150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2921 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  510  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  40.37 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  40.83 
 
 		 256 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  39.91 
 
 		 254 aa  165  5e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  40.83 
 
 		 254 aa  166  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  39.91 
 
 		 254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2086  DTW domain-containing protein  39.27 
 
 		 253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  39.45 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  39.45 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  39.45 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  39.45 
 
 		 254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2540  DTW domain-containing protein  41.51 
 
 		 236 aa  162  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.565238 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  41.59 
 
 		 244 aa  159  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1391  hypothetical protein  38.14 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  36.44 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  41.06 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  40.62 
 
 		 237 aa  151  1e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  39.01 
 
 		 249 aa  151  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  37.79 
 
 		 247 aa  150  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3492  DTW domain containing protein  39.01 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  36.99 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  35.78 
 
 		 252 aa  149  4e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003511  putative cytoplasmic protein  33.91 
 
 		 264 aa  148  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  37.38 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  36.12 
 
 		 290 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  38.6 
 
 		 249 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0853  DTW domain containing protein  42.6 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  37.02 
 
 		 234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  39.06 
 
 		 232 aa  146  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1535  hypothetical protein  40.47 
 
 		 238 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  37.5 
 
 		 247 aa  144  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17650  hypothetical protein  40.28 
 
 		 238 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  34.06 
 
 		 245 aa  142  5e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  37.39 
 
 		 236 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3956  DTW  39.92 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222792  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  37.12 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  36.49 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  37.12 
 
 		 236 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  36.49 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  36.49 
 
 		 232 aa  139  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  37.38 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  36.49 
 
 		 232 aa  139  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1382  DTW  38.79 
 
 		 236 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  36.49 
 
 		 232 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  36.49 
 
 		 232 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0900  DTW domain-containing protein  36.82 
 
 		 281 aa  138  1e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  36.49 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02441  hypothetical protein  36.49 
 
 		 232 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  36.04 
 
 		 232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1543  DTW domain-containing protein  34.03 
 
 		 266 aa  135  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02075  hypothetical cytosolic protein  35.89 
 
 		 230 aa  135  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2330  DTW domain-containing protein  38.81 
 
 		 249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000604871  normal  0.102486 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  40.27 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  40.27 
 
 		 249 aa  134  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2760  DTW domain protein  36.04 
 
 		 226 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00353783  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2862  DTW domain protein  36.04 
 
 		 226 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  0.735331 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2866  DTW domain-containing protein  36.04 
 
 		 226 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  36.04 
 
 		 226 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  39.81 
 
 		 228 aa  128  8.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2978  hypothetical protein  35.59 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4284  DTW domain-containing protein  37.17 
 
 		 241 aa  123  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3970  DTW domain-containing protein  38.36 
 
 		 253 aa  119  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163584 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3320  DTW domain containing protein  39.19 
 
 		 283 aa  118  7e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0873606  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4750  hypothetical protein  36.51 
 
 		 252 aa  118  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565927  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3068  DTW domain-containing protein  34.75 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118921 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3314  DTW domain containing protein  34.25 
 
 		 248 aa  116  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02256  hypothetical protein  31.61 
 
 		 194 aa  105  9e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  33.85 
 
 		 195 aa  101  9e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  32.11 
 
 		 201 aa  92.8  5e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0179  DTW  32.2 
 
 		 199 aa  87.8  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.165291  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3422  hypothetical protein  30.77 
 
 		 202 aa  86.7  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1229  DTW domain-containing protein  31.52 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00304  hypothetical protein  27.65 
 
 		 170 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1461  DTW domain containing protein  29.38 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  30.46 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2386  DTW domain-containing protein  30.86 
 
 		 171 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  31.28 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004037  hypothetical protein  29.17 
 
 		 204 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  27.72 
 
 		 207 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  25.13 
 
 		 223 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  27.87 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  27.72 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3586  DTW domain-containing protein  28.65 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  26.74 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  28.95 
 
 		 203 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  27.17 
 
 		 207 aa  72.4  0.000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  26.8 
 
 		 201 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3616  hypothetical protein  31.06 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.337798  hitchhiker  0.00610419 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  25.54 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3749  DTW domain-containing protein  26.14 
 
 		 188 aa  68.9  0.00000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  25.57 
 
 		 188 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  28.28 
 
 		 199 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  29.02 
 
 		 197 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  30.93 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0945  DTW domain-containing protein  26.87 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0983717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4270  DTW domain-containing protein  27.95 
 
 		 181 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  28.35 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  25.81 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  28.08 
 
 		 199 aa  65.5  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0255  DTW domain-containing protein  27.54 
 
 		 174 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.614012 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>