154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_1801 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  100 
 
 		 197 aa  390  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  77.55 
 
 		 199 aa  298  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  75.25 
 
 		 199 aa  291  5e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  74.75 
 
 		 199 aa  290  1e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  74.36 
 
 		 197 aa  285  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  72.82 
 
 		 199 aa  279  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  73.33 
 
 		 199 aa  276  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  71.43 
 
 		 199 aa  272  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3914  hypothetical protein  75.13 
 
 		 203 aa  267  7e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46020  hypothetical protein  73.1 
 
 		 203 aa  265  4e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.637513  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  69.39 
 
 		 213 aa  254  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0256  DTW domain-containing protein  39.9 
 
 		 197 aa  141  8e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  44.22 
 
 		 209 aa  137  7e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  40.31 
 
 		 223 aa  137  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3586  DTW domain-containing protein  43.46 
 
 		 200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  39.5 
 
 		 207 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1565  hypothetical protein  39.8 
 
 		 200 aa  132  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0932097  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  39.8 
 
 		 200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  38.5 
 
 		 207 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  38.19 
 
 		 197 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  37.19 
 
 		 201 aa  125  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  38 
 
 		 207 aa  125  5e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2058  DTW  45.7 
 
 		 203 aa  124  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3749  DTW domain-containing protein  40.43 
 
 		 188 aa  121  8e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  39.67 
 
 		 188 aa  120  9e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1739  DTW domain-containing protein  44.97 
 
 		 204 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.438659 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1820  DTW domain containing protein  43.55 
 
 		 202 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1899  DTW domain containing protein  43.55 
 
 		 203 aa  119  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004037  hypothetical protein  36.55 
 
 		 204 aa  118  3.9999999999999996e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4292  DTW domain-containing protein  35.52 
 
 		 196 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.616546  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  34.92 
 
 		 203 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0945  DTW domain-containing protein  42.31 
 
 		 215 aa  114  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0983717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0676  hypothetical protein  40.96 
 
 		 183 aa  114  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390701  unclonable  0.0000000107509 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0317  DTW domain-containing protein  37.69 
 
 		 211 aa  114  8.999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1461  DTW domain containing protein  38.5 
 
 		 246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0889  DTW domain-containing protein  34.33 
 
 		 208 aa  112  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2561  DTW  39.8 
 
 		 243 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0180989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1957  DTW domain-containing protein  41.41 
 
 		 227 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4270  DTW domain-containing protein  38.73 
 
 		 181 aa  109  3e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1758  DTW domain containing protein  41.41 
 
 		 227 aa  108  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.370644  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3314  hypothetical protein  43.23 
 
 		 201 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2149  DTW domain-containing protein  33.82 
 
 		 243 aa  104  7e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1830  DTW domain-containing protein  43.78 
 
 		 212 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0255  DTW domain-containing protein  37.65 
 
 		 174 aa  101  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  39.18 
 
 		 241 aa  100  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2845  DTW domain containing protein  37.31 
 
 		 243 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3935  hypothetical protein  39.56 
 
 		 246 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2572  hypothetical protein  36.18 
 
 		 243 aa  99  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0863  DTW  37.29 
 
 		 198 aa  98.2  8e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3493  hypothetical protein  31.82 
 
 		 205 aa  94  1e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01424  hypothetical protein  35.71 
 
 		 171 aa  94  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0179  DTW  35.45 
 
 		 199 aa  93.6  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.165291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0091  DTW domain-containing protein  43.2 
 
 		 215 aa  91.7  6e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  31.72 
 
 		 201 aa  91.3  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2062  hypothetical protein  33.67 
 
 		 238 aa  90.9  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2829  DTW domain-containing protein  36.53 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1520  hypothetical protein  35.18 
 
 		 237 aa  90.5  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0474866  normal  0.0473662 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1429  hypothetical protein  41.04 
 
 		 201 aa  89.7  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2401  DTW domain-containing protein  41.56 
 
 		 205 aa  89.7  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2899  DTW  33.83 
 
 		 243 aa  88.2  6e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.124472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  32.28 
 
 		 245 aa  87.8  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_93924  predicted protein  31.68 
 
 		 252 aa  85.1  6e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0426424 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3422  hypothetical protein  33.33 
 
 		 202 aa  81.3  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2431  DTW domain containing protein  41.62 
 
 		 201 aa  81.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  32.97 
 
 		 236 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04079  DTW domain containing protein  28.66 
 
 		 194 aa  80.5  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2518  DTW domain containing protein  41.04 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  32.92 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  32.92 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  32.92 
 
 		 232 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  32.92 
 
 		 232 aa  78.2  0.00000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  32.92 
 
 		 232 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  32.92 
 
 		 232 aa  78.2  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  32.92 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  32.97 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02441  hypothetical protein  32.92 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  30.06 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  32.97 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  32.97 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3492  DTW domain containing protein  34.27 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  32.92 
 
 		 232 aa  76.6  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  30.46 
 
 		 195 aa  76.6  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  31.05 
 
 		 232 aa  76.3  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  32.3 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  30.21 
 
 		 247 aa  75.1  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  31.25 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003511  putative cytoplasmic protein  25.39 
 
 		 264 aa  75.1  0.0000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2978  hypothetical protein  31.68 
 
 		 226 aa  74.7  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2862  DTW domain protein  31.68 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  0.735331 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2866  DTW domain-containing protein  31.68 
 
 		 226 aa  74.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  33.15 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  31.38 
 
 		 244 aa  72.4  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0853  DTW domain containing protein  34.78 
 
 		 238 aa  71.6  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  30 
 
 		 236 aa  71.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00304  hypothetical protein  30.43 
 
 		 170 aa  71.2  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  33.93 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2760  DTW domain protein  31.06 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00353783  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  28.95 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  28.95 
 
 		 251 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  28.95 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>