143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3447 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  100 
 
 		 209 aa  426  1e-119  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0256  DTW domain-containing protein  49.5 
 
 		 197 aa  201  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  51.76 
 
 		 207 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  50.75 
 
 		 200 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  51.26 
 
 		 207 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  49.76 
 
 		 201 aa  198  6e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  47.03 
 
 		 203 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  50.75 
 
 		 207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3586  DTW domain-containing protein  50 
 
 		 200 aa  191  6e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  50.25 
 
 		 197 aa  190  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  49.73 
 
 		 188 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  48.26 
 
 		 223 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3749  DTW domain-containing protein  48.68 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4270  DTW domain-containing protein  54.65 
 
 		 181 aa  175  6e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3493  hypothetical protein  47.52 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0255  DTW domain-containing protein  50 
 
 		 174 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4292  DTW domain-containing protein  40.98 
 
 		 196 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.616546  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  44.22 
 
 		 197 aa  137  7.999999999999999e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  40.5 
 
 		 199 aa  135  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  39.7 
 
 		 213 aa  135  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1565  hypothetical protein  37.88 
 
 		 200 aa  135  6.0000000000000005e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0932097  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0317  DTW domain-containing protein  39.38 
 
 		 211 aa  134  9.999999999999999e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  41.45 
 
 		 197 aa  131  9e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  40 
 
 		 199 aa  131  9e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  40.93 
 
 		 199 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  40.41 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004037  hypothetical protein  37.93 
 
 		 204 aa  127  1.0000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  39.7 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3914  hypothetical protein  40.4 
 
 		 203 aa  122  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  39.2 
 
 		 199 aa  121  7e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46020  hypothetical protein  38.73 
 
 		 203 aa  121  7e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.637513  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0945  DTW domain-containing protein  40.41 
 
 		 215 aa  111  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0983717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1957  DTW domain-containing protein  38.68 
 
 		 227 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1758  DTW domain containing protein  39 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.370644  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3314  hypothetical protein  40.31 
 
 		 201 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0091  DTW domain-containing protein  40.74 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0889  DTW domain-containing protein  35.27 
 
 		 208 aa  107  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04079  DTW domain containing protein  33.13 
 
 		 194 aa  105  5e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1830  DTW domain-containing protein  38.81 
 
 		 212 aa  102  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2149  DTW domain-containing protein  33.85 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0676  hypothetical protein  38.82 
 
 		 183 aa  102  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390701  unclonable  0.0000000107509 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2058  DTW  34.92 
 
 		 203 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01424  hypothetical protein  36.88 
 
 		 171 aa  96.7  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0863  DTW  35.75 
 
 		 198 aa  95.5  5e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2899  DTW  32.86 
 
 		 243 aa  95.5  5e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.124472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  36.46 
 
 		 241 aa  95.5  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1899  DTW domain containing protein  34.92 
 
 		 203 aa  95.1  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  31.58 
 
 		 256 aa  93.2  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1820  DTW domain containing protein  34.92 
 
 		 202 aa  92.8  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2845  DTW domain containing protein  32.5 
 
 		 243 aa  92  6e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2062  hypothetical protein  30.48 
 
 		 238 aa  91.7  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2561  DTW  32.84 
 
 		 243 aa  89  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0180989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  28.5 
 
 		 254 aa  89.4  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2829  DTW domain-containing protein  34.86 
 
 		 200 aa  88.2  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2572  hypothetical protein  31.43 
 
 		 243 aa  87.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  28.04 
 
 		 251 aa  86.7  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  27.75 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  31.05 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  31.05 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  31.05 
 
 		 254 aa  87  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  29.03 
 
 		 247 aa  86.7  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  31.05 
 
 		 254 aa  86.7  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1520  hypothetical protein  30.95 
 
 		 237 aa  85.9  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0474866  normal  0.0473662 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  27.75 
 
 		 254 aa  85.5  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  28.8 
 
 		 249 aa  85.5  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  32.47 
 
 		 267 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  32.95 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3935  hypothetical protein  30.5 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  29.52 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  27.23 
 
 		 290 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  29.17 
 
 		 252 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2330  DTW domain-containing protein  28.65 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000604871  normal  0.102486 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  33.54 
 
 		 234 aa  77.8  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2760  DTW domain protein  30.67 
 
 		 226 aa  76.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00353783  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2401  DTW domain-containing protein  35.95 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2978  hypothetical protein  30.67 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2866  DTW domain-containing protein  30.67 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2862  DTW domain protein  30.67 
 
 		 226 aa  75.9  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  0.735331 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  26.4 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2086  DTW domain-containing protein  27.71 
 
 		 253 aa  75.9  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  31.71 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_93924  predicted protein  31.07 
 
 		 252 aa  75.1  0.0000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0426424 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  28.4 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  28.4 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  28.4 
 
 		 232 aa  73.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0853  DTW domain containing protein  32.91 
 
 		 238 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  28.4 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  30.06 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  28.22 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  28.4 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  28.4 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  31.33 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1461  DTW domain containing protein  28.11 
 
 		 246 aa  73.2  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  32.32 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  30.53 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  32.32 
 
 		 249 aa  72.4  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1429  hypothetical protein  33.93 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  31.71 
 
 		 249 aa  72  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02075  hypothetical cytosolic protein  23.9 
 
 		 230 aa  72.4  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  28.4 
 
 		 232 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>