141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00304 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00304  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  347  5e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  75.15 
 
 		 201 aa  265  2e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  44.85 
 
 		 195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  41.21 
 
 		 198 aa  123  9e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  35.33 
 
 		 232 aa  110  7.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3492  DTW domain containing protein  33.33 
 
 		 244 aa  103  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  32.14 
 
 		 249 aa  101  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  31.25 
 
 		 252 aa  100  8e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  32.12 
 
 		 226 aa  100  9e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2862  DTW domain protein  32.12 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  0.735331 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2866  DTW domain-containing protein  32.12 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  37.11 
 
 		 236 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  33.53 
 
 		 249 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2760  DTW domain protein  32.12 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00353783  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  33.95 
 
 		 244 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17650  hypothetical protein  36.59 
 
 		 238 aa  99  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  32.93 
 
 		 249 aa  98.2  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2386  DTW domain-containing protein  34.52 
 
 		 171 aa  98.2  5e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  36.48 
 
 		 236 aa  98.2  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  35.33 
 
 		 236 aa  97.8  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  31.25 
 
 		 254 aa  97.4  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  31.25 
 
 		 254 aa  97.4  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  28.74 
 
 		 247 aa  97.1  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  30.63 
 
 		 254 aa  96.7  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  30.63 
 
 		 254 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  30.63 
 
 		 254 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  30.63 
 
 		 254 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  30.63 
 
 		 254 aa  97.1  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1306  DTW domain-containing protein  39.38 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3068  DTW domain-containing protein  32.1 
 
 		 232 aa  95.9  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118921 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  30 
 
 		 256 aa  96.3  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  36.48 
 
 		 236 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  36.48 
 
 		 236 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  31.85 
 
 		 239 aa  95.9  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  34.34 
 
 		 232 aa  94.7  5e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  33.73 
 
 		 232 aa  94.7  5e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  34.34 
 
 		 232 aa  94.7  5e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2086  DTW domain-containing protein  29.38 
 
 		 253 aa  95.1  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  33.77 
 
 		 228 aa  94.7  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  34.34 
 
 		 232 aa  94.7  5e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  32.12 
 
 		 237 aa  94.7  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0853  DTW domain containing protein  33.93 
 
 		 238 aa  94.4  6e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  33.73 
 
 		 232 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  29.38 
 
 		 251 aa  93.6  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  33.73 
 
 		 232 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  33.73 
 
 		 232 aa  93.6  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02441  hypothetical protein  33.73 
 
 		 232 aa  93.2  1e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  33.73 
 
 		 232 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  27.5 
 
 		 247 aa  92.4  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0900  DTW domain-containing protein  35.29 
 
 		 281 aa  93.2  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3956  DTW  33.12 
 
 		 245 aa  92.4  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222792  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2978  hypothetical protein  30.91 
 
 		 226 aa  92  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1919  DTW domain-containing protein  37.66 
 
 		 164 aa  91.7  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4284  DTW domain-containing protein  31.93 
 
 		 241 aa  91.7  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  27.78 
 
 		 249 aa  91.3  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02075  hypothetical cytosolic protein  27.1 
 
 		 230 aa  91.7  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3007  DTW domain containing protein  31.74 
 
 		 175 aa  90.9  7e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000157344  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1535  hypothetical protein  34.15 
 
 		 238 aa  90.9  7e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2540  DTW domain-containing protein  29.19 
 
 		 236 aa  90.5  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.565238 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  31.17 
 
 		 247 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2613  hypothetical protein  36.97 
 
 		 177 aa  88.6  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  29.3 
 
 		 245 aa  88.6  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3970  DTW domain-containing protein  33.73 
 
 		 253 aa  87.8  7e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163584 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1391  hypothetical protein  31.1 
 
 		 247 aa  87  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  31.1 
 
 		 267 aa  85.9  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3320  DTW domain containing protein  33.73 
 
 		 283 aa  85.5  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0873606  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  30.86 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003511  putative cytoplasmic protein  28.83 
 
 		 264 aa  82.4  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4750  hypothetical protein  31.76 
 
 		 252 aa  81.6  0.000000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565927  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3314  DTW domain containing protein  30.49 
 
 		 248 aa  81.6  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02256  hypothetical protein  28.66 
 
 		 194 aa  81.3  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2326  DTW domain-containing protein  33.33 
 
 		 187 aa  80.9  0.000000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.644426  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  27.65 
 
 		 245 aa  80.1  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2326  DTW domain-containing protein  33.89 
 
 		 186 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1254  DTW domain-containing protein  30.77 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000011005  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2020  DTW domain containing protein  33.89 
 
 		 186 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.443073  hitchhiker  0.00543273 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2099  DTW domain-containing protein  34.66 
 
 		 189 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2442  DTW domain-containing protein  32.78 
 
 		 186 aa  79  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1565  DTW domain-containing protein  28.85 
 
 		 167 aa  78.2  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1382  DTW  35.37 
 
 		 236 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2595  DTW domain-containing protein  38.73 
 
 		 168 aa  77.8  0.00000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.270595 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2330  DTW domain-containing protein  28 
 
 		 249 aa  77.4  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000604871  normal  0.102486 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1543  DTW domain-containing protein  27.66 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  26.74 
 
 		 290 aa  75.1  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  32.3 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2008  DTW domain-containing protein  34.21 
 
 		 174 aa  74.7  0.0000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0597525  hitchhiker  0.00247146 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2423  hypothetical protein  32.05 
 
 		 179 aa  74.3  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.310346  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  32.3 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  32.3 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  31.85 
 
 		 199 aa  71.6  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  30.43 
 
 		 197 aa  71.2  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  30.63 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3616  hypothetical protein  32.61 
 
 		 152 aa  65.1  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337798  hitchhiker  0.00610419 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3749  DTW domain-containing protein  27.45 
 
 		 188 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  26.8 
 
 		 207 aa  62  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  26.8 
 
 		 200 aa  62  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  25.16 
 
 		 209 aa  60.8  0.000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  26.8 
 
 		 207 aa  61.2  0.000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  26.14 
 
 		 188 aa  60.1  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  26.14 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>