144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2099 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2099  DTW domain-containing protein  100 
 
 		 189 aa  388  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2386  DTW domain-containing protein  48.28 
 
 		 171 aa  157  7e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1919  DTW domain-containing protein  47.67 
 
 		 164 aa  147  6e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2595  DTW domain-containing protein  48.26 
 
 		 168 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.270595 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2008  DTW domain-containing protein  43.33 
 
 		 174 aa  144  9e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0597525  hitchhiker  0.00247146 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2442  DTW domain-containing protein  47.22 
 
 		 186 aa  141  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2326  DTW domain-containing protein  45.86 
 
 		 187 aa  139  3e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.644426  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2326  DTW domain-containing protein  44.92 
 
 		 186 aa  136  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2020  DTW domain containing protein  44.92 
 
 		 186 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.443073  hitchhiker  0.00543273 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1565  DTW domain-containing protein  35.43 
 
 		 167 aa  124  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3007  DTW domain containing protein  34.24 
 
 		 175 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000157344  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1306  DTW domain-containing protein  40 
 
 		 156 aa  115  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2423  hypothetical protein  38.07 
 
 		 179 aa  111  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.310346  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2613  hypothetical protein  36.02 
 
 		 177 aa  103  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1254  DTW domain-containing protein  34.29 
 
 		 161 aa  95.9  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000011005  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  32.37 
 
 		 198 aa  90.1  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  33.15 
 
 		 195 aa  85.5  4e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3616  hypothetical protein  33.33 
 
 		 152 aa  85.1  5e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337798  hitchhiker  0.00610419 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  30.43 
 
 		 247 aa  82.8  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  33.89 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00304  hypothetical protein  34.66 
 
 		 170 aa  79.3  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  33.52 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  32.95 
 
 		 236 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  34.68 
 
 		 244 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  30.86 
 
 		 249 aa  77.8  0.00000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  32.95 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  33.52 
 
 		 236 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  30.86 
 
 		 249 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  30.86 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  33.71 
 
 		 247 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  30.86 
 
 		 252 aa  75.1  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3068  DTW domain-containing protein  29.38 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118921 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  31.07 
 
 		 226 aa  74.7  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3956  DTW  32.09 
 
 		 245 aa  74.3  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222792  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2862  DTW domain protein  30.51 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  0.735331 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  32.77 
 
 		 237 aa  73.2  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2866  DTW domain-containing protein  30.51 
 
 		 226 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  33.9 
 
 		 232 aa  72.8  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  29.38 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  29.38 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  29.38 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  29.38 
 
 		 232 aa  72  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  29.38 
 
 		 232 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  29.38 
 
 		 232 aa  72  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  29.55 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  29.38 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02441  hypothetical protein  29.38 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  29.38 
 
 		 232 aa  71.2  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2760  DTW domain protein  28.81 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00353783  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  31.4 
 
 		 236 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4284  DTW domain-containing protein  31.79 
 
 		 241 aa  70.1  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1535  hypothetical protein  31.46 
 
 		 238 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  31.43 
 
 		 249 aa  68.6  0.00000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4750  hypothetical protein  31.89 
 
 		 252 aa  68.6  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565927  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0900  DTW domain-containing protein  30.81 
 
 		 281 aa  68.6  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  27.27 
 
 		 247 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1391  hypothetical protein  28.81 
 
 		 247 aa  67.8  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2978  hypothetical protein  29.94 
 
 		 226 aa  67  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17650  hypothetical protein  31.46 
 
 		 238 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  31.43 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2540  DTW domain-containing protein  26.14 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.565238 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1543  DTW domain-containing protein  28.57 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3320  DTW domain containing protein  32.02 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0873606  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3970  DTW domain-containing protein  31.64 
 
 		 253 aa  65.5  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163584 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  26.82 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  26.82 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  26.82 
 
 		 254 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  26.82 
 
 		 254 aa  64.3  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1830  DTW domain-containing protein  31.96 
 
 		 212 aa  63.2  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0853  DTW domain containing protein  29.81 
 
 		 238 aa  62.8  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3314  DTW domain containing protein  31.84 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02075  hypothetical cytosolic protein  28.98 
 
 		 230 aa  62.4  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  26.97 
 
 		 249 aa  62.4  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3492  DTW domain containing protein  30.29 
 
 		 244 aa  62.4  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  27.93 
 
 		 251 aa  62  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  28.49 
 
 		 254 aa  61.6  0.000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  27.37 
 
 		 256 aa  61.6  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3935  hypothetical protein  28.34 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0179  DTW  28 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.165291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  28.49 
 
 		 254 aa  60.1  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  26.52 
 
 		 267 aa  59.7  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  30.11 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02256  hypothetical protein  27.59 
 
 		 194 aa  59.7  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0945  DTW domain-containing protein  30.81 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0983717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  25.65 
 
 		 290 aa  58.9  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  27.37 
 
 		 254 aa  58.9  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003511  putative cytoplasmic protein  25.43 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  25.57 
 
 		 245 aa  58.2  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2330  DTW domain-containing protein  26.29 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000604871  normal  0.102486 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2086  DTW domain-containing protein  25.71 
 
 		 253 aa  57  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3422  hypothetical protein  28.42 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  26.97 
 
 		 245 aa  57  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1461  DTW domain containing protein  27.59 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2845  DTW domain containing protein  26.6 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  35.9 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  32.63 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2561  DTW  26.46 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0180989  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  33.33 
 
 		 199 aa  55.1  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1229  DTW domain-containing protein  28.57 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  29.68 
 
 		 241 aa  54.7  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>