145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4284 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4284  DTW domain-containing protein  100 
 
 		 241 aa  486  1e-136  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4750  hypothetical protein  68.03 
 
 		 252 aa  315  5e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565927  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3956  DTW  69.74 
 
 		 245 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222792  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3314  DTW domain containing protein  60.5 
 
 		 248 aa  289  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3320  DTW domain containing protein  64.9 
 
 		 283 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0873606  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0900  DTW domain-containing protein  62.24 
 
 		 281 aa  282  3.0000000000000004e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3970  DTW domain-containing protein  64.05 
 
 		 253 aa  281  5.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163584 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  61.88 
 
 		 236 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  61.43 
 
 		 236 aa  281  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  62.95 
 
 		 244 aa  280  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  61.43 
 
 		 236 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  61.43 
 
 		 236 aa  277  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1535  hypothetical protein  64.71 
 
 		 238 aa  277  1e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  60.71 
 
 		 236 aa  275  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17650  hypothetical protein  64.41 
 
 		 238 aa  275  4e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  61.26 
 
 		 232 aa  267  1e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1382  DTW  62.22 
 
 		 236 aa  255  4e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  58.96 
 
 		 247 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  50.47 
 
 		 234 aa  196  4.0000000000000005e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  40.89 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  46.23 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  45.75 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3492  DTW domain containing protein  46.26 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2760  DTW domain protein  46.51 
 
 		 226 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00353783  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2862  DTW domain protein  46.51 
 
 		 226 aa  175  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  0.735331 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2866  DTW domain-containing protein  46.51 
 
 		 226 aa  175  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1391  hypothetical protein  40.52 
 
 		 247 aa  175  6e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  46.51 
 
 		 226 aa  174  8e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  45.45 
 
 		 232 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  45.45 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  45.45 
 
 		 232 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  45.45 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  45.45 
 
 		 232 aa  173  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  45.45 
 
 		 232 aa  172  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  41.7 
 
 		 245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  45.45 
 
 		 232 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02441  hypothetical protein  45.45 
 
 		 232 aa  172  5e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  40.38 
 
 		 247 aa  172  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  47.42 
 
 		 228 aa  171  7.999999999999999e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2978  hypothetical protein  46.05 
 
 		 226 aa  171  9e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  44.98 
 
 		 232 aa  170  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  46.67 
 
 		 249 aa  169  5e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3068  DTW domain-containing protein  45.24 
 
 		 232 aa  168  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118921 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  41.51 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  42.86 
 
 		 247 aa  166  4e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003511  putative cytoplasmic protein  38.43 
 
 		 264 aa  165  5e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1543  DTW domain-containing protein  39.83 
 
 		 266 aa  165  6.9999999999999995e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  46.41 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  39.57 
 
 		 267 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  41.44 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  41.44 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  41.44 
 
 		 254 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  39.13 
 
 		 290 aa  159  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  40.99 
 
 		 254 aa  159  5e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02075  hypothetical cytosolic protein  44.76 
 
 		 230 aa  159  5e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  39.48 
 
 		 256 aa  158  8e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  42.79 
 
 		 254 aa  158  9e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  42.79 
 
 		 254 aa  158  9e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  42.79 
 
 		 254 aa  158  9e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  42.79 
 
 		 254 aa  158  9e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  40.17 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0853  DTW domain containing protein  49.44 
 
 		 238 aa  155  8e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2086  DTW domain-containing protein  40 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2330  DTW domain-containing protein  39.91 
 
 		 249 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000604871  normal  0.102486 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02256  hypothetical protein  40.43 
 
 		 194 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  37.17 
 
 		 245 aa  123  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  35.68 
 
 		 201 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2540  DTW domain-containing protein  31.28 
 
 		 236 aa  105  4e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.565238 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  32.31 
 
 		 195 aa  102  6e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00304  hypothetical protein  31.93 
 
 		 170 aa  91.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  31.98 
 
 		 198 aa  89.7  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  31.55 
 
 		 207 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2099  DTW domain-containing protein  31.79 
 
 		 189 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1306  DTW domain-containing protein  32.32 
 
 		 156 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  29.71 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  30.95 
 
 		 207 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  30.95 
 
 		 207 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3007  DTW domain containing protein  30.41 
 
 		 175 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000157344  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  30.16 
 
 		 200 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2386  DTW domain-containing protein  31.33 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  33.15 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1565  DTW domain-containing protein  30.32 
 
 		 167 aa  65.5  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  31.03 
 
 		 188 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  28.42 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2613  hypothetical protein  29.49 
 
 		 177 aa  63.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1919  DTW domain-containing protein  33.12 
 
 		 164 aa  62.4  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  32.72 
 
 		 199 aa  62  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  32.72 
 
 		 199 aa  62  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  30 
 
 		 203 aa  61.6  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3749  DTW domain-containing protein  28.9 
 
 		 188 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  31.25 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  28.5 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2008  DTW domain-containing protein  29.45 
 
 		 174 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0597525  hitchhiker  0.00247146 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  26.26 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  31.52 
 
 		 199 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  32.29 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0179  DTW  29.7 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.165291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2326  DTW domain-containing protein  30.63 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.644426  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2442  DTW domain-containing protein  30.82 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2326  DTW domain-containing protein  32.08 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>