137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4292 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4292  DTW domain-containing protein  100 
 
 		 196 aa  407  1e-113  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.616546  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  42.08 
 
 		 203 aa  159  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  44.57 
 
 		 200 aa  158  4e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  41.3 
 
 		 201 aa  155  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  42.39 
 
 		 197 aa  154  9e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  40.76 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  40.22 
 
 		 207 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  40.98 
 
 		 209 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  39.67 
 
 		 207 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  42.69 
 
 		 188 aa  142  3e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0317  DTW domain-containing protein  41.48 
 
 		 211 aa  139  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  40.44 
 
 		 223 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0256  DTW domain-containing protein  39.36 
 
 		 197 aa  137  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3749  DTW domain-containing protein  41.28 
 
 		 188 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3586  DTW domain-containing protein  40.68 
 
 		 200 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04079  DTW domain containing protein  36.99 
 
 		 194 aa  133  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4270  DTW domain-containing protein  42.31 
 
 		 181 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0255  DTW domain-containing protein  44.51 
 
 		 174 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  35.52 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  35.38 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  36.61 
 
 		 199 aa  114  6e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  36.61 
 
 		 199 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  35.33 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  34.43 
 
 		 197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  35.33 
 
 		 199 aa  111  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  34.87 
 
 		 199 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3493  hypothetical protein  34.38 
 
 		 205 aa  106  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  33.52 
 
 		 213 aa  105  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2829  DTW domain-containing protein  37.42 
 
 		 200 aa  105  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46020  hypothetical protein  34.97 
 
 		 203 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.637513  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3914  hypothetical protein  33.88 
 
 		 203 aa  102  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1565  hypothetical protein  32.78 
 
 		 200 aa  94.7  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0932097  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0676  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  94  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390701  unclonable  0.0000000107509 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004037  hypothetical protein  31.67 
 
 		 204 aa  91.3  9e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0945  DTW domain-containing protein  35.26 
 
 		 215 aa  90.9  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0983717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1957  DTW domain-containing protein  29.78 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1758  DTW domain containing protein  29.21 
 
 		 227 aa  82.4  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.370644  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0889  DTW domain-containing protein  30.65 
 
 		 208 aa  81.3  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0091  DTW domain-containing protein  31.33 
 
 		 215 aa  81.3  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2149  DTW domain-containing protein  25.52 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  27.41 
 
 		 241 aa  80.9  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3314  hypothetical protein  28.8 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1830  DTW domain-containing protein  32.58 
 
 		 212 aa  80.1  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  25.65 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0863  DTW  30.3 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3935  hypothetical protein  30.39 
 
 		 246 aa  72.8  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1899  DTW domain containing protein  29.76 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2058  DTW  29.17 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  25.26 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2561  DTW  30.15 
 
 		 243 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0180989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1306  DTW domain-containing protein  33.1 
 
 		 156 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1820  DTW domain containing protein  29.76 
 
 		 202 aa  72.4  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2899  DTW  30.5 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.124472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2845  DTW domain containing protein  28.86 
 
 		 243 aa  68.9  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3422  hypothetical protein  23.95 
 
 		 202 aa  68.6  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01424  hypothetical protein  31.17 
 
 		 171 aa  67.4  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2572  hypothetical protein  29.21 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2062  hypothetical protein  28.43 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0179  DTW  26.6 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.165291  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  22.34 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  26.11 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1520  hypothetical protein  28.93 
 
 		 237 aa  64.7  0.0000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0474866  normal  0.0473662 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2386  DTW domain-containing protein  25.6 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1739  DTW domain-containing protein  28.26 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.438659 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2401  DTW domain-containing protein  27.08 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1429  hypothetical protein  25.44 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_93924  predicted protein  28.06 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0426424 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  23.96 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  23.2 
 
 		 245 aa  60.5  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1229  DTW domain-containing protein  25.79 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2431  DTW domain containing protein  26.59 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  22.05 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2086  DTW domain-containing protein  20.67 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2518  DTW domain containing protein  25.44 
 
 		 201 aa  58.5  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1391  hypothetical protein  22.41 
 
 		 247 aa  58.2  0.00000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2760  DTW domain protein  23.12 
 
 		 226 aa  56.6  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00353783  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2978  hypothetical protein  23.12 
 
 		 226 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2540  DTW domain-containing protein  24.39 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.565238 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00304  hypothetical protein  26.63 
 
 		 170 aa  57  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2866  DTW domain-containing protein  23.12 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  22.91 
 
 		 239 aa  56.2  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2862  DTW domain protein  23.12 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  0.735331 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  23.12 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  23.24 
 
 		 254 aa  55.5  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  22.7 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  22.7 
 
 		 256 aa  55.1  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  22.7 
 
 		 254 aa  54.7  0.0000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  23.24 
 
 		 254 aa  54.7  0.0000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1461  DTW domain containing protein  24.85 
 
 		 246 aa  54.7  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  21.51 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2008  DTW domain-containing protein  28.29 
 
 		 174 aa  53.1  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0597525  hitchhiker  0.00247146 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2595  DTW domain-containing protein  28.48 
 
 		 168 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.270595 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003511  putative cytoplasmic protein  22.91 
 
 		 264 aa  53.1  0.000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  22.34 
 
 		 236 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  22.3 
 
 		 234 aa  52.4  0.000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  22.05 
 
 		 232 aa  51.6  0.000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  22.16 
 
 		 254 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  22.16 
 
 		 254 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1919  DTW domain-containing protein  26.06 
 
 		 164 aa  51.6  0.000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  22.16 
 
 		 254 aa  51.6  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>