113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_3616 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_3616  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  313  5e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337798  hitchhiker  0.00610419 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3007  DTW domain containing protein  40 
 
 
175 aa  103  6e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000157344  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1306  DTW domain-containing protein  35.53 
 
 
156 aa  99  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1254  DTW domain-containing protein  40.26 
 
 
161 aa  99.4  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000011005  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1565  DTW domain-containing protein  36.94 
 
 
167 aa  97.8  5e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2423  hypothetical protein  38.96 
 
 
179 aa  93.2  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.310346  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2386  DTW domain-containing protein  31.36 
 
 
171 aa  93.2  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2613  hypothetical protein  37.09 
 
 
177 aa  89.4  2e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2442  DTW domain-containing protein  31.15 
 
 
186 aa  87  8e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2008  DTW domain-containing protein  34.32 
 
 
174 aa  86.3  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0597525  hitchhiker  0.00247146 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2326  DTW domain-containing protein  32.1 
 
 
186 aa  85.9  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2099  DTW domain-containing protein  33.33 
 
 
189 aa  85.1  3e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2326  DTW domain-containing protein  30.27 
 
 
187 aa  84.7  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.644426  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  33.12 
 
 
198 aa  84.3  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2020  DTW domain containing protein  31.48 
 
 
186 aa  84  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.443073  hitchhiker  0.00543273 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2595  DTW domain-containing protein  33.53 
 
 
168 aa  83.6  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.270595 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  32.41 
 
 
247 aa  81.6  0.000000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  32.74 
 
 
237 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  33.12 
 
 
232 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  33.12 
 
 
232 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  33.12 
 
 
232 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  33.12 
 
 
232 aa  75.9  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  33.12 
 
 
232 aa  75.5  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  33.12 
 
 
232 aa  75.5  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  32.48 
 
 
232 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02441  hypothetical protein  32.48 
 
 
232 aa  75.1  0.0000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1919  DTW domain-containing protein  35.51 
 
 
164 aa  75.5  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  33.12 
 
 
232 aa  73.9  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2540  DTW domain-containing protein  28.93 
 
 
236 aa  72.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.565238 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  32.32 
 
 
226 aa  71.2  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  31.87 
 
 
249 aa  71.2  0.000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  31.06 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2760  DTW domain protein  31.71 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00353783  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0853  DTW domain containing protein  33.81 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2866  DTW domain-containing protein  31.71 
 
 
226 aa  69.3  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3492  DTW domain containing protein  31.68 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2862  DTW domain protein  31.71 
 
 
226 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  0.735331 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3068  DTW domain-containing protein  31.88 
 
 
232 aa  68.2  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00118921 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  31.45 
 
 
247 aa  67.8  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  30.99 
 
 
245 aa  67  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  33.57 
 
 
201 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  32 
 
 
267 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00304  hypothetical protein  32.61 
 
 
170 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2978  hypothetical protein  31.1 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  29.71 
 
 
236 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02075  hypothetical cytosolic protein  26.22 
 
 
230 aa  64.3  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  30.88 
 
 
254 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  31.91 
 
 
195 aa  63.5  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  30.82 
 
 
254 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2086  DTW domain-containing protein  28.77 
 
 
253 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  31.16 
 
 
236 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  30.15 
 
 
251 aa  62.8  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  31.62 
 
 
254 aa  63.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  33.09 
 
 
247 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  31.06 
 
 
234 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  30.43 
 
 
236 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  30.43 
 
 
236 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  26.32 
 
 
290 aa  61.2  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  30.88 
 
 
256 aa  61.2  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  31.62 
 
 
236 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02256  hypothetical protein  28.57 
 
 
194 aa  60.5  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3956  DTW  29.41 
 
 
245 aa  60.1  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222792  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17650  hypothetical protein  29.22 
 
 
238 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  30.94 
 
 
254 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  30.94 
 
 
254 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  30.63 
 
 
249 aa  60.1  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  30.94 
 
 
254 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  30.94 
 
 
254 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003511  putative cytoplasmic protein  28.57 
 
 
264 aa  58.9  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  33.83 
 
 
239 aa  58.9  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  29.41 
 
 
244 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1535  hypothetical protein  29.22 
 
 
238 aa  59.7  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  30 
 
 
249 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  30 
 
 
228 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  27.61 
 
 
249 aa  58.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  27.34 
 
 
252 aa  56.2  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  29.71 
 
 
232 aa  55.8  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_93924  predicted protein  33.33 
 
 
252 aa  55.1  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0426424 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0900  DTW domain-containing protein  26.67 
 
 
281 aa  55.1  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1543  DTW domain-containing protein  30.77 
 
 
266 aa  54.3  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4284  DTW domain-containing protein  27.97 
 
 
241 aa  54.3  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3970  DTW domain-containing protein  25.68 
 
 
253 aa  54.3  0.0000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.163584 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1382  DTW  25.64 
 
 
236 aa  53.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1391  hypothetical protein  30 
 
 
247 aa  53.9  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0317  DTW domain-containing protein  26.67 
 
 
211 aa  53.5  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3320  DTW domain containing protein  36.67 
 
 
283 aa  52  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0873606  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2330  DTW domain-containing protein  28.03 
 
 
249 aa  52  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000604871  normal  0.102486 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4750  hypothetical protein  25.6 
 
 
252 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565927  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3314  DTW domain containing protein  31.08 
 
 
248 aa  51.2  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1461  DTW domain containing protein  27.69 
 
 
246 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2899  DTW  25.16 
 
 
243 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.124472  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1520  hypothetical protein  25.83 
 
 
237 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0474866  normal  0.0473662 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0179  DTW  26.22 
 
 
199 aa  47.4  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.165291  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  23.24 
 
 
197 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2401  DTW domain-containing protein  23.02 
 
 
205 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663769  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  25.17 
 
 
199 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2845  DTW domain containing protein  23.56 
 
 
243 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1429  hypothetical protein  28.36 
 
 
201 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3935  hypothetical protein  31.52 
 
 
246 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  24.65 
 
 
199 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>