149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3422 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3422  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  404  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0179  DTW  82.41 
 
 		 199 aa  322  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.165291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1229  DTW domain-containing protein  76.63 
 
 		 185 aa  280  7.000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1461  DTW domain containing protein  45.92 
 
 		 246 aa  157  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  34.76 
 
 		 199 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  36.98 
 
 		 213 aa  95.1  6e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  34.92 
 
 		 199 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  34.22 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  34.22 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2401  DTW domain-containing protein  38.31 
 
 		 205 aa  87.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  30.77 
 
 		 245 aa  86.7  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3914  hypothetical protein  33.51 
 
 		 203 aa  84.7  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1429  hypothetical protein  34.57 
 
 		 201 aa  84.7  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  33.69 
 
 		 197 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46020  hypothetical protein  33.68 
 
 		 203 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.637513  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  32.09 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  33.33 
 
 		 197 aa  81.3  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  31.55 
 
 		 199 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  28.5 
 
 		 247 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2431  DTW domain containing protein  33.51 
 
 		 201 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  27.4 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  27.4 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  27.4 
 
 		 254 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2518  DTW domain containing protein  32.98 
 
 		 201 aa  74.7  0.0000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  27.4 
 
 		 254 aa  74.7  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  24.51 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  26.83 
 
 		 256 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2058  DTW  34.38 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1820  DTW domain containing protein  33.16 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4292  DTW domain-containing protein  23.95 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.616546  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  26.44 
 
 		 267 aa  68.2  0.00000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1899  DTW domain containing protein  33.16 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04079  DTW domain containing protein  20.99 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2330  DTW domain-containing protein  25.62 
 
 		 249 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000604871  normal  0.102486 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  27.59 
 
 		 245 aa  65.1  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1739  DTW domain-containing protein  33.86 
 
 		 204 aa  65.1  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.438659 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0863  DTW  28.24 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  25 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  26.7 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  27 
 
 		 244 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  24.88 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2386  DTW domain-containing protein  28.32 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  24.86 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  25 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  25 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  24.75 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  25.5 
 
 		 234 aa  62.4  0.000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  27.8 
 
 		 247 aa  62.4  0.000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  24.15 
 
 		 249 aa  62  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1535  hypothetical protein  27 
 
 		 238 aa  62  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  23.47 
 
 		 236 aa  62  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  24.24 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  27.17 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  23 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  26.62 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  27.33 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1391  hypothetical protein  20.5 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  23.38 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  26.26 
 
 		 249 aa  60.1  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2086  DTW domain-containing protein  22.93 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1520  hypothetical protein  29.8 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0474866  normal  0.0473662 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2595  DTW domain-containing protein  29.8 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.270595 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  27.11 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  26.09 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02075  hypothetical cytosolic protein  22.66 
 
 		 230 aa  58.5  0.00000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  29.56 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  25.79 
 
 		 209 aa  58.5  0.00000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  25.76 
 
 		 249 aa  58.2  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3956  DTW  24.88 
 
 		 245 aa  57.4  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222792  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1758  DTW domain containing protein  28.7 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.370644  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17650  hypothetical protein  27 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1957  DTW domain-containing protein  27.48 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  26.63 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  25.77 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1382  DTW  25.25 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0676  hypothetical protein  27.78 
 
 		 183 aa  56.6  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390701  unclonable  0.0000000107509 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2099  DTW domain-containing protein  28.42 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3586  DTW domain-containing protein  24.35 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  25.4 
 
 		 228 aa  56.2  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  27.51 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  27.6 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2561  DTW  26.37 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0180989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4284  DTW domain-containing protein  27.18 
 
 		 241 aa  55.8  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2845  DTW domain containing protein  27.41 
 
 		 243 aa  55.8  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3314  DTW domain containing protein  24.63 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2866  DTW domain-containing protein  27.04 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2862  DTW domain protein  27.04 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  0.735331 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  25.26 
 
 		 232 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45608  predicted protein  29.41 
 
 		 342 aa  53.9  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.217308  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2978  hypothetical protein  27.04 
 
 		 226 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  24.19 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  25.26 
 
 		 232 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  23.12 
 
 		 203 aa  54.3  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0945  DTW domain-containing protein  28.71 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0983717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1254  DTW domain-containing protein  27.39 
 
 		 161 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000011005  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  27.5 
 
 		 226 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02441  hypothetical protein  25.26 
 
 		 232 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  25.26 
 
 		 232 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0900  DTW domain-containing protein  26.4 
 
 		 281 aa  53.9  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2062  hypothetical protein  26.83 
 
 		 238 aa  53.9  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>