88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0149 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0149  DTW domain-containing protein  100 
 
 		 222 aa  442  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.768526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  26.27 
 
 		 249 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2086  DTW domain-containing protein  26.73 
 
 		 253 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  30.6 
 
 		 228 aa  66.6  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  27.59 
 
 		 252 aa  67  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  30.6 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  30.6 
 
 		 237 aa  67  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  26.34 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  30.6 
 
 		 249 aa  66.6  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  28.19 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1391  hypothetical protein  26.32 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1461  DTW domain containing protein  30.3 
 
 		 246 aa  62.4  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003511  putative cytoplasmic protein  23.47 
 
 		 264 aa  62  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  28.57 
 
 		 234 aa  61.6  0.000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  27.96 
 
 		 247 aa  62  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3492  DTW domain containing protein  29.61 
 
 		 244 aa  60.5  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  26.02 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  24.74 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  24.74 
 
 		 254 aa  58.5  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02075  hypothetical cytosolic protein  28.92 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2330  DTW domain-containing protein  28.22 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000604871  normal  0.102486 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  28.49 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  25 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2760  DTW domain protein  29.73 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00353783  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  27.66 
 
 		 232 aa  57  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2862  DTW domain protein  28.42 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  0.735331 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2866  DTW domain-containing protein  28.57 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  29.12 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  23.71 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  27.66 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  27.66 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  23.71 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02441  hypothetical protein  27.66 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  27.66 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  29.12 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  23.71 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  29.12 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  27.66 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  23.71 
 
 		 254 aa  56.2  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  28.57 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  29.21 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3007  DTW domain containing protein  31.79 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000157344  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1535  hypothetical protein  30.16 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  23.71 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  23.86 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1543  DTW domain-containing protein  26.05 
 
 		 266 aa  54.7  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  26.67 
 
 		 267 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2540  DTW domain-containing protein  22.28 
 
 		 236 aa  53.9  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.565238 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3422  hypothetical protein  27.14 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  23.22 
 
 		 290 aa  52.8  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17650  hypothetical protein  29.52 
 
 		 238 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2978  hypothetical protein  28.04 
 
 		 226 aa  52.4  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0179  DTW  28.21 
 
 		 199 aa  52  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.165291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1254  DTW domain-containing protein  29.65 
 
 		 161 aa  52.4  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000011005  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  23.2 
 
 		 251 aa  52  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0853  DTW domain containing protein  27.61 
 
 		 238 aa  51.6  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1565  DTW domain-containing protein  29.33 
 
 		 167 aa  51.6  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0900  DTW domain-containing protein  30.68 
 
 		 281 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  27.98 
 
 		 236 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  26.8 
 
 		 236 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0863  DTW  27.06 
 
 		 198 aa  49.7  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  28.22 
 
 		 236 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04079  DTW domain containing protein  21.31 
 
 		 194 aa  48.9  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  28.22 
 
 		 236 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  23.73 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  28.49 
 
 		 232 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4284  DTW domain-containing protein  28.87 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  25.77 
 
 		 247 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  23.16 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1229  DTW domain-containing protein  25.54 
 
 		 185 aa  48.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02256  hypothetical protein  23.67 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  24.57 
 
 		 198 aa  46.2  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2099  DTW domain-containing protein  26.7 
 
 		 189 aa  46.2  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1565  hypothetical protein  25.61 
 
 		 200 aa  45.4  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0932097  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  24.27 
 
 		 245 aa  45.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2613  hypothetical protein  29.27 
 
 		 177 aa  44.7  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  24.07 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  22.98 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3068  DTW domain-containing protein  29.68 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118921 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  23.64 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004037  hypothetical protein  24.02 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3586  DTW domain-containing protein  25.15 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  24.73 
 
 		 236 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2423  hypothetical protein  26.14 
 
 		 179 aa  42.4  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.310346  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  23.46 
 
 		 203 aa  42  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  24.69 
 
 		 200 aa  42  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1830  DTW domain-containing protein  26.23 
 
 		 212 aa  41.6  0.008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0676  hypothetical protein  23.7 
 
 		 183 aa  41.6  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390701  unclonable  0.0000000107509 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>