144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0299 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  100 
 
 		 203 aa  423  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  53.92 
 
 		 207 aa  236  1e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  52.74 
 
 		 207 aa  228  5e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  51.74 
 
 		 207 aa  224  7e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3586  DTW domain-containing protein  50.51 
 
 		 200 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  50 
 
 		 201 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  51.27 
 
 		 197 aa  216  1e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  51.02 
 
 		 223 aa  216  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0256  DTW domain-containing protein  48.98 
 
 		 197 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  47.5 
 
 		 200 aa  204  7e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0255  DTW domain-containing protein  53.53 
 
 		 174 aa  201  4e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  49.19 
 
 		 188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3493  hypothetical protein  52.22 
 
 		 205 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3749  DTW domain-containing protein  47.59 
 
 		 188 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  47.03 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4270  DTW domain-containing protein  53.45 
 
 		 181 aa  195  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4292  DTW domain-containing protein  42.08 
 
 		 196 aa  159  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.616546  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1565  hypothetical protein  40.1 
 
 		 200 aa  145  3e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0932097  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004037  hypothetical protein  35.5 
 
 		 204 aa  132  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0317  DTW domain-containing protein  35.08 
 
 		 211 aa  127  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  34.83 
 
 		 199 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  35.98 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  35.32 
 
 		 213 aa  121  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  34.5 
 
 		 199 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  34.65 
 
 		 199 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0945  DTW domain-containing protein  35 
 
 		 215 aa  118  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0983717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04079  DTW domain containing protein  36.59 
 
 		 194 aa  118  7e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  34.92 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  34.83 
 
 		 199 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  34.33 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  34.33 
 
 		 199 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0889  DTW domain-containing protein  32.84 
 
 		 208 aa  114  7.999999999999999e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3314  hypothetical protein  35.87 
 
 		 201 aa  108  5e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0676  hypothetical protein  35.39 
 
 		 183 aa  107  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390701  unclonable  0.0000000107509 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3914  hypothetical protein  35.05 
 
 		 203 aa  105  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46020  hypothetical protein  34.9 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.637513  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0863  DTW  35.23 
 
 		 198 aa  102  5e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2149  DTW domain-containing protein  31.63 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1957  DTW domain-containing protein  33.18 
 
 		 227 aa  99.4  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1758  DTW domain containing protein  33.88 
 
 		 227 aa  97.1  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.370644  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01424  hypothetical protein  34.15 
 
 		 171 aa  94.7  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  31.58 
 
 		 241 aa  92.4  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1830  DTW domain-containing protein  32.66 
 
 		 212 aa  90.1  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0091  DTW domain-containing protein  32.82 
 
 		 215 aa  89  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2058  DTW  30.11 
 
 		 203 aa  85.1  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1899  DTW domain containing protein  30.27 
 
 		 203 aa  84.7  8e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1820  DTW domain containing protein  30.27 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3935  hypothetical protein  29.58 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2561  DTW  27.92 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0180989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2572  hypothetical protein  27.92 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1520  hypothetical protein  28.1 
 
 		 237 aa  76.3  0.0000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0474866  normal  0.0473662 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2829  DTW domain-containing protein  30.06 
 
 		 200 aa  75.5  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  28.57 
 
 		 247 aa  74.7  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2899  DTW  28.43 
 
 		 243 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.124472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  29.94 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1739  DTW domain-containing protein  30.98 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.438659 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1391  hypothetical protein  26.96 
 
 		 247 aa  73.6  0.000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2845  DTW domain containing protein  27.8 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  28.95 
 
 		 245 aa  72.4  0.000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2062  hypothetical protein  25 
 
 		 238 aa  72  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  23.74 
 
 		 251 aa  71.2  0.000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  23.74 
 
 		 254 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002117  hypothetical protein  25.41 
 
 		 201 aa  70.5  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  23.23 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  23.44 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2540  DTW domain-containing protein  22.93 
 
 		 236 aa  69.3  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.565238 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2401  DTW domain-containing protein  28.95 
 
 		 205 aa  69.7  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663769  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  23.68 
 
 		 247 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3464  DTW domain-containing protein  30.06 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0992214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3342  DTW domain-containing protein  30.06 
 
 		 228 aa  68.9  0.00000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.342433  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1429  hypothetical protein  27.5 
 
 		 201 aa  68.9  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.57306  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3205  DTW domain-containing protein  30.06 
 
 		 249 aa  68.9  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  23.23 
 
 		 254 aa  68.6  0.00000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  25.81 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  25.13 
 
 		 245 aa  67.8  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  25.93 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  22.39 
 
 		 256 aa  67  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2518  DTW domain containing protein  27.5 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  22.73 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  27.61 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  22.73 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  24.08 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2431  DTW domain containing protein  27.5 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109423  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  22.73 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  22.73 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2086  DTW domain-containing protein  23.23 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  24.03 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  24.03 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  24.03 
 
 		 232 aa  65.5  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4025  DTW domain-containing protein  29.27 
 
 		 236 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000137951 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  23.38 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4029  hypothetical protein  28.41 
 
 		 236 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.309235  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  23.38 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003511  putative cytoplasmic protein  23.67 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  25.15 
 
 		 237 aa  64.3  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  23.38 
 
 		 232 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  25 
 
 		 234 aa  63.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  23.38 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  23.38 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2330  DTW domain-containing protein  23.57 
 
 		 249 aa  63.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000604871  normal  0.102486 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>