140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1780 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  100 
 
 		 290 aa  603  9.999999999999999e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  72.03 
 
 		 254 aa  382  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  72.27 
 
 		 254 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  70.5 
 
 		 256 aa  378  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  72.27 
 
 		 254 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  72.27 
 
 		 254 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  70.2 
 
 		 251 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  67.05 
 
 		 254 aa  375  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  69.02 
 
 		 254 aa  373  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  68.63 
 
 		 254 aa  371  1e-102  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  65.89 
 
 		 267 aa  355  5e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  61.26 
 
 		 247 aa  329  4e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  58.59 
 
 		 249 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  62.76 
 
 		 252 aa  317  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2330  DTW domain-containing protein  59.68 
 
 		 249 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000604871  normal  0.102486 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2086  DTW domain-containing protein  56.02 
 
 		 253 aa  301  6.000000000000001e-81  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1391  hypothetical protein  47.62 
 
 		 247 aa  231  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  45.57 
 
 		 239 aa  221  9.999999999999999e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1543  DTW domain-containing protein  39.93 
 
 		 266 aa  217  2e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003511  putative cytoplasmic protein  42.49 
 
 		 264 aa  213  2.9999999999999995e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  45.49 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  42.49 
 
 		 245 aa  198  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0900  DTW domain-containing protein  41.08 
 
 		 281 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17650  hypothetical protein  44.3 
 
 		 238 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1535  hypothetical protein  44.74 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3956  DTW  44.26 
 
 		 245 aa  188  9e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.222792  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1382  DTW  43.5 
 
 		 236 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  41.32 
 
 		 249 aa  186  4e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3314  DTW domain containing protein  43.22 
 
 		 248 aa  186  5e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  41.45 
 
 		 236 aa  185  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  43.97 
 
 		 232 aa  185  8e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  42.61 
 
 		 247 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2760  DTW domain protein  41.63 
 
 		 226 aa  181  1e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00353783  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3492  DTW domain containing protein  40.65 
 
 		 244 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2866  DTW domain-containing protein  41.2 
 
 		 226 aa  180  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2862  DTW domain protein  41.2 
 
 		 226 aa  181  2e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  0.735331 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  40.17 
 
 		 234 aa  181  2e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  40.34 
 
 		 232 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  41.2 
 
 		 226 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  40.34 
 
 		 232 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  40.34 
 
 		 232 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  40.34 
 
 		 232 aa  180  2.9999999999999997e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  40.34 
 
 		 232 aa  179  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  40.34 
 
 		 232 aa  179  4e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4750  hypothetical protein  42.49 
 
 		 252 aa  178  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.565927  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02075  hypothetical cytosolic protein  43.58 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1236  DTW domain-containing protein  40.34 
 
 		 236 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000731638 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  39.91 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3320  DTW domain containing protein  42.8 
 
 		 283 aa  176  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0873606  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  39.91 
 
 		 232 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02441  hypothetical protein  39.91 
 
 		 232 aa  176  5e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2978  hypothetical protein  40.77 
 
 		 226 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4083  DTW domain-containing protein  39.91 
 
 		 236 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  39.91 
 
 		 236 aa  175  7e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1634  DTW domain containing protein  39.91 
 
 		 236 aa  175  9e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  40.66 
 
 		 237 aa  175  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3970  DTW domain-containing protein  42.8 
 
 		 253 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.163584 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  42.42 
 
 		 249 aa  172  3.9999999999999995e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  41.99 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  44.44 
 
 		 228 aa  170  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0853  DTW domain containing protein  45.5 
 
 		 238 aa  169  7e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3068  DTW domain-containing protein  41.45 
 
 		 232 aa  167  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00118921 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4284  DTW domain-containing protein  39.13 
 
 		 241 aa  159  6e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02256  hypothetical protein  41.44 
 
 		 194 aa  155  9e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  35.53 
 
 		 247 aa  149  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  36.12 
 
 		 245 aa  147  2.0000000000000003e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2540  DTW domain-containing protein  32.91 
 
 		 236 aa  146  4.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.565238 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  29.63 
 
 		 195 aa  102  7e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  30.93 
 
 		 201 aa  92.4  8e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  27.23 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  26.98 
 
 		 198 aa  77.4  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2613  hypothetical protein  29.09 
 
 		 177 aa  75.1  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00304  hypothetical protein  26.74 
 
 		 170 aa  75.1  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  24.87 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2326  DTW domain-containing protein  28.57 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  25.25 
 
 		 201 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1306  DTW domain-containing protein  28.25 
 
 		 156 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  26.09 
 
 		 241 aa  67.4  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004037  hypothetical protein  24.28 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  26.37 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04079  DTW domain containing protein  24.87 
 
 		 194 aa  67.4  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2020  DTW domain containing protein  28.57 
 
 		 186 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.443073  hitchhiker  0.00543273 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  24.38 
 
 		 223 aa  67  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  28.51 
 
 		 199 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0256  DTW domain-containing protein  25.82 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2326  DTW domain-containing protein  27.96 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.644426  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3586  DTW domain-containing protein  27.93 
 
 		 200 aa  65.1  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2442  DTW domain-containing protein  27.42 
 
 		 186 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  25.87 
 
 		 207 aa  65.1  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  24.75 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  23.76 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  24.61 
 
 		 188 aa  62.4  0.000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  26.6 
 
 		 199 aa  62  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0179  DTW  24.53 
 
 		 199 aa  62  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.165291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  24.88 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  28 
 
 		 199 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  25.74 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0255  DTW domain-containing protein  28.96 
 
 		 174 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  28.08 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1565  hypothetical protein  23.39 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0932097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>