148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1289 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  100 
 
 		 244 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  71.67 
 
 		 236 aa  353  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17650  hypothetical protein  74.47 
 
 		 238 aa  351  8e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  73.16 
 
 		 232 aa  348  5e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  71.24 
 
 		 236 aa  345  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  71.24 
 
 		 236 aa  345  4e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  70.39 
 
 		 236 aa  343  1e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1535  hypothetical protein  72.77 
 
 		 238 aa  343  2e-93  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  65.24 
 
 		 236 aa  323  1e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3956  DTW  69.23 
 
 		 245 aa  323  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222792  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4750  hypothetical protein  64.11 
 
 		 252 aa  307  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565927  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  63.95 
 
 		 247 aa  306  3e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1382  DTW  66.09 
 
 		 236 aa  302  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3314  DTW domain containing protein  60.92 
 
 		 248 aa  289  3e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0900  DTW domain-containing protein  59.67 
 
 		 281 aa  285  4e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3320  DTW domain containing protein  61.54 
 
 		 283 aa  284  8e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0873606  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3970  DTW domain-containing protein  62.14 
 
 		 253 aa  284  1.0000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163584 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4284  DTW domain-containing protein  62.95 
 
 		 241 aa  280  2e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3492  DTW domain containing protein  53.54 
 
 		 244 aa  224  8e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1391  hypothetical protein  48.62 
 
 		 247 aa  224  1e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  45.73 
 
 		 239 aa  217  2e-55  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  52.31 
 
 		 234 aa  215  5.9999999999999996e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  51.06 
 
 		 249 aa  214  7e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2760  DTW domain protein  51.56 
 
 		 226 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00353783  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  50.64 
 
 		 249 aa  213  1.9999999999999998e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  51.15 
 
 		 232 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2862  DTW domain protein  51.56 
 
 		 226 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  0.735331 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  51.15 
 
 		 232 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2866  DTW domain-containing protein  51.56 
 
 		 226 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  51.15 
 
 		 232 aa  213  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  51.56 
 
 		 226 aa  212  4.9999999999999996e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  50.69 
 
 		 232 aa  211  7e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  50.69 
 
 		 232 aa  211  7e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  50.69 
 
 		 232 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02441  hypothetical protein  50.69 
 
 		 232 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  50.23 
 
 		 232 aa  210  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  51.56 
 
 		 249 aa  210  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  50.23 
 
 		 232 aa  209  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2978  hypothetical protein  51.11 
 
 		 226 aa  208  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3068  DTW domain-containing protein  53.95 
 
 		 232 aa  208  7e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118921 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  46.41 
 
 		 254 aa  207  9e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  46.41 
 
 		 254 aa  207  9e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  46.41 
 
 		 254 aa  207  9e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  45.49 
 
 		 290 aa  207  1e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  47.51 
 
 		 254 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  47.06 
 
 		 256 aa  205  5e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  52.07 
 
 		 228 aa  204  7e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  46.4 
 
 		 252 aa  204  7e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  45.7 
 
 		 247 aa  204  8e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  45.7 
 
 		 251 aa  201  9e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  51.16 
 
 		 237 aa  197  9e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  44.55 
 
 		 245 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  44.69 
 
 		 267 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2086  DTW domain-containing protein  43.04 
 
 		 253 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  46.9 
 
 		 247 aa  195  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003511  putative cytoplasmic protein  42.31 
 
 		 264 aa  195  6e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  46.15 
 
 		 254 aa  194  8.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  44.73 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  44.54 
 
 		 254 aa  194  1e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0853  DTW domain containing protein  53.49 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  45.41 
 
 		 249 aa  188  7e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02075  hypothetical cytosolic protein  44.6 
 
 		 230 aa  181  9.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1543  DTW domain-containing protein  41 
 
 		 266 aa  179  4e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2330  DTW domain-containing protein  47.03 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000604871  normal  0.102486 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  41.59 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02256  hypothetical protein  41.24 
 
 		 194 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2540  DTW domain-containing protein  33.63 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.565238 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  36.51 
 
 		 201 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  34.76 
 
 		 195 aa  113  3e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  37.7 
 
 		 198 aa  110  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00304  hypothetical protein  33.95 
 
 		 170 aa  99.8  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2386  DTW domain-containing protein  34.32 
 
 		 171 aa  82  0.000000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1306  DTW domain-containing protein  36.48 
 
 		 156 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3007  DTW domain containing protein  32.73 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000157344  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2099  DTW domain-containing protein  34.68 
 
 		 189 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  29.59 
 
 		 200 aa  76.3  0.0000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  29.21 
 
 		 197 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  32.52 
 
 		 199 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  34.43 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  28.95 
 
 		 223 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1461  DTW domain containing protein  31.67 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  31.38 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  29.71 
 
 		 199 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1565  DTW domain-containing protein  31.93 
 
 		 167 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  29.71 
 
 		 199 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  28.99 
 
 		 188 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  31.06 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0179  DTW  28.36 
 
 		 199 aa  69.7  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.165291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  29.88 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2613  hypothetical protein  32.18 
 
 		 177 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  30.43 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2326  DTW domain-containing protein  34.39 
 
 		 186 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  30.49 
 
 		 209 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  28.57 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  30.43 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2058  DTW  35.37 
 
 		 203 aa  67  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46020  hypothetical protein  31.22 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.637513  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2401  DTW domain-containing protein  35 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1919  DTW domain-containing protein  37.04 
 
 		 164 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2326  DTW domain-containing protein  33.54 
 
 		 187 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.644426  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>