143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2058 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_2058  DTW  100 
 
 
203 aa  394  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1899  DTW domain containing protein  95.07 
 
 
203 aa  355  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1820  DTW domain containing protein  94.09 
 
 
202 aa  345  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1739  DTW domain-containing protein  70 
 
 
204 aa  244  8e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.438659 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  44.28 
 
 
197 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  42.93 
 
 
199 aa  130  9e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  43.72 
 
 
199 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  41.41 
 
 
199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  41.41 
 
 
199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  45.7 
 
 
197 aa  124  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  42 
 
 
199 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  41.41 
 
 
199 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  43.48 
 
 
213 aa  115  6e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46020  hypothetical protein  44.32 
 
 
203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.637513  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3914  hypothetical protein  44.15 
 
 
203 aa  112  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  34.92 
 
 
209 aa  102  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0889  DTW domain-containing protein  28.88 
 
 
208 aa  100  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458899  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  35.94 
 
 
241 aa  99.8  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0945  DTW domain-containing protein  37.24 
 
 
215 aa  95.1  5e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0983717  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2062  hypothetical protein  34.65 
 
 
238 aa  94.7  7e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0091  DTW domain-containing protein  37.37 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  31.55 
 
 
223 aa  89  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0863  DTW  32.81 
 
 
198 aa  89  5e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1565  hypothetical protein  30 
 
 
200 aa  87.8  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0932097  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  31.38 
 
 
200 aa  86.7  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2401  DTW domain-containing protein  42.38 
 
 
205 aa  86.3  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663769  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  30.11 
 
 
203 aa  85.1  6e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0256  DTW domain-containing protein  28.11 
 
 
197 aa  85.1  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  32.42 
 
 
207 aa  84.7  8e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  31.87 
 
 
207 aa  84.7  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  31.41 
 
 
188 aa  84  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3314  hypothetical protein  36.76 
 
 
201 aa  84  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1520  hypothetical protein  29.21 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0474866  normal  0.0473662 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0676  hypothetical protein  33.74 
 
 
183 aa  83.2  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390701  unclonable  0.0000000107509 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004037  hypothetical protein  29.69 
 
 
204 aa  83.6  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  29.95 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3586  DTW domain-containing protein  31.28 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1957  DTW domain-containing protein  36 
 
 
227 aa  82.4  0.000000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  31.32 
 
 
207 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_93924  predicted protein  36.7 
 
 
252 aa  82.4  0.000000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0426424 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  29.1 
 
 
197 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1758  DTW domain containing protein  36.15 
 
 
227 aa  80.5  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.370644  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2561  DTW  30.15 
 
 
243 aa  79.7  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0180989  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1830  DTW domain-containing protein  34.18 
 
 
212 aa  79.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2845  DTW domain containing protein  31.31 
 
 
243 aa  79  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2572  hypothetical protein  30.2 
 
 
243 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1429  hypothetical protein  42.14 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3935  hypothetical protein  28.85 
 
 
246 aa  75.9  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3749  DTW domain-containing protein  30.53 
 
 
188 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2149  DTW domain-containing protein  26.09 
 
 
243 aa  74.7  0.0000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4292  DTW domain-containing protein  29.17 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.616546  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04079  DTW domain containing protein  28.14 
 
 
194 aa  72  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1461  DTW domain containing protein  35.26 
 
 
246 aa  72  0.000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1229  DTW domain-containing protein  35.2 
 
 
185 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  33.75 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17650  hypothetical protein  33.13 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  33.75 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  33.75 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2899  DTW  27.23 
 
 
243 aa  70.5  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.124472  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  33.12 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  33.12 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3422  hypothetical protein  34.38 
 
 
202 aa  69.3  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  33.12 
 
 
232 aa  69.7  0.00000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  28.4 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2431  DTW domain containing protein  40.88 
 
 
201 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  33.12 
 
 
232 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02441  hypothetical protein  33.12 
 
 
232 aa  69.3  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  33.12 
 
 
232 aa  68.9  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2829  DTW domain-containing protein  29.79 
 
 
200 aa  69.3  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1535  hypothetical protein  33.74 
 
 
238 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2518  DTW domain containing protein  40.25 
 
 
201 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  32.1 
 
 
247 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  30.25 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4270  DTW domain-containing protein  30.57 
 
 
181 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  35.37 
 
 
244 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0179  DTW  35.45 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.165291  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2862  DTW domain protein  31.05 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  0.735331 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2866  DTW domain-containing protein  31.05 
 
 
226 aa  65.9  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  30.82 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0317  DTW domain-containing protein  29.79 
 
 
211 aa  65.1  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3956  DTW  32.61 
 
 
245 aa  64.3  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222792  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2978  hypothetical protein  31.55 
 
 
226 aa  64.7  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  31.55 
 
 
226 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  27.22 
 
 
247 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  30.3 
 
 
236 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  31.9 
 
 
232 aa  62.8  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2760  DTW domain protein  30.65 
 
 
226 aa  62.8  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00353783  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0255  DTW domain-containing protein  25.61 
 
 
174 aa  62  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01424  hypothetical protein  29.73 
 
 
171 aa  62  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1306  DTW domain-containing protein  32.85 
 
 
156 aa  61.6  0.000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  30.3 
 
 
236 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0900  DTW domain-containing protein  32.37 
 
 
281 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  29.41 
 
 
249 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  29.94 
 
 
236 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  30.3 
 
 
236 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3492  DTW domain containing protein  31.82 
 
 
244 aa  59.7  0.00000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0853  DTW domain containing protein  32.86 
 
 
238 aa  58.9  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  29.19 
 
 
228 aa  58.5  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  28.88 
 
 
249 aa  58.2  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  29.7 
 
 
201 aa  56.6  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>