147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3739 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  100 
 
 		 241 aa  495  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  39.9 
 
 		 199 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0863  DTW  41.71 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  38.38 
 
 		 199 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  38.38 
 
 		 199 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  36.87 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1820  DTW domain containing protein  35.02 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  39.18 
 
 		 197 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2058  DTW  35.94 
 
 		 203 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  36.84 
 
 		 199 aa  99  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  38.6 
 
 		 199 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  36.84 
 
 		 197 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  36.46 
 
 		 209 aa  95.5  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1899  DTW domain containing protein  34.1 
 
 		 203 aa  95.5  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0945  DTW domain-containing protein  38.76 
 
 		 215 aa  93.2  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0983717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  31.63 
 
 		 201 aa  93.6  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1758  DTW domain containing protein  36.81 
 
 		 227 aa  93.6  3e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.370644  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  32.86 
 
 		 207 aa  93.2  4e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  31.58 
 
 		 203 aa  92.4  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  31.43 
 
 		 207 aa  91.3  1e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  33.62 
 
 		 213 aa  91.3  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1957  DTW domain-containing protein  36.26 
 
 		 227 aa  90.1  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  32.86 
 
 		 207 aa  90.5  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1739  DTW domain-containing protein  33.79 
 
 		 204 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.438659 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46020  hypothetical protein  36.9 
 
 		 203 aa  88.6  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.637513  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  30.81 
 
 		 197 aa  88.6  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  33.33 
 
 		 200 aa  88.6  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3914  hypothetical protein  36.31 
 
 		 203 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004037  hypothetical protein  31.25 
 
 		 204 aa  86.3  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1830  DTW domain-containing protein  37 
 
 		 212 aa  85.9  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1565  hypothetical protein  32.29 
 
 		 200 aa  85.5  6e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0932097  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2561  DTW  30.21 
 
 		 243 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0180989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0256  DTW domain-containing protein  28.23 
 
 		 197 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  29.84 
 
 		 223 aa  83.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3749  DTW domain-containing protein  32.47 
 
 		 188 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1520  hypothetical protein  30.58 
 
 		 237 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0474866  normal  0.0473662 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3586  DTW domain-containing protein  30.89 
 
 		 200 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01424  hypothetical protein  34.64 
 
 		 171 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4292  DTW domain-containing protein  27.41 
 
 		 196 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.616546  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0889  DTW domain-containing protein  31.79 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2062  hypothetical protein  29.21 
 
 		 238 aa  79.3  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  31.44 
 
 		 188 aa  79  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  33.33 
 
 		 247 aa  78.6  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2572  hypothetical protein  31.37 
 
 		 243 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  31.76 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  30.29 
 
 		 239 aa  77.4  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_93924  predicted protein  33.47 
 
 		 252 aa  77  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0426424 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  31.76 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  31.76 
 
 		 232 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2845  DTW domain containing protein  29.61 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  31.76 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2149  DTW domain-containing protein  32.43 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  31.65 
 
 		 236 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02441  hypothetical protein  31.76 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0900  DTW domain-containing protein  32.53 
 
 		 281 aa  75.9  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  31.18 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  31.18 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  31.18 
 
 		 232 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1535  hypothetical protein  32.72 
 
 		 238 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  27.75 
 
 		 247 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  30.43 
 
 		 232 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0676  hypothetical protein  32.53 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390701  unclonable  0.0000000107509 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3314  hypothetical protein  34.44 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  31.54 
 
 		 201 aa  72.4  0.000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38500  hypothetical protein  33.54 
 
 		 232 aa  72  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2899  DTW  28.64 
 
 		 243 aa  71.6  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.124472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2330  DTW domain-containing protein  27.67 
 
 		 249 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000604871  normal  0.102486 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  31.58 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  27.22 
 
 		 252 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  30 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2760  DTW domain protein  31.03 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00353783  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2866  DTW domain-containing protein  31.03 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.186752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2862  DTW domain protein  31.03 
 
 		 226 aa  69.3  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.277232  normal  0.735331 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2978  hypothetical protein  31.03 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0338202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0091  DTW domain-containing protein  35.2 
 
 		 215 aa  68.9  0.00000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4270  DTW domain-containing protein  32.26 
 
 		 181 aa  69.3  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0317  DTW domain-containing protein  31.69 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  26.01 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  26.01 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  26.01 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3935  hypothetical protein  30.1 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  26.01 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3314  DTW domain containing protein  30.53 
 
 		 248 aa  67  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  26.09 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  25 
 
 		 245 aa  67  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1181  DTW  29.3 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.197243 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17650  hypothetical protein  30.86 
 
 		 238 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0853  DTW domain containing protein  29.88 
 
 		 238 aa  67  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04079  DTW domain containing protein  28.48 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  26.59 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  27.4 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1382  DTW  30.38 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1565  DTW domain-containing protein  33.1 
 
 		 167 aa  65.1  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  26.62 
 
 		 249 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  28.03 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  28.32 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  26.59 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  26.62 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  26.62 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  26.59 
 
 		 254 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>