145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3342 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  100 
 
 		 249 aa  470  1e-132  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  99.56 
 
 		 249 aa  468  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  100 
 
 		 228 aa  469  1.0000000000000001e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  71.23 
 
 		 234 aa  317  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  66.67 
 
 		 249 aa  284  7e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3492  DTW domain containing protein  65.26 
 
 		 244 aa  283  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  66.04 
 
 		 237 aa  276  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  63.33 
 
 		 232 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0853  DTW domain containing protein  69.27 
 
 		 238 aa  269  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02441  hypothetical protein  63.33 
 
 		 232 aa  269  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  63.33 
 
 		 232 aa  268  5e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  63.33 
 
 		 232 aa  268  5e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  63.33 
 
 		 232 aa  268  5e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  63.33 
 
 		 232 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  63.33 
 
 		 232 aa  268  7e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  63.33 
 
 		 232 aa  268  7e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  62.86 
 
 		 232 aa  266  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2862  DTW domain protein  61.43 
 
 		 226 aa  254  7e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  0.735331 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2866  DTW domain-containing protein  61.43 
 
 		 226 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  60.85 
 
 		 226 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2760  DTW domain protein  60.95 
 
 		 226 aa  251  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00353783  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2978  hypothetical protein  60.19 
 
 		 226 aa  247  1e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3068  DTW domain-containing protein  60.38 
 
 		 232 aa  245  4e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118921 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  52.07 
 
 		 244 aa  217  1e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  49.77 
 
 		 252 aa  207  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1535  hypothetical protein  51.89 
 
 		 238 aa  202  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  51.21 
 
 		 236 aa  202  4e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  51.21 
 
 		 236 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  50.72 
 
 		 236 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17650  hypothetical protein  50.71 
 
 		 238 aa  201  6e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  50.72 
 
 		 236 aa  201  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  48.31 
 
 		 236 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1382  DTW  52.17 
 
 		 236 aa  199  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1391  hypothetical protein  47.64 
 
 		 247 aa  198  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3956  DTW  50 
 
 		 245 aa  198  6e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222792  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  52.13 
 
 		 247 aa  198  7e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  47.17 
 
 		 247 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  51.23 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2086  DTW domain-containing protein  47.64 
 
 		 253 aa  194  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0900  DTW domain-containing protein  48.02 
 
 		 281 aa  193  2e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  47.39 
 
 		 256 aa  192  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  46.92 
 
 		 254 aa  191  6e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  46.92 
 
 		 254 aa  191  6e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  46.92 
 
 		 254 aa  191  6e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  46.92 
 
 		 254 aa  191  6e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  46.92 
 
 		 251 aa  190  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  45.5 
 
 		 239 aa  189  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  46.45 
 
 		 254 aa  189  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  46.45 
 
 		 254 aa  188  5.999999999999999e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3320  DTW domain containing protein  51.43 
 
 		 283 aa  186  2e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0873606  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  43.72 
 
 		 267 aa  186  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  45.5 
 
 		 254 aa  186  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3970  DTW domain-containing protein  51.21 
 
 		 253 aa  185  6e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163584 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1543  DTW domain-containing protein  44.96 
 
 		 266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2330  DTW domain-containing protein  47.83 
 
 		 249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000604871  normal  0.102486 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  44.44 
 
 		 290 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3314  DTW domain containing protein  48.84 
 
 		 248 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  45.54 
 
 		 249 aa  182  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4750  hypothetical protein  47.96 
 
 		 252 aa  181  9.000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565927  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02075  hypothetical cytosolic protein  47.37 
 
 		 230 aa  176  2e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4284  DTW domain-containing protein  47.09 
 
 		 241 aa  175  6e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003511  putative cytoplasmic protein  40.09 
 
 		 264 aa  168  5e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  41.67 
 
 		 247 aa  162  3e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  39.81 
 
 		 245 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  39.81 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02256  hypothetical protein  43.03 
 
 		 194 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2540  DTW domain-containing protein  34.39 
 
 		 236 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.565238 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  34.32 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  34.71 
 
 		 195 aa  102  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  33.92 
 
 		 201 aa  98.6  7e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00304  hypothetical protein  33.77 
 
 		 170 aa  94.7  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0889  DTW domain-containing protein  31.76 
 
 		 208 aa  77.8  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2386  DTW domain-containing protein  31.95 
 
 		 171 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2099  DTW domain-containing protein  30.86 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1306  DTW domain-containing protein  32.7 
 
 		 156 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1919  DTW domain-containing protein  32.05 
 
 		 164 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1461  DTW domain containing protein  30.9 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0256  DTW domain-containing protein  26.09 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  32.32 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1254  DTW domain-containing protein  32.28 
 
 		 161 aa  72.8  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000011005  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  32.05 
 
 		 197 aa  71.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0945  DTW domain-containing protein  28.99 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0983717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  30.06 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  31.18 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2613  hypothetical protein  30.46 
 
 		 177 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  30 
 
 		 199 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3007  DTW domain containing protein  31.85 
 
 		 175 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000157344  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0149  DTW domain-containing protein  30.6 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.768526  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  29.78 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  31.1 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  26.99 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  31.1 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1565  DTW domain-containing protein  32.91 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  28.1 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  26.79 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  27.27 
 
 		 207 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  26.62 
 
 		 241 aa  64.3  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1830  DTW domain-containing protein  30.57 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2595  DTW domain-containing protein  28.4 
 
 		 168 aa  63.5  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.270595 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3749  DTW domain-containing protein  26.97 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>