111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2595 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2595  DTW domain-containing protein  100 
 
 		 168 aa  349  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.270595 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2008  DTW domain-containing protein  55.56 
 
 		 174 aa  188  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0597525  hitchhiker  0.00247146 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2386  DTW domain-containing protein  50.87 
 
 		 171 aa  159  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2099  DTW domain-containing protein  48.26 
 
 		 189 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2326  DTW domain-containing protein  43.01 
 
 		 187 aa  140  6e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.644426  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2442  DTW domain-containing protein  43.01 
 
 		 186 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2326  DTW domain-containing protein  43.78 
 
 		 186 aa  137  4.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2020  DTW domain containing protein  43.24 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.443073  hitchhiker  0.00543273 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1919  DTW domain-containing protein  42.51 
 
 		 164 aa  130  9e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1306  DTW domain-containing protein  36.31 
 
 		 156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1565  DTW domain-containing protein  35.15 
 
 		 167 aa  104  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2423  hypothetical protein  38.55 
 
 		 179 aa  102  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.310346  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3007  DTW domain containing protein  31.1 
 
 		 175 aa  93.6  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000157344  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2613  hypothetical protein  35.85 
 
 		 177 aa  91.7  5e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  38.12 
 
 		 198 aa  87  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3616  hypothetical protein  33.53 
 
 		 152 aa  83.6  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337798  hitchhiker  0.00610419 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1254  DTW domain-containing protein  33.79 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000011005  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  36.99 
 
 		 201 aa  80.5  0.000000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00304  hypothetical protein  38.73 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  30.72 
 
 		 195 aa  70.9  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  28.4 
 
 		 249 aa  64.3  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  28.4 
 
 		 249 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  28.4 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0900  DTW domain-containing protein  34.25 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2540  DTW domain-containing protein  27.06 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.565238 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  28.97 
 
 		 247 aa  60.8  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  28.4 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  28.4 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  28.4 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02441  hypothetical protein  28.4 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  28.4 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  28.4 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3422  hypothetical protein  29.8 
 
 		 202 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  30.52 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  28.4 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  28.99 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  28.4 
 
 		 232 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  31.55 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  31.25 
 
 		 244 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  29.45 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  29.45 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  29.88 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  29.88 
 
 		 236 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17650  hypothetical protein  30.67 
 
 		 238 aa  58.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2866  DTW domain-containing protein  28.4 
 
 		 226 aa  57.8  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  31.94 
 
 		 236 aa  57.4  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3956  DTW  29.14 
 
 		 245 aa  57.4  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222792  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  32.56 
 
 		 254 aa  57.4  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  32.56 
 
 		 254 aa  57.4  0.00000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  32.56 
 
 		 254 aa  57.4  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  32.56 
 
 		 254 aa  57.4  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  27.39 
 
 		 197 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0179  DTW  28.77 
 
 		 199 aa  57  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.165291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  31.82 
 
 		 252 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  28.57 
 
 		 249 aa  57  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1229  DTW domain-containing protein  29.17 
 
 		 185 aa  57  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1535  hypothetical protein  31.14 
 
 		 238 aa  57  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  29.45 
 
 		 232 aa  57  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2862  DTW domain protein  28.4 
 
 		 226 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  0.735331 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2760  DTW domain protein  27.81 
 
 		 226 aa  57  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00353783  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3492  DTW domain containing protein  29.86 
 
 		 244 aa  57  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  27.54 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4284  DTW domain-containing protein  27.88 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  31.01 
 
 		 251 aa  55.5  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1543  DTW domain-containing protein  30.97 
 
 		 266 aa  54.7  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0853  DTW domain containing protein  29.17 
 
 		 238 aa  55.1  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  32.56 
 
 		 256 aa  54.3  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4292  DTW domain-containing protein  28.48 
 
 		 196 aa  53.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.616546  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3314  DTW domain containing protein  29.7 
 
 		 248 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3068  DTW domain-containing protein  26.04 
 
 		 232 aa  53.1  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118921 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  26.75 
 
 		 234 aa  52.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3970  DTW domain-containing protein  29.05 
 
 		 253 aa  52.4  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163584 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2978  hypothetical protein  27.81 
 
 		 226 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  26.76 
 
 		 213 aa  52.4  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  30.23 
 
 		 254 aa  52  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3320  DTW domain containing protein  29.05 
 
 		 283 aa  52  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0873606  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  27.63 
 
 		 239 aa  51.6  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02075  hypothetical cytosolic protein  27.12 
 
 		 230 aa  51.2  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1382  DTW  31.19 
 
 		 236 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4750  hypothetical protein  30.5 
 
 		 252 aa  50.4  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565927  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  27.73 
 
 		 290 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  30.23 
 
 		 254 aa  50.4  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  28.89 
 
 		 267 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  28.78 
 
 		 247 aa  50.4  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04079  DTW domain containing protein  22.7 
 
 		 194 aa  50.1  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  29.46 
 
 		 254 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2330  DTW domain-containing protein  27.13 
 
 		 249 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000604871  normal  0.102486 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  24.31 
 
 		 245 aa  48.1  0.00006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  25.36 
 
 		 245 aa  47  0.0001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  29.41 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46020  hypothetical protein  35.09 
 
 		 203 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.637513  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  28.77 
 
 		 197 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  32.14 
 
 		 199 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3914  hypothetical protein  35.09 
 
 		 203 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2401  DTW domain-containing protein  29.79 
 
 		 205 aa  44.3  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  30.12 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2058  DTW  26.06 
 
 		 203 aa  43.5  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  27.46 
 
 		 199 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  27.46 
 
 		 199 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  27.46 
 
 		 199 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>