 aa  187  8e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  44.35 
 
 
249 aa  186  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02075  hypothetical cytosolic protein  46.26 
 
 
230 aa  185  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0853  DTW domain containing protein  50.46 
 
 
238 aa  180  1e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2330  DTW domain-containing protein  42.79 
 
 
249 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000604871  normal  0.102486 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02256  hypothetical protein  42.78 
 
 
194 aa  149  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  40.28 
 
 
245 aa  142  4e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2540  DTW domain-containing protein  33.33 
 
 
236 aa  122  5e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.565238 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  37.91 
 
 
201 aa  115  6.9999999999999995e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  36.05 
 
 
195 aa  108  5e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  36.16 
 
 
198 aa  105  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00304  hypothetical protein  36.59 
 
 
170 aa  99  6e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1306  DTW domain-containing protein  36.02 
 
 
156 aa  85.9  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  31.55 
 
 
199 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  31.55 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  31.89 
 
 
199 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  32.95 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  28.65 
 
 
199 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2058  DTW  33.13 
 
 
203 aa  70.5  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2613  hypothetical protein  31.11 
 
 
177 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1461  DTW domain containing protein  29.2 
 
 
246 aa  69.7  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  29 
 
 
209 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2099  DTW domain-containing protein  31.46 
 
 
189 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004037  hypothetical protein  27.27 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2829  DTW domain-containing protein  27.84 
 
 
200 aa  67  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  30.86 
 
 
241 aa  67  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  28.28 
 
 
200 aa  67  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  33.33 
 
 
197 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1899  DTW domain containing protein  32.52 
 
 
203 aa  66.2  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  29.38 
 
 
199 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1820  DTW domain containing protein  32.52 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  30.06 
 
 
207 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  25.26 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2386  DTW domain-containing protein  30.54 
 
 
171 aa  64.3  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  30.36 
 
 
207 aa  63.5  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  30.36 
 
 
207 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2326  DTW domain-containing protein  35.62 
 
 
187 aa  63.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.644426  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3007  DTW domain containing protein  30.77 
 
 
175 aa  63.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000157344  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  25.75 
 
 
197 aa  61.6  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2326  DTW domain-containing protein  32.08 
 
 
186 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2442  DTW domain-containing protein  32.08 
 
 
186 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>