141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0255 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_0255  DTW domain-containing protein  100 
 
 		 174 aa  358  3e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.614012 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0256  DTW domain-containing protein  75.86 
 
 		 197 aa  271  5.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3954  DTW domain-containing protein  72.99 
 
 		 223 aa  255  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3947  DTW domain-containing protein  62.64 
 
 		 200 aa  221  4e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3822  DTW domain-containing protein  60.34 
 
 		 188 aa  217  5e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4270  DTW domain-containing protein  59.41 
 
 		 181 aa  215  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0664777 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3749  DTW domain-containing protein  59.77 
 
 		 188 aa  214  5e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4554  hypothetical protein  60 
 
 		 197 aa  213  8e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0198  DTW domain-containing protein  58.82 
 
 		 207 aa  213  9e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4137  DTW domain-containing protein  58.82 
 
 		 207 aa  211  2.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0326  DTW domain-containing protein  58.24 
 
 		 201 aa  210  9e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0198  DTW domain containing protein  57.65 
 
 		 207 aa  209  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0299  DTW domain-containing protein  53.53 
 
 		 203 aa  201  3e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3586  DTW domain-containing protein  55.43 
 
 		 200 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3493  hypothetical protein  43.14 
 
 		 205 aa  166  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3447  hypothetical protein  50 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4292  DTW domain-containing protein  44.51 
 
 		 196 aa  130  6.999999999999999e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.616546  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0317  DTW domain-containing protein  40.12 
 
 		 211 aa  117  6e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1565  hypothetical protein  34.48 
 
 		 200 aa  114  6.9999999999999995e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0932097  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3664  DTW  39.02 
 
 		 199 aa  107  9.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0140034  normal  0.15667 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004037  hypothetical protein  35.84 
 
 		 204 aa  105  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.152409  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04079  DTW domain containing protein  34.46 
 
 		 194 aa  103  9e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4026  DTW domain-containing protein  37.13 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.169478  normal  0.0883291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1459  DTW  37.65 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1801  DTW domain-containing protein  37.65 
 
 		 197 aa  101  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.26433  normal  0.410877 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1728  hypothetical protein  37.5 
 
 		 199 aa  101  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0343203  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1391  DTW domain-containing protein  36.97 
 
 		 199 aa  99  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4520  DTW domain containing protein  36.36 
 
 		 199 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.108637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0889  DTW domain-containing protein  33.53 
 
 		 208 aa  96.3  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.458899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3812  DTW domain-containing protein  33.53 
 
 		 199 aa  92  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00599656 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0945  DTW domain-containing protein  37.79 
 
 		 215 aa  89.4  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0983717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01424  hypothetical protein  33.54 
 
 		 171 aa  89  3e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32830  DTW domain protein  33.14 
 
 		 213 aa  88.2  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0863  DTW  36.36 
 
 		 198 aa  87.8  8e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0676  hypothetical protein  36.02 
 
 		 183 aa  86.3  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0390701  unclonable  0.0000000107509 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3914  hypothetical protein  37.2 
 
 		 203 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.249648  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46020  hypothetical protein  35.98 
 
 		 203 aa  84.7  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.637513  normal  0.748876 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1830  DTW domain-containing protein  34.86 
 
 		 212 aa  81.6  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3314  hypothetical protein  36.02 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1758  DTW domain containing protein  32.77 
 
 		 227 aa  75.1  0.0000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.370644  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1957  DTW domain-containing protein  33.71 
 
 		 227 aa  74.3  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0091  DTW domain-containing protein  36.59 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00346625 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2038  DTW domain-containing protein  30.41 
 
 		 254 aa  70.9  0.000000000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111033  normal  0.127939 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2829  DTW domain-containing protein  31.95 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.106705 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3747  DTW domain-containing protein  32 
 
 		 234 aa  70.5  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0410798  normal  0.151422 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1938  DTW domain-containing protein  30.41 
 
 		 254 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0458969  hitchhiker  0.000543761 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2387  hypothetical protein  30 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1991  DTW domain-containing protein  29.82 
 
 		 254 aa  67.8  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.801996  hitchhiker  0.00115033 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2087  DTW domain-containing protein  29.41 
 
 		 254 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2028  DTW domain-containing protein  29.41 
 
 		 256 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2080  DTW domain containing protein  29.41 
 
 		 254 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0268812  hitchhiker  0.0000673484 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2265  DTW domain-containing protein  29.41 
 
 		 254 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2382  DTW domain-containing protein  29.41 
 
 		 254 aa  67.4  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.375493  normal  0.0103216 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1966  DTW domain-containing protein  32.26 
 
 		 249 aa  66.2  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2286  DTW domain-containing protein  27.54 
 
 		 247 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000384037 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2890  DTW  30.99 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1922  DTW domain-containing protein  26.86 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.773776  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2149  DTW domain-containing protein  29.88 
 
 		 243 aa  64.7  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2388  hypothetical protein  29.37 
 
 		 198 aa  64.7  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2561  DTW  31 
 
 		 243 aa  64.3  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0180989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2845  DTW domain containing protein  31.25 
 
 		 243 aa  64.3  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2921  hypothetical protein  27.54 
 
 		 245 aa  64.3  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2572  hypothetical protein  30.73 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.328993  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1899  DTW domain containing protein  26.83 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.369938  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1820  DTW domain containing protein  26.83 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2058  DTW  25.61 
 
 		 203 aa  62  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.382489  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1748  hypothetical protein  25.75 
 
 		 252 aa  62  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00914575 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2954  hypothetical protein  27.08 
 
 		 195 aa  62  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3397  DTW domain-containing protein  25.85 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2086  DTW domain-containing protein  27.81 
 
 		 253 aa  61.2  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3336  DTW domain containing protein  33.87 
 
 		 249 aa  61.2  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1780  hypothetical protein  28.96 
 
 		 290 aa  60.8  0.000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3739  DTW domain-containing protein  31.13 
 
 		 241 aa  60.1  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0810655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2540  DTW domain-containing protein  23.81 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.565238 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1520  hypothetical protein  31.07 
 
 		 237 aa  57.8  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0474866  normal  0.0473662 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1085  DTW domain containing protein  25.53 
 
 		 232 aa  57.4  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.202356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2740  DTW domain-containing protein  25.53 
 
 		 232 aa  57.4  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.209586  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1094  DTW domain-containing protein  25.53 
 
 		 232 aa  57.4  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.158379  normal  0.0446057 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2062  hypothetical protein  29.41 
 
 		 238 aa  57.4  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2953  DTW domain protein  25.53 
 
 		 232 aa  57  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0352183  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_93924  predicted protein  27.91 
 
 		 252 aa  57  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0426424 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3820  DTW domain protein  25.53 
 
 		 232 aa  57  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00329477  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2870  DTW domain-containing protein  25.53 
 
 		 232 aa  57  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.308845  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02477  hypothetical protein  26.39 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0886  DTW domain containing protein  29.08 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0581756  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02441  hypothetical protein  26.39 
 
 		 232 aa  56.6  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003511  putative cytoplasmic protein  27.33 
 
 		 264 aa  56.2  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1391  hypothetical protein  25.75 
 
 		 247 aa  55.8  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.046419  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2899  DTW  29.71 
 
 		 243 aa  55.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.124472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2736  DTW domain-containing protein  26.21 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00625703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0853  DTW domain containing protein  28.23 
 
 		 238 aa  54.7  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1139  hypothetical protein  29.66 
 
 		 245 aa  54.7  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.248975  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1739  DTW domain-containing protein  29.19 
 
 		 204 aa  54.3  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.438659 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2844  DTW domain protein  24.82 
 
 		 226 aa  54.3  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1289  DTW domain-containing protein  28.97 
 
 		 244 aa  54.3  0.0000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4284  DTW domain-containing protein  38.98 
 
 		 241 aa  53.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3492  DTW domain containing protein  31.45 
 
 		 244 aa  53.9  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3935  hypothetical protein  28.74 
 
 		 246 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17650  hypothetical protein  31.03 
 
 		 238 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2330  DTW domain-containing protein  26.32 
 
 		 249 aa  53.5  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000604871  normal  0.102486 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>